MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis Sweden2

Total Repeats: 320

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017441	GAAGGA	2	12	1360	1371	50 %	0 %	50 %	0 %	386262358
2	NC_017441	TATGGA	2	12	1413	1424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386262358
3	NC_017441	AAAGCT	2	12	5541	5552	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386262362
4	NC_017441	CAAAAA	2	12	6852	6863	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017441	TAGCAA	2	12	11428	11439	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386262368
6	NC_017441	AAAGCT	2	12	11559	11570	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386262368
7	NC_017441	TAGTGA	2	12	12695	12706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017441	GTTCCT	2	12	19980	19991	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386262374
9	NC_017441	CTTTTT	2	12	22134	22145	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386262376
10	NC_017441	GTGAGG	2	12	26064	26075	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	386262377
11	NC_017441	GGATTT	2	12	36541	36552	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386262389
12	NC_017441	AATTAG	2	12	37962	37973	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386262390
13	NC_017441	TTCCTG	2	12	38261	38272	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386262390
14	NC_017441	TTTTGA	2	12	45568	45579	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386262397
15	NC_017441	TGAACG	2	12	52809	52820	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386262404
16	NC_017441	GTGATT	2	12	52828	52839	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386262404
17	NC_017441	AAAATT	2	12	54560	54571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017441	GATCTG	2	12	55467	55478	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386262406
19	NC_017441	GGTTCA	2	12	55604	55615	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386262406
20	NC_017441	AGTTGT	2	12	58145	58156	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386262408
21	NC_017441	TTGTTC	2	12	59065	59076	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386262408
22	NC_017441	TCCTAA	2	12	59875	59886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386262409
23	NC_017441	AAAAAT	2	12	61370	61381	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017441	GTTCTT	2	12	63789	63800	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386262411
25	NC_017441	CTATTT	2	12	72111	72122	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386262418
26	NC_017441	ACTCTT	2	12	73240	73251	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386262419
27	NC_017441	TTTCTG	2	12	73790	73801	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386262420
28	NC_017441	GATCAT	2	12	73920	73931	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386262420
29	NC_017441	TAGTAC	2	12	76914	76925	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386262421
30	NC_017441	ATCTAG	2	12	77093	77104	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017441	GGTTTA	2	12	80565	80576	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386262424
32	NC_017441	GTCTGT	2	12	83609	83620	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386262427
33	NC_017441	TTCTGA	2	12	89223	89234	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386262431
34	NC_017441	AAAAGA	2	12	94286	94297	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386262437
35	NC_017441	AGCTGT	2	12	96380	96391	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386262438
36	NC_017441	TCTTTT	2	12	97039	97050	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386262440
37	NC_017441	GGGGCT	2	12	97987	97998	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386262440
38	NC_017441	TTTGAG	2	12	100191	100202	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386262442
39	NC_017441	TCAGAA	2	12	106832	106843	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386262447
40	NC_017441	CATAAC	2	12	109876	109887	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386262450
41	NC_017441	TGTTCT	2	12	112640	112651	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386262452
42	NC_017441	ACTTCG	2	12	115924	115935	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386262454
43	NC_017441	TTTTAG	2	12	116359	116370	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017441	TTGCCA	2	12	119463	119474	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386262458
45	NC_017441	TAAAAA	2	12	120955	120966	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017441	TTGGTA	2	12	121003	121014	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386262460
47	NC_017441	AGGATC	2	12	121382	121393	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386262460
48	NC_017441	AAGGGT	2	12	123189	123200	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386262461
49	NC_017441	GGGTTT	2	12	124152	124163	0 %	50 %	50 %	0 %	386262462
50	NC_017441	TTGCAT	2	12	124434	124445	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386262462
51	NC_017441	AAGAGA	2	12	124803	124814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262462
52	NC_017441	TTAAAA	2	12	133740	133751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386262468
53	NC_017441	AGGTTG	2	12	134982	134993	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386262469
54	NC_017441	GAGTTA	2	12	140033	140044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386262477
55	NC_017441	TGGAAT	2	12	143461	143472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386262481
56	NC_017441	ATGGTT	2	12	143705	143716	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386262481
57	NC_017441	TGCTCT	2	12	145896	145907	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386262484
58	NC_017441	GAAAGG	2	12	149634	149645	50 %	0 %	50 %	0 %	386262486
59	NC_017441	GCTTTG	2	12	149877	149888	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386262486
60	NC_017441	TGTGCG	2	12	153999	154010	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386262489
61	NC_017441	CCTCAT	2	12	155297	155308	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386262490
62	NC_017441	TGGAGA	2	12	156755	156766	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386262492
63	NC_017441	CTCCAT	2	12	158125	158136	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386262493
64	NC_017441	TCCTTG	2	12	158721	158732	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386262494
65	NC_017441	AAGTTT	2	12	158806	158817	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386262494
66	NC_017441	AACAGC	2	12	161359	161370	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386262497
67	NC_017441	AAAAAG	2	12	173946	173957	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386262504
68	NC_017441	AGAAAA	2	12	182583	182594	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017441	ACTTCT	2	12	189684	189695	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386262516
70	NC_017441	ATTTGC	2	12	192377	192388	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386262517
71	NC_017441	AAACAT	2	12	193467	193478	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386262520
72	NC_017441	AGCAAC	2	12	193802	193813	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386262520
73	NC_017441	TATGAA	2	12	195396	195407	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017441	TCTGGA	2	12	200072	200083	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386262527
75	NC_017441	CTGGAT	2	12	215665	215676	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386262540
76	NC_017441	GAAATA	2	12	215988	215999	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386262540
77	NC_017441	TTTTAC	2	12	221681	221692	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017441	ACTCCA	2	12	223734	223745	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386262548
79	NC_017441	CTGCTT	2	12	223966	223977	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386262548
80	NC_017441	ATTGCT	2	12	227275	227286	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386262551
81	NC_017441	TCCTAG	2	12	227565	227576	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386262551
82	NC_017441	GCAACG	2	12	228053	228064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386262552
83	NC_017441	CTTAGC	2	12	230682	230693	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386262554
84	NC_017441	TTCCTT	2	12	237514	237525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386262559
85	NC_017441	TCTCCT	2	12	240395	240406	0 %	50 %	0 %	50 %	386262560
86	NC_017441	AAACCA	2	12	240970	240981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386262561
87	NC_017441	AACCCT	2	12	255394	255405	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017441	ATTTTT	2	12	256198	256209	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017441	CCTGCA	2	12	256359	256370	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386262580
90	NC_017441	ACCTTT	2	12	261554	261565	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386262585
91	NC_017441	TCATAA	2	12	269398	269409	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386262592
92	NC_017441	AAGTGT	2	12	270124	270135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386262592
93	NC_017441	AGGAGA	2	12	271297	271308	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017441	ATCTAA	2	12	273402	273413	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386262595
95	NC_017441	TGGAAT	2	12	275600	275611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386262597
96	NC_017441	GGAACA	2	12	279487	279498	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386262599
97	NC_017441	ATATTA	2	12	280195	280206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017441	CACGCG	2	12	281860	281871	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386262601
99	NC_017441	TTTCTT	2	12	282039	282050	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386262601
100	NC_017441	CTCCTA	2	12	286201	286212	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386262604
101	NC_017441	GCAATG	2	12	292320	292331	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386262610
102	NC_017441	CGACAT	2	12	292995	293006	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386262611
103	NC_017441	CCCTTA	2	12	294449	294460	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386262613
104	NC_017441	AAAATA	2	12	296547	296558	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386262615
105	NC_017441	ACCACT	2	12	298902	298913	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386262617
106	NC_017441	CATTGC	2	12	302148	302159	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386262620
107	NC_017441	CCAAAA	2	12	303327	303338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386262621
108	NC_017441	TCTTTT	2	12	305212	305223	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386262623
109	NC_017441	CAAGAC	2	12	306303	306314	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386262624
110	NC_017441	AGCTTA	2	12	307584	307595	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386262626
111	NC_017441	CAAAGA	2	12	312969	312980	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386262631
112	NC_017441	ATGGCT	2	12	313585	313596	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386262632
113	NC_017441	TACAAA	2	12	317775	317786	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386262635
114	NC_017441	TTAATT	2	12	319454	319465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386262637
115	NC_017441	AAAAAT	2	12	322547	322558	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017441	AAAACA	2	12	322939	322950	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386262639
117	NC_017441	AAAAAG	2	12	324365	324376	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017441	CAGAAC	2	12	344924	344935	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386262658
119	NC_017441	ATTCAA	2	12	349902	349913	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386262663
120	NC_017441	AGAATA	2	12	361859	361870	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017441	TTCTTA	2	12	361879	361890	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386262671
122	NC_017441	CAGCCT	2	12	373941	373952	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386262683
123	NC_017441	AGCTGA	2	12	373991	374002	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386262683
124	NC_017441	ATGCTA	2	12	377858	377869	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386262685
125	NC_017441	CAATAG	2	12	384464	384475	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386262688
126	NC_017441	ACTGAA	2	12	384605	384616	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386262688
127	NC_017441	CTGCAC	2	12	384798	384809	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386262688
128	NC_017441	TCCATA	2	12	395157	395168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386262697
129	NC_017441	TTAGGT	2	12	396515	396526	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386262699
130	NC_017441	AGGGAA	2	12	397841	397852	50 %	0 %	50 %	0 %	386262700
131	NC_017441	CTGAAG	2	12	398676	398687	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386262701
132	NC_017441	TAATCT	2	12	404093	404104	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386262704
133	NC_017441	GAACAA	2	12	404595	404606	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386262705
134	NC_017441	CTAAAG	2	12	404978	404989	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386262706
135	NC_017441	CCTTTC	2	12	406142	406153	0 %	50 %	0 %	50 %	386262707
136	NC_017441	TTTTAA	2	12	410006	410017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017441	ACATGC	2	12	415683	415694	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386262716
138	NC_017441	GGCTCT	2	12	416418	416429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386262717
139	NC_017441	ATCTTG	2	12	418012	418023	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386262718
140	NC_017441	CCCCCA	2	12	419347	419358	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	386262719
141	NC_017441	TTCCTC	2	12	423412	423423	0 %	50 %	0 %	50 %	386262723
142	NC_017441	CTCTAC	2	12	426660	426671	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386262725
143	NC_017441	ACATCA	2	12	427305	427316	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386262726
144	NC_017441	CGGAAT	2	12	427567	427578	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386262727
145	NC_017441	AGCTAA	2	12	431846	431857	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386262731
146	NC_017441	TTCTCC	2	12	443891	443902	0 %	50 %	0 %	50 %	386262742
147	NC_017441	ATGAAG	2	12	452938	452949	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386262750
148	NC_017441	TAACTC	2	12	453455	453466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386262750
149	NC_017441	ATCCGC	2	12	454380	454391	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386262750
150	NC_017441	CTGTAT	2	12	455730	455741	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386262751
151	NC_017441	CTAAAG	2	12	456798	456809	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386262751
152	NC_017441	CCAATA	2	12	461783	461794	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386262755
153	NC_017441	ATCGGC	2	12	467630	467641	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386262763
154	NC_017441	TATTGG	2	12	468223	468234	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386262763
155	NC_017441	AAATAC	2	12	478567	478578	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386262767
156	NC_017441	TCTTCA	2	12	481006	481017	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386262768
157	NC_017441	CTACAA	2	12	484811	484822	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386262768
158	NC_017441	CCAATC	2	12	489279	489290	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386262772
159	NC_017441	TTCTTT	2	12	493100	493111	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386262779
160	NC_017441	CTGAAG	2	12	496159	496170	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386262781
161	NC_017441	TGAGTA	2	12	496613	496624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386262781
162	NC_017441	AAACTG	2	12	500060	500071	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386262785
163	NC_017441	TAACTA	2	12	503583	503594	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
164	NC_017441	AAGAAA	2	12	503596	503607	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
165	NC_017441	GGTAAT	2	12	508401	508412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386262793
166	NC_017441	AGTTTT	2	12	509409	509420	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386262795
167	NC_017441	AGAATA	2	12	509574	509585	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
168	NC_017441	GGTTGT	2	12	511537	511548	0 %	50 %	50 %	0 %	386262797
169	NC_017441	AACTAA	2	12	515310	515321	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
170	NC_017441	TCTCTA	2	12	517396	517407	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386262803
171	NC_017441	TGAACT	2	12	517904	517915	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386262803
172	NC_017441	TAATTC	2	12	519234	519245	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386262804
173	NC_017441	ACTCCT	2	12	519503	519514	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386262804
174	NC_017441	GATGAA	2	12	520023	520034	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386262804
175	NC_017441	CAAAGC	2	12	524383	524394	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386262805
176	NC_017441	CAGGAA	2	12	527372	527383	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386262809
177	NC_017441	ACTGTA	2	12	532158	532169	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386262813
178	NC_017441	AGCCAC	2	12	532193	532204	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386262813
179	NC_017441	AATGTC	2	12	533370	533381	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386262813
180	NC_017441	CAAATC	2	12	535839	535850	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386262815
181	NC_017441	AGGGAA	2	12	540280	540291	50 %	0 %	50 %	0 %	386262820
182	NC_017441	AAAGAA	2	12	542136	542147	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386262823
183	NC_017441	CTTCCT	2	12	542785	542796	0 %	50 %	0 %	50 %	386262824
184	NC_017441	ACAAGA	2	12	544288	544299	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386262825
185	NC_017441	TAATTG	2	12	546334	546345	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386262828
186	NC_017441	TCCCTC	2	12	549200	549211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
187	NC_017441	ATTACA	2	12	551380	551391	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386262831
188	NC_017441	ATATAG	2	12	557337	557348	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386262836
189	NC_017441	GCATAG	2	12	560371	560382	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386262838
190	NC_017441	TTTCAA	2	12	561543	561554	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386262840
191	NC_017441	CAAAAA	2	12	561922	561933	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386262840
192	NC_017441	AGATCC	2	12	564753	564764	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386262843
193	NC_017441	AAAAAT	2	12	567172	567183	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_017441	TTTTGC	2	12	574040	574051	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386262851
195	NC_017441	TCATAT	2	12	578138	578149	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386262855
196	NC_017441	TGGAGA	2	12	579406	579417	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386262855
197	NC_017441	CTCCAT	2	12	579929	579940	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386262856
198	NC_017441	TTCAAA	2	12	586275	586286	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386262864
199	NC_017441	TTTGTT	2	12	587057	587068	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	386262866
200	NC_017441	TCTCCG	2	12	595768	595779	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386262883
201	NC_017441	CAGCCG	2	12	598134	598145	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386262886
202	NC_017441	CTGATA	2	12	601397	601408	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386262890
203	NC_017441	CTGCTC	2	12	601445	601456	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386262890
204	NC_017441	AGTCCA	2	12	603357	603368	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386262891
205	NC_017441	TAGGGG	2	12	606325	606336	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
206	NC_017441	CAAAGA	2	12	607139	607150	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386262896
207	NC_017441	CCAAAA	2	12	610646	610657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386262900
208	NC_017441	GGATGG	2	12	612418	612429	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	386262901
209	NC_017441	CGATAT	3	18	614746	614763	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386262902
210	NC_017441	TCTTTT	2	12	618310	618321	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
211	NC_017441	ACTGTA	2	12	620002	620013	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386262906
212	NC_017441	CACTCT	2	12	620318	620329	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386262906
213	NC_017441	CCTTAG	2	12	624104	624115	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386262911
214	NC_017441	AACCTC	2	12	632169	632180	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386262915
215	NC_017441	CTCTTT	2	12	639181	639192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386262924
216	NC_017441	ATATCC	2	12	639198	639209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386262924
217	NC_017441	TAAACA	2	12	639309	639320	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386262924
218	NC_017441	ATAAAC	2	12	643020	643031	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386262929
219	NC_017441	ATCTTG	2	12	643713	643724	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386262929
220	NC_017441	TTAAAT	2	12	646483	646494	50 %	50 %	0 %	0 %	386262931
221	NC_017441	TTATTT	2	12	649522	649533	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
222	NC_017441	GCTTCT	2	12	650875	650886	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386262935
223	NC_017441	TAGGAG	2	12	651842	651853	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386262935
224	NC_017441	CCAAGC	2	12	652722	652733	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386262936
225	NC_017441	CACAGG	2	12	653835	653846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386262937
226	NC_017441	AGAAAG	2	12	669985	669996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262947
227	NC_017441	AGCTGG	2	12	688028	688039	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386262963
228	NC_017441	GCATCA	2	12	689870	689881	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386262964
229	NC_017441	ATCAAT	2	12	694195	694206	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386262968
230	NC_017441	CCGCAA	2	12	699075	699086	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386262973
231	NC_017441	TGCTTG	2	12	701349	701360	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386262974
232	NC_017441	AAATGC	2	12	705032	705043	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386262975
233	NC_017441	GAAAGA	2	12	707150	707161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262976
234	NC_017441	TCTTGA	2	12	712261	712272	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386262979
235	NC_017441	TATCCA	2	12	722441	722452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386262989
236	NC_017441	GAGAGG	2	12	731068	731079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386262994
237	NC_017441	GCGATT	2	12	734011	734022	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386262995
238	NC_017441	TATTGA	2	12	738337	738348	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386262998
239	NC_017441	TGTGAT	2	12	746635	746646	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386263005
240	NC_017441	TATTTT	2	12	755468	755479	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
241	NC_017441	GGGAAG	2	12	759590	759601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386263018
242	NC_017441	GGAAGA	2	12	763256	763267	50 %	0 %	50 %	0 %	386263020
243	NC_017441	ATGCAA	2	12	765568	765579	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386263024
244	NC_017441	GAGAAA	2	12	765797	765808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263024
245	NC_017441	TATATT	2	12	771234	771245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263029
246	NC_017441	CAATTA	2	12	778893	778904	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386263036
247	NC_017441	TAGCTG	2	12	780011	780022	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386263037
248	NC_017441	ATGAAG	2	12	784658	784669	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386263038
249	NC_017441	ATTAGG	2	12	790442	790453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263043
250	NC_017441	TAAACC	2	12	791281	791292	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386263044
251	NC_017441	CCCTGA	2	12	793438	793449	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386263046
252	NC_017441	AGAATT	2	12	796360	796371	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386263049
253	NC_017441	AAGCTC	2	12	796599	796610	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386263049
254	NC_017441	TTTCTT	2	12	799465	799476	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386263051
255	NC_017441	AGAAAT	2	12	802655	802666	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386263054
256	NC_017441	GAAATT	2	12	804268	804279	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386263056
257	NC_017441	GCTGAG	2	12	804950	804961	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386263056
258	NC_017441	TTTTCT	2	12	805383	805394	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
259	NC_017441	TAGCCT	2	12	807897	807908	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386263057
260	NC_017441	ATTTTT	2	12	809162	809173	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_017441	AAGAGG	2	12	828338	828349	50 %	0 %	50 %	0 %	386263071
262	NC_017441	GAAAGG	2	12	833215	833226	50 %	0 %	50 %	0 %	386263076
263	NC_017441	AGCTTC	2	12	834669	834680	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386263077
264	NC_017441	ATTTTT	2	12	835641	835652	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_017441	ATCACA	2	12	838774	838785	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386263082
266	NC_017441	GATCCG	2	12	843383	843394	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386263086
267	NC_017441	TTATGC	2	12	850321	850332	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386263092
268	NC_017441	ATGGGG	2	12	853355	853366	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	386263095
269	NC_017441	AAAGAA	2	12	853834	853845	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386263095
270	NC_017441	GGCTAG	2	12	854217	854228	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386263095
271	NC_017441	GAGAAA	2	12	854264	854275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263095
272	NC_017441	TAAGGA	2	12	856605	856616	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
273	NC_017441	CCGGAG	2	12	857523	857534	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_017441	CTTCTA	2	12	861454	861465	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386263096
275	NC_017441	CTTTTT	2	12	862138	862149	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386263097
276	NC_017441	GACCTG	2	12	867099	867110	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386263101
277	NC_017441	CCTCTA	2	12	870674	870685	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
278	NC_017441	TAAGGA	2	12	878656	878667	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
279	NC_017441	CCGGAG	2	12	879574	879585	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_017441	TTTTCT	2	12	889956	889967	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386263112
281	NC_017441	CTGTTC	2	12	890269	890280	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386263112
282	NC_017441	GTTTTT	2	12	890923	890934	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	386263113
283	NC_017441	GTGTAT	2	12	891835	891846	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386263114
284	NC_017441	TATTGG	2	12	895908	895919	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386263118
285	NC_017441	CCAACG	2	12	898236	898247	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386263118
286	NC_017441	TCCAGA	2	12	900874	900885	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386263122
287	NC_017441	TTTTGG	2	12	906078	906089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263126
288	NC_017441	CAATTT	2	12	906745	906756	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386263128
289	NC_017441	ATCGCC	2	12	907016	907027	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386263128
290	NC_017441	GACGGC	2	12	921998	922009	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386263141
291	NC_017441	CTTCTC	2	12	922907	922918	0 %	50 %	0 %	50 %	386263143
292	NC_017441	AAACAA	2	12	923686	923697	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
293	NC_017441	GAGCAA	2	12	925509	925520	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386263147
294	NC_017441	ATAGGG	2	12	946268	946279	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
295	NC_017441	CGGAGG	2	12	946589	946600	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386263163
296	NC_017441	GGATTA	2	12	956503	956514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263170
297	NC_017441	GAAAAA	2	12	957049	957060	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386263170
298	NC_017441	TTAAAA	2	12	960937	960948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263174
299	NC_017441	GCTATT	2	12	968557	968568	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386263181
300	NC_017441	CAAATG	2	12	971090	971101	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386263182
301	NC_017441	GGCTGG	2	12	982201	982212	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386263190
302	NC_017441	ACAGGA	2	12	982313	982324	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386263190
303	NC_017441	TTAAGC	2	12	983362	983373	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386263191
304	NC_017441	CAGGGA	2	12	992334	992345	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386263199
305	NC_017441	CTCCAT	2	12	994858	994869	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386263200
306	NC_017441	TCAGTA	2	12	996046	996057	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386263201
307	NC_017441	CAGAAT	2	12	997319	997330	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386263204
308	NC_017441	TACTAG	2	12	997832	997843	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386263204
309	NC_017441	TAATGT	2	12	999210	999221	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386263207
310	NC_017441	AATTAA	2	12	1007558	1007569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263215
311	NC_017441	GCAATA	2	12	1008504	1008515	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386263215
312	NC_017441	CTTTAT	2	12	1011897	1011908	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386263217
313	NC_017441	AGCTGG	2	12	1012325	1012336	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386263217
314	NC_017441	TTGTAA	2	12	1015194	1015205	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386263220
315	NC_017441	GAAAAA	2	12	1029446	1029457	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386263228
316	NC_017441	TTTCTT	2	12	1030110	1030121	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386263229
317	NC_017441	GTAATA	2	12	1036449	1036460	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386263231
318	NC_017441	ACCATC	2	12	1037191	1037202	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386263231
319	NC_017441	ATTTTT	2	12	1039173	1039184	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
320	NC_017441	TAAAAT	2	12	1042796	1042807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.