MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Erwinia sp. Ejp617 plasmid pJE01

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017442	CAGC	2	8	50	57	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017442	CTTG	2	8	780	787	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017442	GTTT	2	8	2224	2231	0 %	75 %	25 %	0 %	385785388
4	NC_017442	ACTG	2	8	2655	2662	25 %	25 %	25 %	25 %	385785388
5	NC_017442	TATC	2	8	2866	2873	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017442	ATTA	2	8	2994	3001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017442	AGAA	2	8	3103	3110	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017442	ACAG	2	8	3369	3376	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017442	TAAC	2	8	3566	3573	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017442	CCAC	2	8	4106	4113	25 %	0 %	0 %	75 %	385785390
11	NC_017442	AATT	2	8	4687	4694	50 %	50 %	0 %	0 %	385785392
12	NC_017442	GAAA	2	8	5068	5075	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017442	TCAT	2	8	5123	5130	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017442	CATC	2	8	5301	5308	25 %	25 %	0 %	50 %	385785393
15	NC_017442	CGTA	2	8	5452	5459	25 %	25 %	25 %	25 %	385785393
16	NC_017442	TCGA	2	8	5705	5712	25 %	25 %	25 %	25 %	385785393
17	NC_017442	TACT	2	8	6519	6526	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017442	AGTC	2	8	6873	6880	25 %	25 %	25 %	25 %	385785395
19	NC_017442	ATCG	2	8	7137	7144	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017442	GCTG	2	8	7200	7207	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017442	AGCG	2	8	9065	9072	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017442	TCAA	2	8	9138	9145	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017442	GTCC	2	8	9782	9789	0 %	25 %	25 %	50 %	385785397
24	NC_017442	GCCA	2	8	9874	9881	25 %	0 %	25 %	50 %	385785397
25	NC_017442	TTTC	2	8	10642	10649	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017442	GACA	2	8	10817	10824	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017442	ACTA	2	8	12224	12231	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017442	TACC	2	8	13150	13157	25 %	25 %	0 %	50 %	385785399
29	NC_017442	AGGA	2	8	13428	13435	50 %	0 %	50 %	0 %	385785399
30	NC_017442	TGCG	2	8	13507	13514	0 %	25 %	50 %	25 %	385785399
31	NC_017442	TACC	2	8	13558	13565	25 %	25 %	0 %	50 %	385785399
32	NC_017442	TCAG	2	8	13896	13903	25 %	25 %	25 %	25 %	385785400
33	NC_017442	CCAG	2	8	13954	13961	25 %	0 %	25 %	50 %	385785400
34	NC_017442	CCCG	2	8	14011	14018	0 %	0 %	25 %	75 %	385785400
35	NC_017442	GCTG	2	8	15618	15625	0 %	25 %	50 %	25 %	385785401
36	NC_017442	TGGA	2	8	16261	16268	25 %	25 %	50 %	0 %	385785401
37	NC_017442	ACAG	2	8	16864	16871	50 %	0 %	25 %	25 %	385785402
38	NC_017442	TAAT	2	8	16900	16907	50 %	50 %	0 %	0 %	385785402
39	NC_017442	GCTG	2	8	17179	17186	0 %	25 %	50 %	25 %	385785402
40	NC_017442	GCTG	2	8	17284	17291	0 %	25 %	50 %	25 %	385785402
41	NC_017442	AAGC	2	8	18225	18232	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017442	TTTA	2	8	18352	18359	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017442	ATTT	2	8	19071	19078	25 %	75 %	0 %	0 %	385785403
44	NC_017442	CATC	2	8	19393	19400	25 %	25 %	0 %	50 %	385785404
45	NC_017442	TGCT	2	8	20590	20597	0 %	50 %	25 %	25 %	385785407
46	NC_017442	ATCG	2	8	21445	21452	25 %	25 %	25 %	25 %	385785408
47	NC_017442	CTGC	2	8	22494	22501	0 %	25 %	25 %	50 %	385785409
48	NC_017442	ATCG	2	8	22744	22751	25 %	25 %	25 %	25 %	385785410
49	NC_017442	CCCG	2	8	23636	23643	0 %	0 %	25 %	75 %	385785411
50	NC_017442	AAGT	2	8	24355	24362	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017442	TACG	2	8	24403	24410	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017442	TGAT	2	8	24588	24595	25 %	50 %	25 %	0 %	385785412
53	NC_017442	TGCC	2	8	25110	25117	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017442	TAAA	2	8	25308	25315	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017442	AGCA	2	8	25356	25363	50 %	0 %	25 %	25 %	385785413
56	NC_017442	TTGC	2	8	25710	25717	0 %	50 %	25 %	25 %	385785413
57	NC_017442	ACCA	2	8	26185	26192	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017442	GGTA	2	8	26585	26592	25 %	25 %	50 %	0 %	385785414
59	NC_017442	GCAG	2	8	26698	26705	25 %	0 %	50 %	25 %	385785414
60	NC_017442	TTCA	2	8	27288	27295	25 %	50 %	0 %	25 %	385785414
61	NC_017442	CCAC	2	8	27431	27438	25 %	0 %	0 %	75 %	385785414
62	NC_017442	CGAA	2	8	27888	27895	50 %	0 %	25 %	25 %	385785414
63	NC_017442	CAGC	2	8	28232	28239	25 %	0 %	25 %	50 %	385785414
64	NC_017442	ATTG	2	8	28644	28651	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017442	CTCC	2	8	29087	29094	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
66	NC_017442	AGGC	2	8	29900	29907	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.