MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis Sweden2

Total Repeats: 2379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017441	GA	3	6	212	217	50 %	0 %	50 %	0 %	386262358
2	NC_017441	TC	3	6	825	830	0 %	50 %	0 %	50 %	386262358
3	NC_017441	AG	3	6	847	852	50 %	0 %	50 %	0 %	386262358
4	NC_017441	TC	3	6	2270	2275	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017441	AG	3	6	2753	2758	50 %	0 %	50 %	0 %	386262361
6	NC_017441	GA	3	6	3421	3426	50 %	0 %	50 %	0 %	386262361
7	NC_017441	AT	3	6	5114	5119	50 %	50 %	0 %	0 %	386262362
8	NC_017441	TC	3	6	5864	5869	0 %	50 %	0 %	50 %	386262363
9	NC_017441	GA	3	6	5875	5880	50 %	0 %	50 %	0 %	386262363
10	NC_017441	AT	3	6	5979	5984	50 %	50 %	0 %	0 %	386262363
11	NC_017441	TG	3	6	6132	6137	0 %	50 %	50 %	0 %	386262363
12	NC_017441	AG	3	6	6540	6545	50 %	0 %	50 %	0 %	386262363
13	NC_017441	GA	3	6	7598	7603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017441	AC	3	6	8248	8253	50 %	0 %	0 %	50 %	386262365
15	NC_017441	AG	3	6	8991	8996	50 %	0 %	50 %	0 %	386262366
16	NC_017441	CT	4	8	9110	9117	0 %	50 %	0 %	50 %	386262366
17	NC_017441	GT	3	6	9192	9197	0 %	50 %	50 %	0 %	386262366
18	NC_017441	GA	3	6	10466	10471	50 %	0 %	50 %	0 %	386262368
19	NC_017441	AG	3	6	10683	10688	50 %	0 %	50 %	0 %	386262368
20	NC_017441	TA	3	6	11848	11853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017441	AG	3	6	11909	11914	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017441	TA	3	6	12459	12464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017441	TG	3	6	13362	13367	0 %	50 %	50 %	0 %	386262369
24	NC_017441	AG	3	6	13511	13516	50 %	0 %	50 %	0 %	386262369
25	NC_017441	AG	4	8	13667	13674	50 %	0 %	50 %	0 %	386262369
26	NC_017441	TA	3	6	13929	13934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017441	TA	4	8	14153	14160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017441	AC	3	6	14996	15001	50 %	0 %	0 %	50 %	386262370
29	NC_017441	AG	3	6	16335	16340	50 %	0 %	50 %	0 %	386262371
30	NC_017441	TC	3	6	16375	16380	0 %	50 %	0 %	50 %	386262371
31	NC_017441	GA	3	6	16904	16909	50 %	0 %	50 %	0 %	386262372
32	NC_017441	AG	3	6	16975	16980	50 %	0 %	50 %	0 %	386262372
33	NC_017441	GA	3	6	17759	17764	50 %	0 %	50 %	0 %	386262372
34	NC_017441	AG	3	6	18105	18110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017441	GA	3	6	18118	18123	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017441	GA	3	6	18362	18367	50 %	0 %	50 %	0 %	386262373
37	NC_017441	TC	3	6	18812	18817	0 %	50 %	0 %	50 %	386262373
38	NC_017441	CT	3	6	19040	19045	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017441	TC	3	6	19240	19245	0 %	50 %	0 %	50 %	386262374
40	NC_017441	GA	3	6	19255	19260	50 %	0 %	50 %	0 %	386262374
41	NC_017441	GA	3	6	19354	19359	50 %	0 %	50 %	0 %	386262374
42	NC_017441	AG	3	6	19820	19825	50 %	0 %	50 %	0 %	386262374
43	NC_017441	AG	4	8	20106	20113	50 %	0 %	50 %	0 %	386262374
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45	NC_017441	AG	3	6	20597	20602	50 %	0 %	50 %	0 %	386262375
46	NC_017441	TG	3	6	20710	20715	0 %	50 %	50 %	0 %	386262375
47	NC_017441	AG	3	6	21106	21111	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017441	GA	3	6	21264	21269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017441	AG	3	6	21781	21786	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017441	CT	3	6	21850	21855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017441	CT	4	8	22507	22514	0 %	50 %	0 %	50 %	386262376
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60	NC_017441	GA	3	6	27102	27107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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66	NC_017441	TG	3	6	28983	28988	0 %	50 %	50 %	0 %	386262380
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70	NC_017441	GA	3	6	30523	30528	50 %	0 %	50 %	0 %	386262381
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90	NC_017441	AG	3	6	39192	39197	50 %	0 %	50 %	0 %	386262390
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