MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Erwinia sp. Ejp617 plasmid pJE01

Total Repeats: 255

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017442	CAG	2	6	131	136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785383
2	NC_017442	GGC	2	6	227	232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785383
3	NC_017442	TGT	2	6	244	249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385785383
4	NC_017442	CTG	2	6	343	348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785383
5	NC_017442	CTC	2	6	522	527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385785384
6	NC_017442	AGA	2	6	591	596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385785384
7	NC_017442	TGC	2	6	617	622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785384
8	NC_017442	TGT	2	6	727	732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385785384
9	NC_017442	AGT	2	6	1022	1027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785385
10	NC_017442	TGC	2	6	1218	1223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785385
11	NC_017442	CAG	2	6	1227	1232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785385
12	NC_017442	GTC	2	6	1289	1294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785386
13	NC_017442	ACA	2	6	1295	1300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385785386
14	NC_017442	AAT	2	6	1315	1320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385785386
15	NC_017442	GAT	2	6	1494	1499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785387
16	NC_017442	GCA	3	9	1504	1512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785387
17	NC_017442	CAG	2	6	1697	1702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785387
18	NC_017442	ATG	2	6	1713	1718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785387
19	NC_017442	AAC	2	6	1806	1811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385785387
20	NC_017442	CAC	2	6	1941	1946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385785388
21	NC_017442	TGG	2	6	2045	2050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785388
22	NC_017442	TGC	2	6	2122	2127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785388
23	NC_017442	GCT	2	6	2252	2257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785388
24	NC_017442	ACA	2	6	2276	2281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385785388
25	NC_017442	TCC	2	6	2290	2295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385785388
26	NC_017442	CTC	2	6	2307	2312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385785388
27	NC_017442	CAC	2	6	2343	2348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385785388
28	NC_017442	CAG	2	6	2403	2408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785388
29	NC_017442	GGT	2	6	2427	2432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785388
30	NC_017442	GTT	2	6	2481	2486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385785388
31	NC_017442	GCT	2	6	2513	2518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785388
32	NC_017442	CCA	2	6	2570	2575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385785388
33	NC_017442	CGC	2	6	2732	2737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785388
34	NC_017442	TCA	2	6	3672	3677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385785389
35	NC_017442	ACG	2	6	3716	3721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785389
36	NC_017442	CAG	2	6	3733	3738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785389
37	NC_017442	GCT	2	6	3908	3913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785390
38	NC_017442	TGG	2	6	3978	3983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785390
39	NC_017442	CTG	2	6	4087	4092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785390
40	NC_017442	ACA	2	6	4188	4193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385785390
41	NC_017442	GAA	2	6	4198	4203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385785390
42	NC_017442	TTC	2	6	4514	4519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385785391
43	NC_017442	GAA	2	6	4632	4637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385785391
44	NC_017442	GAT	2	6	4903	4908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785392
45	NC_017442	ATG	2	6	5391	5396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785393
46	NC_017442	CAT	2	6	5427	5432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385785393
47	NC_017442	AAG	2	6	5439	5444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385785393
48	NC_017442	TGC	2	6	5584	5589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785393
49	NC_017442	GCA	2	6	5936	5941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785394
50	NC_017442	CGA	2	6	5964	5969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785394
51	NC_017442	TAT	2	6	6767	6772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385785395
52	NC_017442	GGA	2	6	6811	6816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385785395
53	NC_017442	AAT	2	6	6921	6926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385785395
54	NC_017442	AGT	2	6	7343	7348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785396
55	NC_017442	CCT	2	6	7361	7366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385785396
56	NC_017442	CAG	2	6	7433	7438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785396
57	NC_017442	CAG	2	6	7643	7648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785396
58	NC_017442	TGA	2	6	7649	7654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785396
59	NC_017442	ATA	2	6	9307	9312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385785397
60	NC_017442	GCC	2	6	9329	9334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785397
61	NC_017442	GTC	2	6	9405	9410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785397
62	NC_017442	GTG	2	6	9478	9483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785397
63	NC_017442	GAA	2	6	9516	9521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385785397
64	NC_017442	GCC	2	6	9616	9621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785397
65	NC_017442	TCT	2	6	9622	9627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385785397
66	NC_017442	CCG	2	6	9655	9660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785397
67	NC_017442	CAT	2	6	9708	9713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385785397
68	NC_017442	AAT	2	6	9717	9722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385785397
69	NC_017442	CGA	2	6	10118	10123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785397
70	NC_017442	CAG	2	6	10272	10277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785397
71	NC_017442	GGT	2	6	10343	10348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785397
72	NC_017442	TCA	2	6	11660	11665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385785398
73	NC_017442	CTG	2	6	11727	11732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785398
74	NC_017442	TCT	2	6	11795	11800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385785398
75	NC_017442	ACT	2	6	11852	11857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385785398
76	NC_017442	TTG	2	6	12783	12788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385785399
77	NC_017442	CAC	2	6	12826	12831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385785399
78	NC_017442	GCC	2	6	12854	12859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785399
79	NC_017442	CTT	2	6	12865	12870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385785399
80	NC_017442	ATA	2	6	12920	12925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385785399
81	NC_017442	TAA	2	6	12948	12953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385785399
82	NC_017442	TTG	2	6	13167	13172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385785399
83	NC_017442	TCA	2	6	13648	13653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385785399
84	NC_017442	CGG	2	6	14228	14233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785400
85	NC_017442	CAA	2	6	14314	14319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385785400
86	NC_017442	TTC	2	6	14621	14626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385785400
87	NC_017442	ATG	2	6	14887	14892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785401
88	NC_017442	TCT	2	6	14902	14907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385785401
89	NC_017442	GCT	2	6	15054	15059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785401
90	NC_017442	CAG	2	6	15085	15090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785401
91	NC_017442	GAT	2	6	15108	15113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785401
92	NC_017442	TGC	2	6	15317	15322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785401
93	NC_017442	GCG	2	6	15323	15328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785401
94	NC_017442	CTG	2	6	15340	15345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785401
95	NC_017442	TGC	2	6	15401	15406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785401
96	NC_017442	GGT	2	6	15450	15455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785401
97	NC_017442	TGC	2	6	15504	15509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785401
98	NC_017442	GCG	2	6	15541	15546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785401
99	NC_017442	TGC	2	6	15639	15644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785401
100	NC_017442	CAT	2	6	15708	15713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385785401
101	NC_017442	CTG	2	6	15886	15891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785401
102	NC_017442	CGG	2	6	15894	15899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785401
103	NC_017442	TAT	2	6	15925	15930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385785401
104	NC_017442	CGA	2	6	16017	16022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785401
105	NC_017442	CGG	2	6	16068	16073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785401
106	NC_017442	CGG	2	6	16131	16136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785401
107	NC_017442	TTA	2	6	16142	16147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385785401
108	NC_017442	CGG	2	6	16182	16187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785401
109	NC_017442	GAA	2	6	16191	16196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385785401
110	NC_017442	ATA	2	6	16269	16274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385785401
111	NC_017442	CGG	2	6	16600	16605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785402
112	NC_017442	GCG	4	12	16671	16682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785402
113	NC_017442	CCA	2	6	16690	16695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385785402
114	NC_017442	GCA	2	6	16779	16784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785402
115	NC_017442	CCA	2	6	16858	16863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385785402
116	NC_017442	GGC	2	6	16922	16927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785402
117	NC_017442	CGG	2	6	16960	16965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785402
118	NC_017442	CAA	2	6	16966	16971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385785402
119	NC_017442	CCG	2	6	17014	17019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785402
120	NC_017442	TGA	2	6	17068	17073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785402
121	NC_017442	TTC	2	6	17085	17090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385785402
122	NC_017442	TGG	2	6	17113	17118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785402
123	NC_017442	GTT	2	6	17230	17235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385785402
124	NC_017442	TGG	2	6	17239	17244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785402
125	NC_017442	CTG	2	6	17252	17257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785402
126	NC_017442	TTC	2	6	17273	17278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385785402
127	NC_017442	TGC	2	6	17347	17352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785402
128	NC_017442	TGC	2	6	17424	17429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785402
129	NC_017442	CCT	2	6	17457	17462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385785402
130	NC_017442	CCT	2	6	17476	17481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385785402
131	NC_017442	TGC	3	9	17483	17491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785402
132	NC_017442	CAA	2	6	17563	17568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385785402
133	NC_017442	AAT	2	6	17588	17593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385785402
134	NC_017442	GAT	2	6	17799	17804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785402
135	NC_017442	GAC	2	6	17820	17825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785402
136	NC_017442	ATC	2	6	17940	17945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385785402
137	NC_017442	GAT	2	6	18654	18659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785403
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141	NC_017442	TGA	2	6	19051	19056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785403
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158	NC_017442	CGG	2	6	20946	20951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785408
159	NC_017442	GAT	2	6	21093	21098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785408
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162	NC_017442	CCG	2	6	21326	21331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785408
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243	NC_017442	GTG	2	6	30172	30177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785415
244	NC_017442	TAA	2	6	30183	30188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385785415
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246	NC_017442	CGC	2	6	30210	30215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785415
247	NC_017442	CAC	2	6	30280	30285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385785415
248	NC_017442	TTG	2	6	30302	30307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385785415
249	NC_017442	GCC	2	6	30526	30531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785416
250	NC_017442	GAC	2	6	30543	30548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785416
251	NC_017442	ATT	2	6	30596	30601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385785416
252	NC_017442	AAG	2	6	30653	30658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385785416
253	NC_017442	CAG	2	6	30683	30688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785416
254	NC_017442	CAC	2	6	30762	30767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385785416
255	NC_017442	CGC	2	6	30803	30808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785416

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.