MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Erwinia sp. Ejp617 plasmid pJE01

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017442	GTTT	2	8	2224	2231	0 %	75 %	25 %	0 %	385785388
2	NC_017442	ACTG	2	8	2655	2662	25 %	25 %	25 %	25 %	385785388
3	NC_017442	CCAC	2	8	4106	4113	25 %	0 %	0 %	75 %	385785390
4	NC_017442	AATT	2	8	4687	4694	50 %	50 %	0 %	0 %	385785392
5	NC_017442	CATC	2	8	5301	5308	25 %	25 %	0 %	50 %	385785393
6	NC_017442	CGTA	2	8	5452	5459	25 %	25 %	25 %	25 %	385785393
7	NC_017442	TCGA	2	8	5705	5712	25 %	25 %	25 %	25 %	385785393
8	NC_017442	AGTC	2	8	6873	6880	25 %	25 %	25 %	25 %	385785395
9	NC_017442	GTCC	2	8	9782	9789	0 %	25 %	25 %	50 %	385785397
10	NC_017442	GCCA	2	8	9874	9881	25 %	0 %	25 %	50 %	385785397
11	NC_017442	TACC	2	8	13150	13157	25 %	25 %	0 %	50 %	385785399
12	NC_017442	AGGA	2	8	13428	13435	50 %	0 %	50 %	0 %	385785399
13	NC_017442	TGCG	2	8	13507	13514	0 %	25 %	50 %	25 %	385785399
14	NC_017442	TACC	2	8	13558	13565	25 %	25 %	0 %	50 %	385785399
15	NC_017442	TCAG	2	8	13896	13903	25 %	25 %	25 %	25 %	385785400
16	NC_017442	CCAG	2	8	13954	13961	25 %	0 %	25 %	50 %	385785400
17	NC_017442	CCCG	2	8	14011	14018	0 %	0 %	25 %	75 %	385785400
18	NC_017442	GCTG	2	8	15618	15625	0 %	25 %	50 %	25 %	385785401
19	NC_017442	TGGA	2	8	16261	16268	25 %	25 %	50 %	0 %	385785401
20	NC_017442	ACAG	2	8	16864	16871	50 %	0 %	25 %	25 %	385785402
21	NC_017442	TAAT	2	8	16900	16907	50 %	50 %	0 %	0 %	385785402
22	NC_017442	GCTG	2	8	17179	17186	0 %	25 %	50 %	25 %	385785402
23	NC_017442	GCTG	2	8	17284	17291	0 %	25 %	50 %	25 %	385785402
24	NC_017442	ATTT	2	8	19071	19078	25 %	75 %	0 %	0 %	385785403
25	NC_017442	CATC	2	8	19393	19400	25 %	25 %	0 %	50 %	385785404
26	NC_017442	TGCT	2	8	20590	20597	0 %	50 %	25 %	25 %	385785407
27	NC_017442	ATCG	2	8	21445	21452	25 %	25 %	25 %	25 %	385785408
28	NC_017442	CTGC	2	8	22494	22501	0 %	25 %	25 %	50 %	385785409
29	NC_017442	ATCG	2	8	22744	22751	25 %	25 %	25 %	25 %	385785410
30	NC_017442	CCCG	2	8	23636	23643	0 %	0 %	25 %	75 %	385785411
31	NC_017442	TGAT	2	8	24588	24595	25 %	50 %	25 %	0 %	385785412
32	NC_017442	AGCA	2	8	25356	25363	50 %	0 %	25 %	25 %	385785413
33	NC_017442	TTGC	2	8	25710	25717	0 %	50 %	25 %	25 %	385785413
34	NC_017442	GGTA	2	8	26585	26592	25 %	25 %	50 %	0 %	385785414
35	NC_017442	GCAG	2	8	26698	26705	25 %	0 %	50 %	25 %	385785414
36	NC_017442	TTCA	2	8	27288	27295	25 %	50 %	0 %	25 %	385785414
37	NC_017442	CCAC	2	8	27431	27438	25 %	0 %	0 %	75 %	385785414
38	NC_017442	CGAA	2	8	27888	27895	50 %	0 %	25 %	25 %	385785414
39	NC_017442	CAGC	2	8	28232	28239	25 %	0 %	25 %	50 %	385785414

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.