MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis Sweden2

Total Repeats: 1387

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017441	AAG	2	6	1820	1825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017441	TGG	2	6	1836	1841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017441	CTT	2	6	1843	1848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017441	TAA	2	6	2251	2256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017441	GCA	2	6	5655	5660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017441	AGA	2	6	5682	5687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017441	CTT	2	6	6962	6967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017441	TTA	2	6	7754	7759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017441	GAA	2	6	7803	7808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017441	ATG	2	6	7838	7843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017441	TTC	3	9	9776	9784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017441	ATC	2	6	9792	9797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017441	GAA	2	6	9830	9835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017441	CCT	2	6	9931	9936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_017441	TAG	2	6	11792	11797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017441	CTT	2	6	11842	11847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017441	TCA	2	6	11879	11884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017441	AAT	2	6	11929	11934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017441	AGG	2	6	12162	12167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017441	ATA	3	9	12172	12180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017441	TAT	2	6	12191	12196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017441	ACA	2	6	12202	12207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017441	TAC	2	6	12495	12500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017441	TCA	2	6	12502	12507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017441	TTC	2	6	12540	12545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017441	TTA	2	6	12556	12561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017441	AGA	2	6	12597	12602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017441	CAA	2	6	12899	12904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017441	ATC	2	6	12922	12927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017441	ATA	2	6	13063	13068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017441	ATT	2	6	13963	13968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017441	AAG	2	6	13980	13985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017441	TTA	2	6	14006	14011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017441	AAG	2	6	14040	14045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017441	AAC	2	6	14124	14129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017441	CTT	2	6	15547	15552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017441	GTT	2	6	18220	18225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017441	GAA	2	6	18964	18969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017441	AAT	3	9	19028	19036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017441	TCT	2	6	19056	19061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017441	CTT	3	9	20482	20490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017441	GAA	2	6	21007	21012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017441	CCT	2	6	21155	21160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_017441	GGA	2	6	21201	21206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017441	AGA	3	9	21241	21249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017441	TGG	2	6	21460	21465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017441	AAC	2	6	21499	21504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017441	AGC	2	6	21516	21521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017441	AGG	2	6	21605	21610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017441	TGA	2	6	21717	21722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017441	TCC	2	6	21834	21839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_017441	AAT	2	6	22010	22015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017441	TTA	2	6	25163	25168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017441	ACT	2	6	27117	27122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017441	TAA	2	6	28470	28475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017441	AGA	2	6	28582	28587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017441	CTG	2	6	33711	33716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017441	CTT	2	6	37068	37073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017441	TAA	2	6	39406	39411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017441	AAG	2	6	39447	39452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017441	CAT	2	6	40600	40605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017441	CTC	2	6	40724	40729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_017441	AAG	2	6	40809	40814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017441	AAG	2	6	42856	42861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017441	ATG	2	6	42966	42971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017441	GAG	2	6	42980	42985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017441	ACC	2	6	43123	43128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_017441	GAT	2	6	43264	43269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017441	AAG	2	6	43270	43275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017441	GGA	2	6	43322	43327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017441	TAA	2	6	43420	43425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017441	ACT	2	6	44652	44657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017441	AAG	2	6	46503	46508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017441	TAA	2	6	48576	48581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017441	TGT	2	6	48651	48656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017441	GTC	2	6	49329	49334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017441	AAG	2	6	49351	49356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017441	TAT	2	6	49380	49385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017441	AGA	2	6	50150	50155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017441	AAG	2	6	50212	50217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017441	TCT	2	6	50226	50231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017441	ACT	2	6	50267	50272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017441	AAT	2	6	50302	50307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017441	TGT	2	6	50324	50329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017441	GCC	2	6	50371	50376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_017441	ATT	2	6	50420	50425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017441	CAA	2	6	50439	50444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017441	TAA	2	6	51996	52001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017441	AGT	3	9	52064	52072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017441	GAT	2	6	52609	52614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017441	AAG	2	6	52687	52692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017441	AAT	2	6	52714	52719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017441	ATT	2	6	52726	52731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017441	CTT	2	6	57833	57838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017441	TCC	2	6	57893	57898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_017441	TAA	2	6	61248	61253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017441	AAG	2	6	61310	61315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017441	AGG	2	6	61318	61323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017441	ACA	2	6	69118	69123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017441	AGA	2	6	72313	72318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017441	CGT	2	6	72361	72366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017441	AAG	2	6	75154	75159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017441	ACT	2	6	75169	75174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017441	AGT	2	6	75205	75210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017441	CTT	2	6	77174	77179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017441	GAG	3	9	78934	78942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017441	AGG	2	6	78965	78970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017441	ACC	2	6	79016	79021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_017441	TTA	2	6	79667	79672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017441	CAT	2	6	79868	79873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017441	TAG	2	6	79884	79889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017441	TTC	2	6	79918	79923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017441	GTT	2	6	79936	79941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017441	GTT	2	6	79978	79983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017441	ATT	2	6	79987	79992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017441	AGG	2	6	80117	80122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017441	TAG	2	6	80189	80194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017441	GTG	2	6	85535	85540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017441	GTA	2	6	85559	85564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017441	AGC	2	6	85631	85636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017441	ATT	2	6	88495	88500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017441	AAC	2	6	88586	88591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017441	ATT	2	6	91001	91006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017441	GAA	2	6	91020	91025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017441	AAG	3	9	91060	91068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017441	GTT	2	6	93360	93365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017441	TGA	2	6	93410	93415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017441	AGA	2	6	93428	93433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017441	GAA	2	6	93925	93930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017441	TGA	2	6	93936	93941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017441	TAA	2	6	94062	94067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017441	TAA	2	6	94484	94489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017441	TAA	2	6	94557	94562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017441	ATT	3	9	94775	94783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017441	GTT	2	6	98137	98142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017441	GAA	2	6	100466	100471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017441	TTA	2	6	102574	102579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017441	TCT	2	6	103860	103865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017441	TAA	3	9	107286	107294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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141	NC_017441	CTC	2	6	114398	114403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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