MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/150 chromosome

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017439	GAAGGA	2	12	760	771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017439	CAAAAA	2	12	6252	6263	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017439	AAAATT	2	12	54175	54186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017439	AGTTGT	2	12	57760	57771	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017439	TTGTTC	2	12	58680	58691	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017439	AAAAAT	2	12	60985	60996	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017439	ATCTAG	2	12	76708	76719	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017439	TTTTAG	2	12	115974	115985	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017439	TAAAAA	2	12	120570	120581	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017439	AGAAAA	2	12	182187	182198	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017439	TATGAA	2	12	194961	194972	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017439	TTTTAC	2	12	221246	221257	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017439	AACCCT	2	12	254959	254970	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017439	ATTTTT	2	12	255763	255774	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017439	AGGAGA	2	12	270862	270873	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017439	ATATTA	2	12	279760	279771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017439	AAAAAG	2	12	323929	323940	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017439	AGAATA	2	12	361423	361434	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017439	TTTTAA	2	12	409570	409581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017439	TAACTA	2	12	503147	503158	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017439	AAGAAA	2	12	503160	503171	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017439	AGAATA	2	12	509138	509149	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017439	AACTAA	2	12	514874	514885	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017439	TCCCTC	2	12	548764	548775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_017439	AAAAAT	2	12	566736	566747	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017439	TAGGGG	2	12	605889	605900	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017439	TCTTTT	2	12	617874	617885	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017439	TTATTT	2	12	649086	649097	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017439	TATTTT	2	12	755032	755043	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017439	TTTTCT	2	12	804951	804962	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017439	ATTTTT	2	12	808730	808741	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017439	ATTTTT	2	12	835209	835220	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017439	TAAGGA	2	12	856173	856184	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017439	CCGGAG	2	12	857091	857102	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017439	CCTCTA	2	12	870242	870253	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017439	TAAGGA	2	12	878224	878235	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017439	CCGGAG	2	12	879142	879153	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017439	GACGGC	2	12	921566	921577	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017439	AAACAA	2	12	923254	923265	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017439	TTGTAA	2	12	1014762	1014773	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017439	ATTTTT	2	12	1038729	1038740	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017439	TAAAAT	2	12	1042353	1042364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.