MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis G/11074 chromosome

Total Repeats: 763

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017440	TGTGA	2	10	3281	3290	20 %	40 %	40 %	0 %	385245899
2	NC_017440	TTGAA	2	10	3637	3646	40 %	40 %	20 %	0 %	385245900
3	NC_017440	GAGAA	2	10	3931	3940	60 %	0 %	40 %	0 %	385245900
4	NC_017440	GAAAA	2	10	4368	4377	80 %	0 %	20 %	0 %	385245900
5	NC_017440	TTACA	2	10	4523	4532	40 %	40 %	0 %	20 %	385245900
6	NC_017440	GTCTT	2	10	5219	5228	0 %	60 %	20 %	20 %	385245901
7	NC_017440	TATTT	2	10	7034	7043	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017440	TGGTA	2	10	7691	7700	20 %	40 %	40 %	0 %	385245903
9	NC_017440	CGAAA	2	10	9099	9108	60 %	0 %	20 %	20 %	385245904
10	NC_017440	GGCTG	2	10	9733	9742	0 %	20 %	60 %	20 %	385245905
11	NC_017440	CCTCT	2	10	10525	10534	0 %	40 %	0 %	60 %	385245906
12	NC_017440	AAAGG	2	10	10684	10693	60 %	0 %	40 %	0 %	385245906
13	NC_017440	AAGAA	2	10	11804	11813	80 %	0 %	20 %	0 %	385245907
14	NC_017440	AAAGA	2	10	13202	13211	80 %	0 %	20 %	0 %	385245908
15	NC_017440	GGTGT	2	10	13306	13315	0 %	40 %	60 %	0 %	385245908
16	NC_017440	GATTT	2	10	15049	15058	20 %	60 %	20 %	0 %	385245910
17	NC_017440	CGTTC	2	10	16160	16169	0 %	40 %	20 %	40 %	385245911
18	NC_017440	GCTTC	2	10	16533	16542	0 %	40 %	20 %	40 %	385245911
19	NC_017440	GAAGG	2	10	16904	16913	40 %	0 %	60 %	0 %	385245911
20	NC_017440	GTTGT	2	10	20330	20339	0 %	60 %	40 %	0 %	385245914
21	NC_017440	AAGAT	2	10	21442	21451	60 %	20 %	20 %	0 %	385245916
22	NC_017440	TTTGC	2	10	22053	22062	0 %	60 %	20 %	20 %	385245916
23	NC_017440	GGAAA	2	10	23807	23816	60 %	0 %	40 %	0 %	385245916
24	NC_017440	AGAGG	2	10	25532	25541	40 %	0 %	60 %	0 %	385245917
25	NC_017440	GGAGA	2	10	27311	27320	40 %	0 %	60 %	0 %	385245918
26	NC_017440	GGATA	2	10	27337	27346	40 %	20 %	40 %	0 %	385245918
27	NC_017440	ATCCG	2	10	28062	28071	20 %	20 %	20 %	40 %	385245920
28	NC_017440	AGGGT	2	10	28580	28589	20 %	20 %	60 %	0 %	385245920
29	NC_017440	CCTAT	2	10	29620	29629	20 %	40 %	0 %	40 %	385245921
30	NC_017440	GAAGG	2	10	30419	30428	40 %	0 %	60 %	0 %	385245922
31	NC_017440	GAGCT	2	10	31459	31468	20 %	20 %	40 %	20 %	385245923
32	NC_017440	AAAGA	2	10	33092	33101	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017440	CTATT	2	10	36133	36142	20 %	60 %	0 %	20 %	385245929
34	NC_017440	TCCTA	2	10	36180	36189	20 %	40 %	0 %	40 %	385245929
35	NC_017440	ACGAT	2	10	38096	38105	40 %	20 %	20 %	20 %	385245930
36	NC_017440	TTTGA	2	10	38461	38470	20 %	60 %	20 %	0 %	385245930
37	NC_017440	AGCAA	2	10	42112	42121	60 %	0 %	20 %	20 %	385245933
38	NC_017440	CGATG	2	10	42169	42178	20 %	20 %	40 %	20 %	385245933
39	NC_017440	TGCAA	2	10	42327	42336	40 %	20 %	20 %	20 %	385245934
40	NC_017440	CAAAA	2	10	42646	42655	80 %	0 %	0 %	20 %	385245934
41	NC_017440	TTTAT	2	10	44243	44252	20 %	80 %	0 %	0 %	385245938
42	NC_017440	CTTTC	2	10	46339	46348	0 %	60 %	0 %	40 %	385245940
43	NC_017440	AGTTT	2	10	46878	46887	20 %	60 %	20 %	0 %	385245940
44	NC_017440	GAAGA	2	10	48011	48020	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017440	CTATT	2	10	49590	49599	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017440	CTTTT	2	10	50041	50050	0 %	80 %	0 %	20 %	385245943
47	NC_017440	CCGTA	2	10	53768	53777	20 %	20 %	20 %	40 %	385245946
48	NC_017440	AATTT	2	10	54008	54017	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017440	TCAGA	2	10	54626	54635	40 %	20 %	20 %	20 %	385245947
50	NC_017440	TTATC	2	10	55153	55162	20 %	60 %	0 %	20 %	385245947
51	NC_017440	TGAGT	2	10	55174	55183	20 %	40 %	40 %	0 %	385245947
52	NC_017440	GTTGT	2	10	56221	56230	0 %	60 %	40 %	0 %	385245948
53	NC_017440	GAGCA	2	10	59733	59742	40 %	0 %	40 %	20 %	385245950
54	NC_017440	TGTGA	2	10	62182	62191	20 %	40 %	40 %	0 %	385245952
55	NC_017440	AGTGA	2	10	63709	63718	40 %	20 %	40 %	0 %	385245953
56	NC_017440	CCTTC	2	10	63983	63992	0 %	40 %	0 %	60 %	385245953
57	NC_017440	AGGAG	2	10	66211	66220	40 %	0 %	60 %	0 %	385245955
58	NC_017440	GTTAA	2	10	66341	66350	40 %	40 %	20 %	0 %	385245955
59	NC_017440	CAAGC	2	10	68719	68728	40 %	0 %	20 %	40 %	385245957
60	NC_017440	AAAAG	2	10	68967	68976	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017440	GCGAT	2	10	69779	69788	20 %	20 %	40 %	20 %	385245958
62	NC_017440	CTCTT	2	10	70133	70142	0 %	60 %	0 %	40 %	385245958
63	NC_017440	AGGGG	2	10	70779	70788	20 %	0 %	80 %	0 %	385245958
64	NC_017440	AAGAA	2	10	70821	70830	80 %	0 %	20 %	0 %	385245958
65	NC_017440	CTTGC	2	10	71910	71919	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_017440	ATTGG	2	10	72111	72120	20 %	40 %	40 %	0 %	385245960
67	NC_017440	GAAAA	2	10	73183	73192	80 %	0 %	20 %	0 %	385245960
68	NC_017440	TGGGA	2	10	73600	73609	20 %	20 %	60 %	0 %	385245961
69	NC_017440	TATTT	2	10	76127	76136	20 %	80 %	0 %	0 %	385245962
70	NC_017440	AAAAG	2	10	76660	76669	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017440	ATCAA	2	10	78358	78367	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017440	TGTCT	2	10	79920	79929	0 %	60 %	20 %	20 %	385245966
73	NC_017440	TTACT	2	10	80427	80436	20 %	60 %	0 %	20 %	385245966
74	NC_017440	AGAAA	2	10	81817	81826	80 %	0 %	20 %	0 %	385245968
75	NC_017440	GGAAG	2	10	82330	82339	40 %	0 %	60 %	0 %	385245968
76	NC_017440	TTTGT	2	10	85095	85104	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017440	GATCC	2	10	85881	85890	20 %	20 %	20 %	40 %	385245971
78	NC_017440	AGAGC	2	10	87216	87225	40 %	0 %	40 %	20 %	385245972
79	NC_017440	AATAA	2	10	88094	88103	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017440	TTTTC	2	10	90948	90957	0 %	80 %	0 %	20 %	385245975
81	NC_017440	GGATG	2	10	91208	91217	20 %	20 %	60 %	0 %	385245976
82	NC_017440	CAACA	2	10	92747	92756	60 %	0 %	0 %	40 %	385245977
83	NC_017440	ACAGC	2	10	93792	93801	40 %	0 %	20 %	40 %	385245979
84	NC_017440	CTTTT	2	10	94166	94175	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017440	GGAAC	2	10	94504	94513	40 %	0 %	40 %	20 %	385245980
86	NC_017440	GGATT	2	10	95404	95413	20 %	40 %	40 %	0 %	385245980
87	NC_017440	CAATC	2	10	96506	96515	40 %	20 %	0 %	40 %	385245982
88	NC_017440	TTTGC	2	10	96640	96649	0 %	60 %	20 %	20 %	385245982
89	NC_017440	ATTCA	2	10	96904	96913	40 %	40 %	0 %	20 %	385245982
90	NC_017440	GATCC	2	10	97163	97172	20 %	20 %	20 %	40 %	385245982
91	NC_017440	GTTTT	2	10	97584	97593	0 %	80 %	20 %	0 %	385245982
92	NC_017440	ACAAA	2	10	97711	97720	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017440	AAGCT	2	10	98787	98796	40 %	20 %	20 %	20 %	385245983
94	NC_017440	AGGGG	2	10	99146	99155	20 %	0 %	80 %	0 %	385245983
95	NC_017440	ATAGC	2	10	99845	99854	40 %	20 %	20 %	20 %	385245984
96	NC_017440	TTCCC	2	10	100449	100458	0 %	40 %	0 %	60 %	385245985
97	NC_017440	AGCGA	2	10	102773	102782	40 %	0 %	40 %	20 %	385245987
98	NC_017440	TTTCT	2	10	103131	103140	0 %	80 %	0 %	20 %	385245987
99	NC_017440	CTTCT	2	10	103185	103194	0 %	60 %	0 %	40 %	385245987
100	NC_017440	ATCAT	2	10	104337	104346	40 %	40 %	0 %	20 %	385245988
101	NC_017440	GGCAT	2	10	105045	105054	20 %	20 %	40 %	20 %	385245988
102	NC_017440	AAAGC	2	10	108771	108780	60 %	0 %	20 %	20 %	385245991
103	NC_017440	GCATT	2	10	109931	109940	20 %	40 %	20 %	20 %	385245993
104	NC_017440	GCTCT	2	10	113984	113993	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_017440	TGTTT	2	10	114608	114617	0 %	80 %	20 %	0 %	385245996
106	NC_017440	CATGT	2	10	114986	114995	20 %	40 %	20 %	20 %	385245996
107	NC_017440	TATCG	2	10	115690	115699	20 %	40 %	20 %	20 %	385245996
108	NC_017440	TTTCT	2	10	116206	116215	0 %	80 %	0 %	20 %	385245997
109	NC_017440	AAAGA	2	10	118451	118460	80 %	0 %	20 %	0 %	385245999
110	NC_017440	GCTTC	2	10	122441	122450	0 %	40 %	20 %	40 %	385246002
111	NC_017440	TACAA	2	10	126230	126239	60 %	20 %	0 %	20 %	385246006
112	NC_017440	ATCCA	2	10	128635	128644	40 %	20 %	0 %	40 %	385246009
113	NC_017440	GAAGA	2	10	130185	130194	60 %	0 %	40 %	0 %	385246009
114	NC_017440	AAAAG	2	10	132098	132107	80 %	0 %	20 %	0 %	385246010
115	NC_017440	GATTC	2	10	132429	132438	20 %	40 %	20 %	20 %	385246010
116	NC_017440	GGATA	2	10	135049	135058	40 %	20 %	40 %	0 %	385246012
117	NC_017440	ATTGG	2	10	135714	135723	20 %	40 %	40 %	0 %	385246013
118	NC_017440	ATTGT	2	10	135747	135756	20 %	60 %	20 %	0 %	385246013
119	NC_017440	TGTTT	2	10	136173	136182	0 %	80 %	20 %	0 %	385246014
120	NC_017440	TTGCA	2	10	136963	136972	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_017440	TCCAG	2	10	139917	139926	20 %	20 %	20 %	40 %	385246020
122	NC_017440	GTACA	2	10	140648	140657	40 %	20 %	20 %	20 %	385246021
123	NC_017440	TAGAT	2	10	141021	141030	40 %	40 %	20 %	0 %	385246021
124	NC_017440	AAAAG	2	10	141433	141442	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017440	AAAAC	2	10	141913	141922	80 %	0 %	0 %	20 %	385246022
126	NC_017440	TGCTA	2	10	142999	143008	20 %	40 %	20 %	20 %	385246024
127	NC_017440	GGAGC	2	10	143046	143055	20 %	0 %	60 %	20 %	385246024
128	NC_017440	CTGGG	2	10	144460	144469	0 %	20 %	60 %	20 %	385246026
129	NC_017440	GTTTT	2	10	145207	145216	0 %	80 %	20 %	0 %	385246027
130	NC_017440	GAACC	2	10	148941	148950	40 %	0 %	20 %	40 %	385246028
131	NC_017440	ATTCT	2	10	152437	152446	20 %	60 %	0 %	20 %	385246032
132	NC_017440	CTGTG	2	10	152641	152650	0 %	40 %	40 %	20 %	385246032
133	NC_017440	TTCTT	2	10	155114	155123	0 %	80 %	0 %	20 %	385246035
134	NC_017440	TTCTA	2	10	157216	157225	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017440	AGGAA	2	10	159670	159679	60 %	0 %	40 %	0 %	385246039
136	NC_017440	CAAAA	2	10	161673	161682	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017440	AGAGA	2	10	162901	162910	60 %	0 %	40 %	0 %	385246042
138	NC_017440	AGCAA	2	10	163336	163345	60 %	0 %	20 %	20 %	385246042
139	NC_017440	CAAAA	2	10	166839	166848	80 %	0 %	0 %	20 %	385246044
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152	NC_017440	AGAAA	2	10	182471	182480	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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253	NC_017440	CAAAA	2	10	332473	332482	80 %	0 %	0 %	20 %	385246196
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256	NC_017440	CCTTT	2	10	334689	334698	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
257	NC_017440	CTAAA	2	10	337792	337801	60 %	20 %	0 %	20 %	385246199
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266	NC_017440	ATCTC	2	10	351630	351639	20 %	40 %	0 %	40 %	385246211
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399	NC_017440	AATCA	2	10	530713	530722	60 %	20 %	0 %	20 %	385246365
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