MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Erwinia sp. Ejp617 plasmid pJE03

Total Repeats: 139

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017443	GAT	2	6	9	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017443	CTG	2	6	22	27	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017443	CGG	2	6	77	82	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785442
4	NC_017443	ATT	2	6	97	102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385785442
5	NC_017443	TGC	3	9	122	130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785442
6	NC_017443	ATG	2	6	131	136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785442
7	NC_017443	GGA	2	6	186	191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385785442
8	NC_017443	CGT	2	6	229	234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785442
9	NC_017443	GCC	2	6	322	327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785443
10	NC_017443	GCA	2	6	351	356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785443
11	NC_017443	ACC	2	6	397	402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385785443
12	NC_017443	TGG	2	6	621	626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017443	GGC	2	6	711	716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785444
14	NC_017443	TCT	2	6	728	733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385785444
15	NC_017443	ACG	2	6	752	757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785444
16	NC_017443	CCG	2	6	794	799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785444
17	NC_017443	CGG	2	6	861	866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785444
18	NC_017443	GAC	2	6	925	930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017443	ACG	2	6	992	997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017443	CGC	2	6	1071	1076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_017443	TGG	2	6	1151	1156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017443	CGT	2	6	1161	1166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017443	CCG	3	9	1193	1201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_017443	TGC	2	6	1241	1246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017443	CCG	2	6	1247	1252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_017443	CCG	2	6	1302	1307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785445
27	NC_017443	CGA	3	9	1323	1331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785445
28	NC_017443	CTC	2	6	1405	1410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385785445
29	NC_017443	GCC	2	6	1427	1432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785445
30	NC_017443	CTT	2	6	1440	1445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385785445
31	NC_017443	CGG	2	6	1452	1457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785445
32	NC_017443	CTG	2	6	1465	1470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785445
33	NC_017443	CAG	2	6	1482	1487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017443	CAG	2	6	1525	1530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017443	GCT	2	6	1545	1550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017443	GCC	2	6	1564	1569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_017443	CAG	2	6	1648	1653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785446
38	NC_017443	ACA	2	6	1697	1702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385785446
39	NC_017443	CGC	2	6	1707	1712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785446
40	NC_017443	TGC	2	6	1835	1840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785447
41	NC_017443	CCG	2	6	1855	1860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785447
42	NC_017443	CAC	2	6	1867	1872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385785447
43	NC_017443	GAA	2	6	1924	1929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385785447
44	NC_017443	GCT	2	6	2000	2005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785447
45	NC_017443	CTG	2	6	2008	2013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785447
46	NC_017443	CGC	2	6	2109	2114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_017443	GCC	2	6	2118	2123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_017443	GCC	2	6	2149	2154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785448
49	NC_017443	GCA	2	6	2190	2195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785448
50	NC_017443	ACT	2	6	2201	2206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385785448
51	NC_017443	CAG	2	6	2212	2217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785448
52	NC_017443	CTG	2	6	2236	2241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785448
53	NC_017443	CCG	2	6	2266	2271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785448
54	NC_017443	GCC	2	6	2345	2350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785448
55	NC_017443	GCC	2	6	2383	2388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785449
56	NC_017443	GGT	2	6	2394	2399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785449
57	NC_017443	GCC	2	6	2405	2410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785449
58	NC_017443	CGA	2	6	2421	2426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785449
59	NC_017443	GAT	2	6	2478	2483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785449
60	NC_017443	CTG	2	6	2548	2553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017443	GGT	2	6	2613	2618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017443	CGC	2	6	2633	2638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_017443	TGC	2	6	2669	2674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017443	CGA	2	6	2781	2786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785450
65	NC_017443	CTG	2	6	2866	2871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785450
66	NC_017443	GCA	2	6	2901	2906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785450
67	NC_017443	GCC	2	6	2945	2950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785450
68	NC_017443	GCT	3	9	2952	2960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785450
69	NC_017443	AGC	2	6	3017	3022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785450
70	NC_017443	GCC	2	6	3025	3030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785450
71	NC_017443	CGG	2	6	3063	3068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785450
72	NC_017443	CTG	2	6	3121	3126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785450
73	NC_017443	TGG	2	6	3152	3157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785450
74	NC_017443	CGC	2	6	3176	3181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785450
75	NC_017443	TGA	2	6	3185	3190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785450
76	NC_017443	CTG	2	6	3196	3201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017443	GCT	2	6	3220	3225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017443	CGA	2	6	3276	3281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017443	GCT	3	9	3294	3302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017443	CGA	3	9	3372	3380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785451
81	NC_017443	TAC	2	6	3613	3618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017443	CGG	3	9	3641	3649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017443	CGG	2	6	3792	3797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017443	GGA	2	6	3846	3851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385785452
85	NC_017443	ACC	2	6	3889	3894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385785452
86	NC_017443	CTG	2	6	3913	3918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785452
87	NC_017443	CTG	2	6	3985	3990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785453
88	NC_017443	GCA	2	6	3999	4004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785453
89	NC_017443	GGC	2	6	4042	4047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785453
90	NC_017443	CGC	2	6	4251	4256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785454
91	NC_017443	GCG	2	6	4288	4293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785454
92	NC_017443	ACC	2	6	4385	4390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_017443	CGG	2	6	4421	4426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785455
94	NC_017443	CCG	2	6	4476	4481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785455
95	NC_017443	GAC	2	6	4498	4503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785455
96	NC_017443	CAC	2	6	4532	4537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385785455
97	NC_017443	GCT	2	6	4578	4583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785455
98	NC_017443	CTT	2	6	4614	4619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385785455
99	NC_017443	CGG	2	6	4626	4631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785455
100	NC_017443	GCT	2	6	4638	4643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785455
101	NC_017443	GCC	2	6	4670	4675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785455
102	NC_017443	AGC	2	6	4676	4681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785455
103	NC_017443	GCC	2	6	4732	4737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785455
104	NC_017443	GCA	2	6	4752	4757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017443	GCC	2	6	4770	4775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_017443	GCT	3	9	4776	4784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017443	TGC	2	6	4817	4822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017443	CGG	2	6	4875	4880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017443	TGC	2	6	4884	4889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017443	TGA	2	6	4946	4951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017443	CTG	2	6	4972	4977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017443	GAC	2	6	4996	5001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017443	CGC	2	6	5004	5009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_017443	CTG	2	6	5011	5016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017443	GCG	3	9	5023	5031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785456
116	NC_017443	GGT	2	6	5040	5045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785456
117	NC_017443	ACG	2	6	5054	5059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785456
118	NC_017443	TGC	2	6	5060	5065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785456
119	NC_017443	GGT	2	6	5106	5111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785456
120	NC_017443	GAC	2	6	5152	5157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785456
121	NC_017443	GCT	2	6	5178	5183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017443	GCT	2	6	5232	5237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017443	CGC	2	6	5247	5252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_017443	CGC	2	6	5313	5318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_017443	CAG	2	6	5329	5334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017443	GAA	2	6	5335	5340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017443	GCC	2	6	5376	5381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_017443	TTC	2	6	5449	5454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385785457
129	NC_017443	GGT	2	6	5670	5675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785457
130	NC_017443	TGC	2	6	5687	5692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785457
131	NC_017443	GCC	2	6	5822	5827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785457
132	NC_017443	CGC	2	6	5880	5885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_017443	CTG	2	6	5908	5913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017443	CAC	2	6	5964	5969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_017443	CTG	2	6	5971	5976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017443	GAT	3	9	6019	6027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785458
137	NC_017443	GTG	2	6	6166	6171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785458
138	NC_017443	GCT	3	9	6189	6197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785458
139	NC_017443	GGC	2	6	6267	6272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.