MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Erwinia sp. Ejp617 plasmid pJE01

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017442	GC	3	6	277	282	0 %	0 %	50 %	50 %	385785383
2	NC_017442	AC	3	6	411	416	50 %	0 %	0 %	50 %	385785383
3	NC_017442	CG	3	6	1794	1799	0 %	0 %	50 %	50 %	385785387
4	NC_017442	CA	3	6	1891	1896	50 %	0 %	0 %	50 %	385785387
5	NC_017442	AG	3	6	2635	2640	50 %	0 %	50 %	0 %	385785388
6	NC_017442	GT	3	6	4012	4017	0 %	50 %	50 %	0 %	385785390
7	NC_017442	CA	3	6	4152	4157	50 %	0 %	0 %	50 %	385785390
8	NC_017442	CT	3	6	4431	4436	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017442	AT	3	6	5114	5119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017442	TA	3	6	5762	5767	50 %	50 %	0 %	0 %	385785393
11	NC_017442	GA	3	6	6264	6269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017442	GA	3	6	6308	6313	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017442	CA	3	6	6557	6562	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017442	GA	3	6	6761	6766	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017442	GA	3	6	6989	6994	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017442	TG	3	6	7278	7283	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017442	CG	3	6	7940	7945	0 %	0 %	50 %	50 %	385785396
18	NC_017442	GC	3	6	8841	8846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017442	AG	3	6	8902	8907	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017442	AT	3	6	8921	8926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017442	GT	3	6	9540	9545	0 %	50 %	50 %	0 %	385785397
22	NC_017442	TC	3	6	10657	10662	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017442	CT	3	6	11218	11223	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017442	CA	3	6	12201	12206	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017442	TA	3	6	12230	12235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017442	TC	4	8	12553	12560	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017442	GC	3	6	14135	14140	0 %	0 %	50 %	50 %	385785400
28	NC_017442	GC	3	6	14242	14247	0 %	0 %	50 %	50 %	385785400
29	NC_017442	GC	3	6	14417	14422	0 %	0 %	50 %	50 %	385785400
30	NC_017442	GC	3	6	14608	14613	0 %	0 %	50 %	50 %	385785400
31	NC_017442	GC	3	6	14987	14992	0 %	0 %	50 %	50 %	385785401
32	NC_017442	GA	3	6	15093	15098	50 %	0 %	50 %	0 %	385785401
33	NC_017442	GC	3	6	15531	15536	0 %	0 %	50 %	50 %	385785401
34	NC_017442	CG	3	6	15788	15793	0 %	0 %	50 %	50 %	385785401
35	NC_017442	CG	3	6	16169	16174	0 %	0 %	50 %	50 %	385785401
36	NC_017442	GC	3	6	16336	16341	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017442	AT	3	6	16800	16805	50 %	50 %	0 %	0 %	385785402
38	NC_017442	AG	3	6	17664	17669	50 %	0 %	50 %	0 %	385785402
39	NC_017442	TA	3	6	19421	19426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017442	GC	3	6	19756	19761	0 %	0 %	50 %	50 %	385785405
41	NC_017442	CG	3	6	19862	19867	0 %	0 %	50 %	50 %	385785405
42	NC_017442	GC	4	8	21546	21553	0 %	0 %	50 %	50 %	385785408
43	NC_017442	GC	3	6	22128	22133	0 %	0 %	50 %	50 %	385785409
44	NC_017442	CG	3	6	23438	23443	0 %	0 %	50 %	50 %	385785411
45	NC_017442	GC	3	6	23540	23545	0 %	0 %	50 %	50 %	385785411
46	NC_017442	TC	3	6	23938	23943	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017442	CA	3	6	24814	24819	50 %	0 %	0 %	50 %	385785412
48	NC_017442	AT	3	6	25302	25307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017442	AT	3	6	25640	25645	50 %	50 %	0 %	0 %	385785413
50	NC_017442	TC	3	6	26363	26368	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017442	AC	3	6	26772	26777	50 %	0 %	0 %	50 %	385785414
52	NC_017442	CG	3	6	26825	26830	0 %	0 %	50 %	50 %	385785414
53	NC_017442	GC	3	6	27296	27301	0 %	0 %	50 %	50 %	385785414
54	NC_017442	GA	3	6	27389	27394	50 %	0 %	50 %	0 %	385785414
55	NC_017442	GC	3	6	28475	28480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.