MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Erwinia sp. Ejp617 plasmid pJE02

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017446	ATC	2	6	65	70	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385785435
2	NC_017446	CGG	2	6	94	99	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785435
3	NC_017446	TCA	2	6	147	152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385785435
4	NC_017446	TGG	2	6	164	169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785435
5	NC_017446	CAA	2	6	250	255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385785435
6	NC_017446	GCG	2	6	307	312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785435
7	NC_017446	TGA	2	6	359	364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785435
8	NC_017446	GGT	2	6	399	404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785435
9	NC_017446	GAA	2	6	434	439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385785435
10	NC_017446	ACC	2	6	728	733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385785435
11	NC_017446	CAG	2	6	816	821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785435
12	NC_017446	TGC	2	6	832	837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785435
13	NC_017446	GTA	2	6	838	843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785435
14	NC_017446	GGC	2	6	903	908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785435
15	NC_017446	CAC	2	6	1013	1018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_017446	CAA	2	6	1079	1084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017446	ACA	2	6	1098	1103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017446	TCA	2	6	1104	1109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017446	AAG	2	6	1240	1245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017446	TGA	2	6	1324	1329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017446	GAC	2	6	1503	1508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785436
22	NC_017446	AGT	2	6	1614	1619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785436
23	NC_017446	CTG	2	6	1621	1626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785436
24	NC_017446	GCT	2	6	1629	1634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785436
25	NC_017446	CAG	2	6	1645	1650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785436
26	NC_017446	CTG	2	6	1870	1875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785436
27	NC_017446	CCA	2	6	1882	1887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385785436
28	NC_017446	CAG	2	6	1912	1917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785436
29	NC_017446	GCA	2	6	1962	1967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785436
30	NC_017446	GGC	2	6	2023	2028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785436
31	NC_017446	CTG	3	9	2116	2124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785436
32	NC_017446	TGC	2	6	2358	2363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785436
33	NC_017446	CCG	2	6	2399	2404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785436
34	NC_017446	CAG	2	6	2519	2524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785436
35	NC_017446	GCC	2	6	2557	2562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785436
36	NC_017446	TCC	2	6	2748	2753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385785436
37	NC_017446	CAG	2	6	2801	2806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785436
38	NC_017446	GCC	3	9	2825	2833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785436
39	NC_017446	ATC	2	6	2859	2864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385785436
40	NC_017446	GTT	2	6	3000	3005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385785437
41	NC_017446	AGC	2	6	3028	3033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785437
42	NC_017446	CAG	2	6	3132	3137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785437
43	NC_017446	TGC	2	6	3179	3184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785437
44	NC_017446	TGC	2	6	3198	3203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785437
45	NC_017446	CGG	2	6	3358	3363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017446	CCT	2	6	3452	3457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385785438
47	NC_017446	GCG	2	6	3492	3497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785438
48	NC_017446	GGC	2	6	3639	3644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785438
49	NC_017446	ATC	2	6	3667	3672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385785438
50	NC_017446	GCA	2	6	3912	3917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017446	ACC	2	6	4072	4077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_017446	AAG	2	6	4137	4142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017446	CGG	2	6	4519	4524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785439
54	NC_017446	CGA	2	6	4579	4584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785439
55	NC_017446	ATG	2	6	4602	4607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785439
56	NC_017446	CGG	2	6	4988	4993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785439
57	NC_017446	AGC	2	6	5008	5013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785439
58	NC_017446	GCG	2	6	5113	5118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785440
59	NC_017446	CCG	2	6	5147	5152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785440
60	NC_017446	GGA	2	6	5182	5187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385785440

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.