MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Erwinia sp. Ejp617 plasmid pJE01

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017442	GATTT	2	10	1084	1093	20 %	60 %	20 %	0 %	385785385
2	NC_017442	CCACC	2	10	3341	3350	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
3	NC_017442	CAGGA	2	10	3629	3638	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017442	CAGCG	2	10	5745	5754	20 %	0 %	40 %	40 %	385785393
5	NC_017442	AGTTA	2	10	6580	6589	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017442	AATTA	2	10	6973	6982	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017442	TCCTG	2	10	7022	7031	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_017442	TGCTT	2	10	7258	7267	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017442	TGTCG	2	10	8003	8012	0 %	40 %	40 %	20 %	385785396
10	NC_017442	TCAGC	2	10	10352	10361	20 %	20 %	20 %	40 %	385785397
11	NC_017442	TCTGC	2	10	12648	12657	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_017442	TCCAG	2	10	13486	13495	20 %	20 %	20 %	40 %	385785399
13	NC_017442	GTTTT	2	10	17894	17903	0 %	80 %	20 %	0 %	385785402
14	NC_017442	CGACC	2	10	17983	17992	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
15	NC_017442	TTTTA	2	10	18306	18315	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017442	AAAAT	2	10	18316	18325	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017442	TGCCG	2	10	19589	19598	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_017442	GTTGA	2	10	22759	22768	20 %	40 %	40 %	0 %	385785410
19	NC_017442	CAGGC	2	10	22904	22913	20 %	0 %	40 %	40 %	385785411
20	NC_017442	GGCGC	2	10	23295	23304	0 %	0 %	60 %	40 %	385785411
21	NC_017442	TCCCT	2	10	24207	24216	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
22	NC_017442	CGGTT	2	10	24547	24556	0 %	40 %	40 %	20 %	385785412
23	NC_017442	CAACA	2	10	24952	24961	60 %	0 %	0 %	40 %	385785412
24	NC_017442	AAAAG	2	10	25728	25737	80 %	0 %	20 %	0 %	385785413
25	NC_017442	ATGGG	2	10	26112	26121	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017442	AAAGC	2	10	27490	27499	60 %	0 %	20 %	20 %	385785414

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.