MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Erwinia sp. Ejp617 plasmid pJE01

Total Repeats: 368

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017442	ACC	2	6	36	41	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017442	CAG	2	6	131	136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785383
3	NC_017442	GGC	2	6	227	232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785383
4	NC_017442	TGT	2	6	244	249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385785383
5	NC_017442	CTG	2	6	343	348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785383
6	NC_017442	CTC	2	6	522	527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385785384
7	NC_017442	AGA	2	6	591	596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385785384
8	NC_017442	TGC	2	6	617	622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785384
9	NC_017442	TGT	2	6	727	732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385785384
10	NC_017442	AGT	2	6	1022	1027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785385
11	NC_017442	TGC	2	6	1218	1223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785385
12	NC_017442	CAG	2	6	1227	1232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785385
13	NC_017442	GTC	2	6	1289	1294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785386
14	NC_017442	ACA	2	6	1295	1300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385785386
15	NC_017442	AAT	2	6	1315	1320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385785386
16	NC_017442	GAT	2	6	1494	1499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785387
17	NC_017442	GCA	3	9	1504	1512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785387
18	NC_017442	CAG	2	6	1697	1702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785387
19	NC_017442	ATG	2	6	1713	1718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785387
20	NC_017442	AAC	2	6	1806	1811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385785387
21	NC_017442	CAC	2	6	1941	1946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385785388
22	NC_017442	TGG	2	6	2045	2050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785388
23	NC_017442	TGC	2	6	2122	2127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785388
24	NC_017442	GCT	2	6	2252	2257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785388
25	NC_017442	ACA	2	6	2276	2281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385785388
26	NC_017442	TCC	2	6	2290	2295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385785388
27	NC_017442	CTC	2	6	2307	2312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385785388
28	NC_017442	CAC	2	6	2343	2348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385785388
29	NC_017442	CAG	2	6	2403	2408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785388
30	NC_017442	GGT	2	6	2427	2432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785388
31	NC_017442	GTT	2	6	2481	2486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385785388
32	NC_017442	GCT	2	6	2513	2518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785388
33	NC_017442	CCA	2	6	2570	2575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385785388
34	NC_017442	CGC	2	6	2732	2737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785388
35	NC_017442	CAC	2	6	2831	2836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_017442	AAT	2	6	2844	2849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017442	GCC	2	6	2912	2917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_017442	GCA	2	6	3189	3194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017442	CCG	2	6	3241	3246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_017442	TTC	2	6	3297	3302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017442	CGC	2	6	3393	3398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_017442	CAG	2	6	3453	3458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017442	AAC	2	6	3592	3597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017442	TCA	2	6	3643	3648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017442	TCA	2	6	3672	3677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385785389
46	NC_017442	ACG	2	6	3716	3721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785389
47	NC_017442	CAG	2	6	3733	3738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785389
48	NC_017442	ATC	2	6	3845	3850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017442	GCT	2	6	3908	3913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785390
50	NC_017442	TGG	2	6	3978	3983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785390
51	NC_017442	CTG	2	6	4087	4092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785390
52	NC_017442	ACA	2	6	4188	4193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385785390
53	NC_017442	GAA	2	6	4198	4203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385785390
54	NC_017442	CTG	2	6	4439	4444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017442	TTC	2	6	4514	4519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385785391
56	NC_017442	GAA	2	6	4632	4637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385785391
57	NC_017442	GAT	2	6	4903	4908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785392
58	NC_017442	CAA	2	6	4931	4936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017442	ATA	2	6	5106	5111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017442	GAT	2	6	5188	5193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017442	ATG	2	6	5391	5396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785393
62	NC_017442	CAT	2	6	5427	5432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385785393
63	NC_017442	AAG	2	6	5439	5444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385785393
64	NC_017442	TGC	2	6	5584	5589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785393
65	NC_017442	GCA	2	6	5936	5941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785394
66	NC_017442	CGA	2	6	5964	5969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785394
67	NC_017442	GCT	2	6	6127	6132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017442	CTT	2	6	6432	6437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017442	TTC	2	6	6487	6492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017442	CAT	2	6	6567	6572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017442	GAA	2	6	6614	6619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017442	CAT	2	6	6631	6636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017442	AAT	2	6	6657	6662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017442	TAT	2	6	6767	6772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385785395
75	NC_017442	GGA	2	6	6811	6816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385785395
76	NC_017442	AAT	2	6	6921	6926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385785395
77	NC_017442	TCA	2	6	7032	7037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017442	TGA	2	6	7086	7091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017442	ATG	2	6	7235	7240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017442	AAT	2	6	7285	7290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017442	AGT	2	6	7343	7348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785396
82	NC_017442	CCT	2	6	7361	7366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385785396
83	NC_017442	CAG	2	6	7433	7438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785396
84	NC_017442	CAG	2	6	7643	7648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785396
85	NC_017442	TGA	2	6	7649	7654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785396
86	NC_017442	ATT	2	6	8414	8419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017442	GGC	2	6	8430	8435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017442	AGT	2	6	8488	8493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017442	AAC	2	6	8500	8505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017442	GTT	2	6	8518	8523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017442	TTG	2	6	8584	8589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017442	GGC	2	6	8592	8597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017442	CTG	2	6	8721	8726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017442	GGT	2	6	8754	8759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017442	GAT	2	6	8760	8765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017442	CCA	2	6	8980	8985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_017442	CAG	2	6	9128	9133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017442	ATA	2	6	9307	9312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385785397
99	NC_017442	GCC	2	6	9329	9334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785397
100	NC_017442	GTC	2	6	9405	9410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785397
101	NC_017442	GTG	2	6	9478	9483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785397
102	NC_017442	GAA	2	6	9516	9521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385785397
103	NC_017442	GCC	2	6	9616	9621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785397
104	NC_017442	TCT	2	6	9622	9627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385785397
105	NC_017442	CCG	2	6	9655	9660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785397
106	NC_017442	CAT	2	6	9708	9713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385785397
107	NC_017442	AAT	2	6	9717	9722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385785397
108	NC_017442	CGA	2	6	10118	10123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785397
109	NC_017442	CAG	2	6	10272	10277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785397
110	NC_017442	GGT	2	6	10343	10348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785397
111	NC_017442	GTT	2	6	10497	10502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017442	TCT	2	6	10736	10741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017442	GTC	2	6	11009	11014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017442	CAG	2	6	11054	11059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017442	ATT	2	6	11175	11180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017442	TCT	2	6	11214	11219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017442	TTA	2	6	11265	11270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017442	GCC	2	6	11549	11554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_017442	TCA	2	6	11660	11665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385785398
120	NC_017442	CTG	2	6	11727	11732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785398
121	NC_017442	TCT	2	6	11795	11800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385785398
122	NC_017442	ACT	2	6	11852	11857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385785398
123	NC_017442	GGA	2	6	12267	12272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017442	ACG	2	6	12324	12329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017442	CCG	2	6	12376	12381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_017442	GAT	2	6	12411	12416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017442	ACA	2	6	12532	12537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017442	ATT	2	6	12664	12669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017442	TTA	2	6	12725	12730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017442	TTG	2	6	12783	12788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385785399
131	NC_017442	CAC	2	6	12826	12831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385785399
132	NC_017442	GCC	2	6	12854	12859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785399
133	NC_017442	CTT	2	6	12865	12870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385785399
134	NC_017442	ATA	2	6	12920	12925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385785399
135	NC_017442	TAA	2	6	12948	12953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385785399
136	NC_017442	TTG	2	6	13167	13172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385785399
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261	NC_017442	GTT	2	6	22796	22801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385785411
262	NC_017442	GAA	2	6	22832	22837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385785411
263	NC_017442	CGC	2	6	22977	22982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785411
264	NC_017442	CAG	2	6	22986	22991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785411
265	NC_017442	CAT	2	6	22995	23000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385785411
266	NC_017442	GCT	2	6	23019	23024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785411
267	NC_017442	CAT	2	6	23037	23042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385785411
268	NC_017442	CAT	2	6	23135	23140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385785411
269	NC_017442	AGC	2	6	23152	23157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785411
270	NC_017442	CGC	2	6	23162	23167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785411
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273	NC_017442	CCA	3	9	23450	23458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385785411
274	NC_017442	ACC	2	6	23495	23500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385785411
275	NC_017442	GCC	2	6	23574	23579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785411
276	NC_017442	GCA	2	6	23829	23834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
277	NC_017442	TCA	2	6	23849	23854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
278	NC_017442	GTT	2	6	24028	24033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
279	NC_017442	GCT	2	6	24053	24058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_017442	GAC	2	6	24255	24260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_017442	ATG	2	6	24285	24290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
282	NC_017442	GCG	2	6	24497	24502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785412
283	NC_017442	CTG	2	6	24680	24685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785412
284	NC_017442	CCG	2	6	24774	24779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785412
285	NC_017442	CTG	2	6	24800	24805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785412
286	NC_017442	GGC	2	6	24861	24866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785412
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288	NC_017442	TGC	2	6	25124	25129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_017442	TGT	2	6	25158	25163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
290	NC_017442	TAA	2	6	25183	25188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_017442	GAA	2	6	25322	25327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
292	NC_017442	CAA	2	6	25416	25421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385785413
293	NC_017442	ATA	2	6	25445	25450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385785413
294	NC_017442	CTT	2	6	25453	25458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385785413
295	NC_017442	TAC	2	6	25516	25521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385785413
296	NC_017442	GCC	2	6	25585	25590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785413
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300	NC_017442	CAG	3	9	25973	25981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785413
301	NC_017442	ACA	2	6	26123	26128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
302	NC_017442	TAA	2	6	26328	26333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
303	NC_017442	GAG	2	6	26381	26386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
304	NC_017442	TGA	2	6	26483	26488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785414
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.