MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis E/150 chromosome

Total Repeats: 760

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017439	TGTGA	2	10	3281	3290	20 %	40 %	40 %	0 %	385244971
2	NC_017439	TTGAA	2	10	3637	3646	40 %	40 %	20 %	0 %	385244972
3	NC_017439	GAGAA	2	10	3931	3940	60 %	0 %	40 %	0 %	385244972
4	NC_017439	GAAAA	2	10	4368	4377	80 %	0 %	20 %	0 %	385244972
5	NC_017439	TTACA	2	10	4523	4532	40 %	40 %	0 %	20 %	385244972
6	NC_017439	GTCTT	2	10	5219	5228	0 %	60 %	20 %	20 %	385244973
7	NC_017439	TATTT	2	10	7034	7043	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017439	TGGTA	2	10	7691	7700	20 %	40 %	40 %	0 %	385244975
9	NC_017439	CGAAA	2	10	9099	9108	60 %	0 %	20 %	20 %	385244976
10	NC_017439	GGCTG	2	10	9733	9742	0 %	20 %	60 %	20 %	385244977
11	NC_017439	CCTCT	2	10	10525	10534	0 %	40 %	0 %	60 %	385244978
12	NC_017439	AAAGG	2	10	10684	10693	60 %	0 %	40 %	0 %	385244978
13	NC_017439	AAGAA	2	10	11794	11803	80 %	0 %	20 %	0 %	385244979
14	NC_017439	AAAGA	2	10	13192	13201	80 %	0 %	20 %	0 %	385244980
15	NC_017439	GGTGT	2	10	13296	13305	0 %	40 %	60 %	0 %	385244980
16	NC_017439	GATTT	2	10	15039	15048	20 %	60 %	20 %	0 %	385244982
17	NC_017439	CGTTC	2	10	16150	16159	0 %	40 %	20 %	40 %	385244983
18	NC_017439	GCTTC	2	10	16523	16532	0 %	40 %	20 %	40 %	385244983
19	NC_017439	GAAGG	2	10	16894	16903	40 %	0 %	60 %	0 %	385244983
20	NC_017439	GTTGT	2	10	20320	20329	0 %	60 %	40 %	0 %	385244986
21	NC_017439	AAGAT	2	10	21431	21440	60 %	20 %	20 %	0 %	385244988
22	NC_017439	TTTGC	2	10	22042	22051	0 %	60 %	20 %	20 %	385244988
23	NC_017439	GGAAA	2	10	23796	23805	60 %	0 %	40 %	0 %	385244988
24	NC_017439	AGAGG	2	10	25521	25530	40 %	0 %	60 %	0 %	385244989
25	NC_017439	GGAGA	2	10	27300	27309	40 %	0 %	60 %	0 %	385244990
26	NC_017439	ATCCG	2	10	28051	28060	20 %	20 %	20 %	40 %	385244992
27	NC_017439	AGGGT	2	10	28569	28578	20 %	20 %	60 %	0 %	385244992
28	NC_017439	CCTAT	2	10	29609	29618	20 %	40 %	0 %	40 %	385244993
29	NC_017439	AAGGA	2	10	30409	30418	60 %	0 %	40 %	0 %	385244994
30	NC_017439	GAGCT	2	10	31448	31457	20 %	20 %	40 %	20 %	385244995
31	NC_017439	AAAGA	2	10	33081	33090	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017439	TCAGT	2	10	35688	35697	20 %	40 %	20 %	20 %	385245001
33	NC_017439	CTATT	2	10	36122	36131	20 %	60 %	0 %	20 %	385245001
34	NC_017439	TCCTA	2	10	36169	36178	20 %	40 %	0 %	40 %	385245001
35	NC_017439	ACGAT	2	10	38085	38094	40 %	20 %	20 %	20 %	385245002
36	NC_017439	TTTGA	2	10	38450	38459	20 %	60 %	20 %	0 %	385245002
37	NC_017439	AGCAA	2	10	42100	42109	60 %	0 %	20 %	20 %	385245005
38	NC_017439	CGATG	2	10	42157	42166	20 %	20 %	40 %	20 %	385245005
39	NC_017439	TGCAA	2	10	42315	42324	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017439	CAAAA	2	10	42633	42642	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017439	TTTAT	2	10	44230	44239	20 %	80 %	0 %	0 %	385245010
42	NC_017439	CTTTC	2	10	46327	46336	0 %	60 %	0 %	40 %	385245012
43	NC_017439	AGTTT	2	10	46866	46875	20 %	60 %	20 %	0 %	385245012
44	NC_017439	GAAGA	2	10	47999	48008	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017439	CTATT	2	10	49578	49587	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017439	CTTTT	2	10	50029	50038	0 %	80 %	0 %	20 %	385245015
47	NC_017439	CCGTA	2	10	53911	53920	20 %	20 %	20 %	40 %	385245018
48	NC_017439	AATTT	2	10	54151	54160	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017439	TTATC	2	10	55320	55329	20 %	60 %	0 %	20 %	385245019
50	NC_017439	TGAGT	2	10	55341	55350	20 %	40 %	40 %	0 %	385245019
51	NC_017439	GTTGT	2	10	56388	56397	0 %	60 %	40 %	0 %	385245020
52	NC_017439	GAGCA	2	10	59836	59845	40 %	0 %	40 %	20 %	385245022
53	NC_017439	TGTGA	2	10	62285	62294	20 %	40 %	40 %	0 %	385245025
54	NC_017439	AGTGA	2	10	63806	63815	40 %	20 %	40 %	0 %	385245026
55	NC_017439	CCTTC	2	10	64080	64089	0 %	40 %	0 %	60 %	385245026
56	NC_017439	AGGAG	2	10	66308	66317	40 %	0 %	60 %	0 %	385245028
57	NC_017439	GTTAA	2	10	66438	66447	40 %	40 %	20 %	0 %	385245028
58	NC_017439	AAAAG	2	10	69064	69073	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017439	GGAGC	2	10	69686	69695	20 %	0 %	60 %	20 %	385245031
60	NC_017439	GCGAT	2	10	69876	69885	20 %	20 %	40 %	20 %	385245031
61	NC_017439	CTCTT	2	10	70230	70239	0 %	60 %	0 %	40 %	385245031
62	NC_017439	AGGGG	2	10	70876	70885	20 %	0 %	80 %	0 %	385245031
63	NC_017439	AAGAA	2	10	70918	70927	80 %	0 %	20 %	0 %	385245031
64	NC_017439	CTTGC	2	10	72007	72016	0 %	40 %	20 %	40 %	385245033
65	NC_017439	ATTGG	2	10	72208	72217	20 %	40 %	40 %	0 %	385245034
66	NC_017439	GAAAA	2	10	73280	73289	80 %	0 %	20 %	0 %	385245034
67	NC_017439	TGGGA	2	10	73697	73706	20 %	20 %	60 %	0 %	385245035
68	NC_017439	TATTT	2	10	76224	76233	20 %	80 %	0 %	0 %	385245036
69	NC_017439	AAAAG	2	10	76757	76766	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017439	ATCAA	2	10	78455	78464	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017439	TGTCT	2	10	80017	80026	0 %	60 %	20 %	20 %	385245040
72	NC_017439	TTACT	2	10	80524	80533	20 %	60 %	0 %	20 %	385245040
73	NC_017439	AGAAA	2	10	81914	81923	80 %	0 %	20 %	0 %	385245042
74	NC_017439	GGAAG	2	10	82427	82436	40 %	0 %	60 %	0 %	385245042
75	NC_017439	AGCGA	2	10	84893	84902	40 %	0 %	40 %	20 %	385245044
76	NC_017439	TTTGT	2	10	85192	85201	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017439	GATCC	2	10	85978	85987	20 %	20 %	20 %	40 %	385245045
78	NC_017439	AGAGC	2	10	87313	87322	40 %	0 %	40 %	20 %	385245046
79	NC_017439	AATAA	2	10	88191	88200	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017439	TTTTC	2	10	91045	91054	0 %	80 %	0 %	20 %	385245049
81	NC_017439	GGATG	2	10	91305	91314	20 %	20 %	60 %	0 %	385245050
82	NC_017439	CAACA	2	10	92844	92853	60 %	0 %	0 %	40 %	385245051
83	NC_017439	TTTAA	2	10	93727	93736	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017439	ACAGC	2	10	93888	93897	40 %	0 %	20 %	40 %	385245053
85	NC_017439	CTTTT	2	10	94262	94271	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017439	GGAAC	2	10	94601	94610	40 %	0 %	40 %	20 %	385245054
87	NC_017439	GGATT	2	10	95501	95510	20 %	40 %	40 %	0 %	385245054
88	NC_017439	CAATC	2	10	96597	96606	40 %	20 %	0 %	40 %	385245056
89	NC_017439	TTTGC	2	10	96731	96740	0 %	60 %	20 %	20 %	385245056
90	NC_017439	ATTCA	2	10	96995	97004	40 %	40 %	0 %	20 %	385245056
91	NC_017439	GATCC	2	10	97254	97263	20 %	20 %	20 %	40 %	385245056
92	NC_017439	GTTTT	2	10	97675	97684	0 %	80 %	20 %	0 %	385245056
93	NC_017439	ACAAA	2	10	97802	97811	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_017439	AAGCT	2	10	98878	98887	40 %	20 %	20 %	20 %	385245057
95	NC_017439	AGGGG	2	10	99237	99246	20 %	0 %	80 %	0 %	385245057
96	NC_017439	ATAGC	2	10	99936	99945	40 %	20 %	20 %	20 %	385245058
97	NC_017439	TTCCC	2	10	100540	100549	0 %	40 %	0 %	60 %	385245059
98	NC_017439	AGCGA	2	10	102864	102873	40 %	0 %	40 %	20 %	385245061
99	NC_017439	TTTCT	2	10	103222	103231	0 %	80 %	0 %	20 %	385245061
100	NC_017439	CTTCT	2	10	103276	103285	0 %	60 %	0 %	40 %	385245061
101	NC_017439	ATCAT	2	10	104428	104437	40 %	40 %	0 %	20 %	385245062
102	NC_017439	GGCAT	2	10	105136	105145	20 %	20 %	40 %	20 %	385245062
103	NC_017439	AAAGC	2	10	108862	108871	60 %	0 %	20 %	20 %	385245065
104	NC_017439	GCATT	2	10	110022	110031	20 %	40 %	20 %	20 %	385245067
105	NC_017439	GCTCT	2	10	114075	114084	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_017439	TGTTT	2	10	114699	114708	0 %	80 %	20 %	0 %	385245070
107	NC_017439	CATGT	2	10	115077	115086	20 %	40 %	20 %	20 %	385245070
108	NC_017439	TATCG	2	10	115781	115790	20 %	40 %	20 %	20 %	385245070
109	NC_017439	TTTCT	2	10	116297	116306	0 %	80 %	0 %	20 %	385245071
110	NC_017439	AAAGA	2	10	118542	118551	80 %	0 %	20 %	0 %	385245073
111	NC_017439	GCTTC	2	10	122532	122541	0 %	40 %	20 %	40 %	385245076
112	NC_017439	TACAA	2	10	126321	126330	60 %	20 %	0 %	20 %	385245080
113	NC_017439	ATCCA	2	10	128729	128738	40 %	20 %	0 %	40 %	385245083
114	NC_017439	GAAGA	2	10	130279	130288	60 %	0 %	40 %	0 %	385245083
115	NC_017439	AAAAG	2	10	132192	132201	80 %	0 %	20 %	0 %	385245085
116	NC_017439	GATTC	2	10	132523	132532	20 %	40 %	20 %	20 %	385245085
117	NC_017439	ATTGG	2	10	135808	135817	20 %	40 %	40 %	0 %	385245088
118	NC_017439	TGTTT	2	10	136267	136276	0 %	80 %	20 %	0 %	385245089
119	NC_017439	TTGCA	2	10	137057	137066	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017439	TCCAG	2	10	140013	140022	20 %	20 %	20 %	40 %	385245095
121	NC_017439	GTACA	2	10	140744	140753	40 %	20 %	20 %	20 %	385245096
122	NC_017439	TAGAT	2	10	141117	141126	40 %	40 %	20 %	0 %	385245096
123	NC_017439	AAAAG	2	10	141529	141538	80 %	0 %	20 %	0 %	385245097
124	NC_017439	AAAAC	2	10	142009	142018	80 %	0 %	0 %	20 %	385245098
125	NC_017439	TGCTA	2	10	143095	143104	20 %	40 %	20 %	20 %	385245100
126	NC_017439	GGAGC	2	10	143142	143151	20 %	0 %	60 %	20 %	385245100
127	NC_017439	CTGGG	2	10	144556	144565	0 %	20 %	60 %	20 %	385245102
128	NC_017439	GTTTT	2	10	145303	145312	0 %	80 %	20 %	0 %	385245103
129	NC_017439	GAACC	2	10	149037	149046	40 %	0 %	20 %	40 %	385245104
130	NC_017439	ATTCT	2	10	152533	152542	20 %	60 %	0 %	20 %	385245108
131	NC_017439	CTGTG	2	10	152737	152746	0 %	40 %	40 %	20 %	385245108
132	NC_017439	TTCTT	2	10	155210	155219	0 %	80 %	0 %	20 %	385245111
133	NC_017439	TTCTA	2	10	157315	157324	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017439	AGGAA	2	10	159768	159777	60 %	0 %	40 %	0 %	385245115
135	NC_017439	CAAAA	2	10	161771	161780	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017439	AGAGA	2	10	162999	163008	60 %	0 %	40 %	0 %	385245118
137	NC_017439	AGCAA	2	10	163434	163443	60 %	0 %	20 %	20 %	385245118
138	NC_017439	CAAAA	2	10	166937	166946	80 %	0 %	0 %	20 %	385245120
139	NC_017439	AAGAG	2	10	167770	167779	60 %	0 %	40 %	0 %	385245120
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250	NC_017439	TAAAT	2	10	331144	331153	60 %	40 %	0 %	0 %	385245271
251	NC_017439	CTAAA	2	10	331909	331918	60 %	20 %	0 %	20 %	385245272
252	NC_017439	CAAAA	2	10	332389	332398	80 %	0 %	0 %	20 %	385245272
253	NC_017439	GCAAC	2	10	334090	334099	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
254	NC_017439	CTTGT	2	10	334150	334159	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
255	NC_017439	CCTTT	2	10	334608	334617	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
256	NC_017439	CTAAA	2	10	337703	337712	60 %	20 %	0 %	20 %	385245275
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259	NC_017439	CAGAG	2	10	340815	340824	40 %	0 %	40 %	20 %	385245276
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262	NC_017439	ATCCC	2	10	344670	344679	20 %	20 %	0 %	60 %	385245280
263	NC_017439	AAAAG	2	10	347567	347576	80 %	0 %	20 %	0 %	385245282
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267	NC_017439	CCTTC	2	10	353748	353757	0 %	40 %	0 %	60 %	385245287
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