MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis Sweden2

Total Repeats: 14089

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017441	AGG	2	6	18	23	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386262358
2	NC_017441	TAA	3	9	93	101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386262358
3	NC_017441	GTA	2	6	137	142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386262358
4	NC_017441	AGT	2	6	168	173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386262358
5	NC_017441	AAG	2	6	324	329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262358
6	NC_017441	CAA	2	6	338	343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386262358
7	NC_017441	AGT	2	6	364	369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386262358
8	NC_017441	GTG	2	6	380	385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386262358
9	NC_017441	CAG	2	6	416	421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386262358
10	NC_017441	GCC	2	6	604	609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386262358
11	NC_017441	TGC	2	6	663	668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386262358
12	NC_017441	ATT	2	6	675	680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386262358
13	NC_017441	CGA	2	6	697	702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386262358
14	NC_017441	TAT	2	6	839	844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386262358
15	NC_017441	GAA	2	6	886	891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262358
16	NC_017441	AGA	2	6	915	920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262358
17	NC_017441	AGA	2	6	969	974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262358
18	NC_017441	CAA	2	6	1042	1047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386262358
19	NC_017441	TTG	2	6	1185	1190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386262358
20	NC_017441	CTC	2	6	1214	1219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386262358
21	NC_017441	GAT	2	6	1276	1281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386262358
22	NC_017441	GAT	2	6	1330	1335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386262358
23	NC_017441	ATG	2	6	1393	1398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386262358
24	NC_017441	CCT	2	6	1552	1557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386262358
25	NC_017441	CTT	2	6	1613	1618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386262358
26	NC_017441	CAG	2	6	1678	1683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386262358
27	NC_017441	TGA	2	6	1739	1744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386262358
28	NC_017441	AAG	2	6	1820	1825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017441	TGG	2	6	1836	1841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017441	CTT	2	6	1843	1848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017441	ATG	2	6	1936	1941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386262359
32	NC_017441	GTG	2	6	1942	1947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386262359
33	NC_017441	TCC	2	6	1951	1956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386262359
34	NC_017441	AGC	2	6	1965	1970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386262359
35	NC_017441	ATG	2	6	1978	1983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386262359
36	NC_017441	AGC	2	6	1992	1997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386262359
37	NC_017441	AAG	2	6	2003	2008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262359
38	NC_017441	TAC	2	6	2041	2046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386262359
39	NC_017441	GCT	2	6	2051	2056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386262359
40	NC_017441	AAC	2	6	2149	2154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386262359
41	NC_017441	AGA	2	6	2161	2166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262359
42	NC_017441	TAA	2	6	2251	2256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017441	AGA	2	6	2417	2422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262360
44	NC_017441	ATC	2	6	2424	2429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386262360
45	NC_017441	TGC	2	6	2444	2449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386262360
46	NC_017441	CAT	2	6	2568	2573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386262360
47	NC_017441	AGA	2	6	2597	2602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262360
48	NC_017441	AAG	2	6	2626	2631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262360
49	NC_017441	GGA	2	6	2661	2666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386262360
50	NC_017441	ATC	2	6	2790	2795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386262361
51	NC_017441	ATA	2	6	2940	2945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386262361
52	NC_017441	AAC	2	6	2965	2970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386262361
53	NC_017441	GGT	2	6	3019	3024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386262361
54	NC_017441	AAT	2	6	3125	3130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386262361
55	NC_017441	TTC	2	6	3160	3165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386262361
56	NC_017441	GCA	2	6	3179	3184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386262361
57	NC_017441	GGA	2	6	3227	3232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386262361
58	NC_017441	CAG	2	6	3246	3251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386262361
59	NC_017441	GTT	2	6	3263	3268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386262361
60	NC_017441	GGT	2	6	3355	3360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386262361
61	NC_017441	AAG	2	6	3513	3518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262361
62	NC_017441	ATT	2	6	3575	3580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386262361
63	NC_017441	TTG	2	6	3627	3632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386262361
64	NC_017441	AAG	2	6	3738	3743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262361
65	NC_017441	AAG	2	6	3753	3758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262361
66	NC_017441	CAG	2	6	3795	3800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386262361
67	NC_017441	GCT	2	6	3866	3871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386262361
68	NC_017441	AAG	2	6	4032	4037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262361
69	NC_017441	CAG	2	6	4082	4087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386262361
70	NC_017441	GGA	2	6	4169	4174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386262361
71	NC_017441	AAT	2	6	4179	4184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386262361
72	NC_017441	ATT	2	6	4259	4264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386262362
73	NC_017441	TGA	2	6	4289	4294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386262362
74	NC_017441	GTA	2	6	4521	4526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386262362
75	NC_017441	AGA	2	6	4568	4573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262362
76	NC_017441	GAA	2	6	4752	4757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262362
77	NC_017441	CGT	2	6	4884	4889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386262362
78	NC_017441	GTT	2	6	4935	4940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386262362
79	NC_017441	TGA	2	6	5072	5077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386262362
80	NC_017441	TTG	2	6	5167	5172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386262362
81	NC_017441	TTC	2	6	5308	5313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386262362
82	NC_017441	TCT	2	6	5400	5405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386262362
83	NC_017441	AGA	2	6	5420	5425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262362
84	NC_017441	GTT	2	6	5447	5452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386262362
85	NC_017441	GGT	2	6	5495	5500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386262362
86	NC_017441	CTC	2	6	5599	5604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386262362
87	NC_017441	AGC	2	6	5630	5635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386262362
88	NC_017441	GCA	2	6	5655	5660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017441	AGA	2	6	5682	5687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017441	ATT	2	6	5749	5754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386262363
91	NC_017441	TCT	2	6	5767	5772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386262363
92	NC_017441	GCT	2	6	5813	5818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386262363
93	NC_017441	GAT	2	6	5848	5853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386262363
94	NC_017441	ACG	2	6	5886	5891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386262363
95	NC_017441	GAA	2	6	5910	5915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262363
96	NC_017441	AGA	3	9	5987	5995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262363
97	NC_017441	GCT	2	6	5996	6001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386262363
98	NC_017441	AGA	2	6	6005	6010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262363
99	NC_017441	TGG	2	6	6041	6046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386262363
100	NC_017441	AGA	3	9	6059	6067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262363
101	NC_017441	GGA	2	6	6068	6073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386262363
102	NC_017441	TCA	2	6	6253	6258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386262363
103	NC_017441	GGA	2	6	6290	6295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386262363
104	NC_017441	CTT	2	6	6350	6355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386262363
105	NC_017441	CTG	2	6	6356	6361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386262363
106	NC_017441	CAG	2	6	6511	6516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386262363
107	NC_017441	CTT	2	6	6962	6967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017441	AGG	2	6	7040	7045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386262364
109	NC_017441	GAA	2	6	7084	7089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262364
110	NC_017441	GCA	2	6	7348	7353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386262364
111	NC_017441	AAG	2	6	7389	7394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262364
112	NC_017441	TGC	2	6	7422	7427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386262364
113	NC_017441	TTA	2	6	7754	7759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017441	GAA	2	6	7803	7808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017441	ATG	2	6	7838	7843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017441	TCG	2	6	7915	7920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386262365
117	NC_017441	TCC	2	6	7958	7963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386262365
118	NC_017441	GTT	2	6	8066	8071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386262365
119	NC_017441	TTA	2	6	8436	8441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386262365
120	NC_017441	TTC	2	6	8759	8764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386262365
121	NC_017441	GAA	2	6	8903	8908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262366
122	NC_017441	ACC	2	6	9031	9036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386262366
123	NC_017441	CTT	2	6	9084	9089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386262366
124	NC_017441	GAG	2	6	9164	9169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386262366
125	NC_017441	ATA	2	6	9181	9186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386262366
126	NC_017441	AGG	2	6	9205	9210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386262366
127	NC_017441	GAA	2	6	9385	9390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262366
128	NC_017441	CAG	2	6	9401	9406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386262366
129	NC_017441	TGT	2	6	9472	9477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386262366
130	NC_017441	GAG	2	6	9487	9492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386262366
131	NC_017441	TAC	2	6	9555	9560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386262366
132	NC_017441	GTT	2	6	9659	9664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386262366
133	NC_017441	AAG	2	6	9683	9688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262366
134	NC_017441	GAG	2	6	9709	9714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386262366
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136	NC_017441	ATC	2	6	9792	9797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017441	GAA	2	6	9830	9835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017441	CCT	2	6	9931	9936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_017441	TTA	2	6	9997	10002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386262367
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166	NC_017441	CTT	2	6	11842	11847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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173	NC_017441	TAC	2	6	12495	12500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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175	NC_017441	TTC	2	6	12540	12545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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251	NC_017441	GAA	2	6	18964	18969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
252	NC_017441	AAT	3	9	19028	19036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_017441	TCT	2	6	19056	19061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
254	NC_017441	TGC	2	6	19184	19189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386262374
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259	NC_017441	GAA	2	6	19592	19597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262374
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