MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/150 chromosome

Total Repeats: 658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017439	TGTGA	2	10	3281	3290	20 %	40 %	40 %	0 %	385244971
2	NC_017439	TTGAA	2	10	3637	3646	40 %	40 %	20 %	0 %	385244972
3	NC_017439	GAGAA	2	10	3931	3940	60 %	0 %	40 %	0 %	385244972
4	NC_017439	GAAAA	2	10	4368	4377	80 %	0 %	20 %	0 %	385244972
5	NC_017439	TTACA	2	10	4523	4532	40 %	40 %	0 %	20 %	385244972
6	NC_017439	GTCTT	2	10	5219	5228	0 %	60 %	20 %	20 %	385244973
7	NC_017439	TGGTA	2	10	7691	7700	20 %	40 %	40 %	0 %	385244975
8	NC_017439	CGAAA	2	10	9099	9108	60 %	0 %	20 %	20 %	385244976
9	NC_017439	GGCTG	2	10	9733	9742	0 %	20 %	60 %	20 %	385244977
10	NC_017439	CCTCT	2	10	10525	10534	0 %	40 %	0 %	60 %	385244978
11	NC_017439	AAAGG	2	10	10684	10693	60 %	0 %	40 %	0 %	385244978
12	NC_017439	AAGAA	2	10	11794	11803	80 %	0 %	20 %	0 %	385244979
13	NC_017439	AAAGA	2	10	13192	13201	80 %	0 %	20 %	0 %	385244980
14	NC_017439	GGTGT	2	10	13296	13305	0 %	40 %	60 %	0 %	385244980
15	NC_017439	GATTT	2	10	15039	15048	20 %	60 %	20 %	0 %	385244982
16	NC_017439	CGTTC	2	10	16150	16159	0 %	40 %	20 %	40 %	385244983
17	NC_017439	GCTTC	2	10	16523	16532	0 %	40 %	20 %	40 %	385244983
18	NC_017439	GAAGG	2	10	16894	16903	40 %	0 %	60 %	0 %	385244983
19	NC_017439	GTTGT	2	10	20320	20329	0 %	60 %	40 %	0 %	385244986
20	NC_017439	AAGAT	2	10	21431	21440	60 %	20 %	20 %	0 %	385244988
21	NC_017439	TTTGC	2	10	22042	22051	0 %	60 %	20 %	20 %	385244988
22	NC_017439	GGAAA	2	10	23796	23805	60 %	0 %	40 %	0 %	385244988
23	NC_017439	AGAGG	2	10	25521	25530	40 %	0 %	60 %	0 %	385244989
24	NC_017439	GGAGA	2	10	27300	27309	40 %	0 %	60 %	0 %	385244990
25	NC_017439	ATCCG	2	10	28051	28060	20 %	20 %	20 %	40 %	385244992
26	NC_017439	AGGGT	2	10	28569	28578	20 %	20 %	60 %	0 %	385244992
27	NC_017439	CCTAT	2	10	29609	29618	20 %	40 %	0 %	40 %	385244993
28	NC_017439	AAGGA	2	10	30409	30418	60 %	0 %	40 %	0 %	385244994
29	NC_017439	GAGCT	2	10	31448	31457	20 %	20 %	40 %	20 %	385244995
30	NC_017439	TCAGT	2	10	35688	35697	20 %	40 %	20 %	20 %	385245001
31	NC_017439	CTATT	2	10	36122	36131	20 %	60 %	0 %	20 %	385245001
32	NC_017439	TCCTA	2	10	36169	36178	20 %	40 %	0 %	40 %	385245001
33	NC_017439	ACGAT	2	10	38085	38094	40 %	20 %	20 %	20 %	385245002
34	NC_017439	TTTGA	2	10	38450	38459	20 %	60 %	20 %	0 %	385245002
35	NC_017439	AGCAA	2	10	42100	42109	60 %	0 %	20 %	20 %	385245005
36	NC_017439	CGATG	2	10	42157	42166	20 %	20 %	40 %	20 %	385245005
37	NC_017439	TTTAT	2	10	44230	44239	20 %	80 %	0 %	0 %	385245010
38	NC_017439	CTTTC	2	10	46327	46336	0 %	60 %	0 %	40 %	385245012
39	NC_017439	AGTTT	2	10	46866	46875	20 %	60 %	20 %	0 %	385245012
40	NC_017439	CTTTT	2	10	50029	50038	0 %	80 %	0 %	20 %	385245015
41	NC_017439	CCGTA	2	10	53911	53920	20 %	20 %	20 %	40 %	385245018
42	NC_017439	TTATC	2	10	55320	55329	20 %	60 %	0 %	20 %	385245019
43	NC_017439	TGAGT	2	10	55341	55350	20 %	40 %	40 %	0 %	385245019
44	NC_017439	GTTGT	2	10	56388	56397	0 %	60 %	40 %	0 %	385245020
45	NC_017439	GAGCA	2	10	59836	59845	40 %	0 %	40 %	20 %	385245022
46	NC_017439	TGTGA	2	10	62285	62294	20 %	40 %	40 %	0 %	385245025
47	NC_017439	AGTGA	2	10	63806	63815	40 %	20 %	40 %	0 %	385245026
48	NC_017439	CCTTC	2	10	64080	64089	0 %	40 %	0 %	60 %	385245026
49	NC_017439	AGGAG	2	10	66308	66317	40 %	0 %	60 %	0 %	385245028
50	NC_017439	GTTAA	2	10	66438	66447	40 %	40 %	20 %	0 %	385245028
51	NC_017439	GGAGC	2	10	69686	69695	20 %	0 %	60 %	20 %	385245031
52	NC_017439	GCGAT	2	10	69876	69885	20 %	20 %	40 %	20 %	385245031
53	NC_017439	CTCTT	2	10	70230	70239	0 %	60 %	0 %	40 %	385245031
54	NC_017439	AGGGG	2	10	70876	70885	20 %	0 %	80 %	0 %	385245031
55	NC_017439	AAGAA	2	10	70918	70927	80 %	0 %	20 %	0 %	385245031
56	NC_017439	CTTGC	2	10	72007	72016	0 %	40 %	20 %	40 %	385245033
57	NC_017439	ATTGG	2	10	72208	72217	20 %	40 %	40 %	0 %	385245034
58	NC_017439	GAAAA	2	10	73280	73289	80 %	0 %	20 %	0 %	385245034
59	NC_017439	TGGGA	2	10	73697	73706	20 %	20 %	60 %	0 %	385245035
60	NC_017439	TATTT	2	10	76224	76233	20 %	80 %	0 %	0 %	385245036
61	NC_017439	TGTCT	2	10	80017	80026	0 %	60 %	20 %	20 %	385245040
62	NC_017439	TTACT	2	10	80524	80533	20 %	60 %	0 %	20 %	385245040
63	NC_017439	AGAAA	2	10	81914	81923	80 %	0 %	20 %	0 %	385245042
64	NC_017439	GGAAG	2	10	82427	82436	40 %	0 %	60 %	0 %	385245042
65	NC_017439	AGCGA	2	10	84893	84902	40 %	0 %	40 %	20 %	385245044
66	NC_017439	GATCC	2	10	85978	85987	20 %	20 %	20 %	40 %	385245045
67	NC_017439	AGAGC	2	10	87313	87322	40 %	0 %	40 %	20 %	385245046
68	NC_017439	TTTTC	2	10	91045	91054	0 %	80 %	0 %	20 %	385245049
69	NC_017439	GGATG	2	10	91305	91314	20 %	20 %	60 %	0 %	385245050
70	NC_017439	CAACA	2	10	92844	92853	60 %	0 %	0 %	40 %	385245051
71	NC_017439	ACAGC	2	10	93888	93897	40 %	0 %	20 %	40 %	385245053
72	NC_017439	GGAAC	2	10	94601	94610	40 %	0 %	40 %	20 %	385245054
73	NC_017439	GGATT	2	10	95501	95510	20 %	40 %	40 %	0 %	385245054
74	NC_017439	CAATC	2	10	96597	96606	40 %	20 %	0 %	40 %	385245056
75	NC_017439	TTTGC	2	10	96731	96740	0 %	60 %	20 %	20 %	385245056
76	NC_017439	ATTCA	2	10	96995	97004	40 %	40 %	0 %	20 %	385245056
77	NC_017439	GATCC	2	10	97254	97263	20 %	20 %	20 %	40 %	385245056
78	NC_017439	GTTTT	2	10	97675	97684	0 %	80 %	20 %	0 %	385245056
79	NC_017439	AAGCT	2	10	98878	98887	40 %	20 %	20 %	20 %	385245057
80	NC_017439	AGGGG	2	10	99237	99246	20 %	0 %	80 %	0 %	385245057
81	NC_017439	ATAGC	2	10	99936	99945	40 %	20 %	20 %	20 %	385245058
82	NC_017439	TTCCC	2	10	100540	100549	0 %	40 %	0 %	60 %	385245059
83	NC_017439	AGCGA	2	10	102864	102873	40 %	0 %	40 %	20 %	385245061
84	NC_017439	TTTCT	2	10	103222	103231	0 %	80 %	0 %	20 %	385245061
85	NC_017439	CTTCT	2	10	103276	103285	0 %	60 %	0 %	40 %	385245061
86	NC_017439	ATCAT	2	10	104428	104437	40 %	40 %	0 %	20 %	385245062
87	NC_017439	GGCAT	2	10	105136	105145	20 %	20 %	40 %	20 %	385245062
88	NC_017439	AAAGC	2	10	108862	108871	60 %	0 %	20 %	20 %	385245065
89	NC_017439	GCATT	2	10	110022	110031	20 %	40 %	20 %	20 %	385245067
90	NC_017439	TGTTT	2	10	114699	114708	0 %	80 %	20 %	0 %	385245070
91	NC_017439	CATGT	2	10	115077	115086	20 %	40 %	20 %	20 %	385245070
92	NC_017439	TATCG	2	10	115781	115790	20 %	40 %	20 %	20 %	385245070
93	NC_017439	TTTCT	2	10	116297	116306	0 %	80 %	0 %	20 %	385245071
94	NC_017439	AAAGA	2	10	118542	118551	80 %	0 %	20 %	0 %	385245073
95	NC_017439	GCTTC	2	10	122532	122541	0 %	40 %	20 %	40 %	385245076
96	NC_017439	TACAA	2	10	126321	126330	60 %	20 %	0 %	20 %	385245080
97	NC_017439	ATCCA	2	10	128729	128738	40 %	20 %	0 %	40 %	385245083
98	NC_017439	GAAGA	2	10	130279	130288	60 %	0 %	40 %	0 %	385245083
99	NC_017439	AAAAG	2	10	132192	132201	80 %	0 %	20 %	0 %	385245085
100	NC_017439	GATTC	2	10	132523	132532	20 %	40 %	20 %	20 %	385245085
101	NC_017439	ATTGG	2	10	135808	135817	20 %	40 %	40 %	0 %	385245088
102	NC_017439	TGTTT	2	10	136267	136276	0 %	80 %	20 %	0 %	385245089
103	NC_017439	TCCAG	2	10	140013	140022	20 %	20 %	20 %	40 %	385245095
104	NC_017439	GTACA	2	10	140744	140753	40 %	20 %	20 %	20 %	385245096
105	NC_017439	TAGAT	2	10	141117	141126	40 %	40 %	20 %	0 %	385245096
106	NC_017439	AAAAG	2	10	141529	141538	80 %	0 %	20 %	0 %	385245097
107	NC_017439	AAAAC	2	10	142009	142018	80 %	0 %	0 %	20 %	385245098
108	NC_017439	TGCTA	2	10	143095	143104	20 %	40 %	20 %	20 %	385245100
109	NC_017439	GGAGC	2	10	143142	143151	20 %	0 %	60 %	20 %	385245100
110	NC_017439	CTGGG	2	10	144556	144565	0 %	20 %	60 %	20 %	385245102
111	NC_017439	GTTTT	2	10	145303	145312	0 %	80 %	20 %	0 %	385245103
112	NC_017439	GAACC	2	10	149037	149046	40 %	0 %	20 %	40 %	385245104
113	NC_017439	ATTCT	2	10	152533	152542	20 %	60 %	0 %	20 %	385245108
114	NC_017439	CTGTG	2	10	152737	152746	0 %	40 %	40 %	20 %	385245108
115	NC_017439	TTCTT	2	10	155210	155219	0 %	80 %	0 %	20 %	385245111
116	NC_017439	AGGAA	2	10	159768	159777	60 %	0 %	40 %	0 %	385245115
117	NC_017439	AGAGA	2	10	162999	163008	60 %	0 %	40 %	0 %	385245118
118	NC_017439	AGCAA	2	10	163434	163443	60 %	0 %	20 %	20 %	385245118
119	NC_017439	CAAAA	2	10	166937	166946	80 %	0 %	0 %	20 %	385245120
120	NC_017439	AAGAG	2	10	167770	167779	60 %	0 %	40 %	0 %	385245120
121	NC_017439	GATTG	2	10	168115	168124	20 %	40 %	40 %	0 %	385245120
122	NC_017439	GTTTT	2	10	174597	174606	0 %	80 %	20 %	0 %	385245124
123	NC_017439	TATTG	2	10	174620	174629	20 %	60 %	20 %	0 %	385245124
124	NC_017439	CAGCA	2	10	174979	174988	40 %	0 %	20 %	40 %	385245124
125	NC_017439	TAGGA	2	10	175284	175293	40 %	20 %	40 %	0 %	385245125
126	NC_017439	TGATT	2	10	177211	177220	20 %	60 %	20 %	0 %	385245126
127	NC_017439	TCAAT	2	10	177852	177861	40 %	40 %	0 %	20 %	385245126
128	NC_017439	TTTTC	2	10	177891	177900	0 %	80 %	0 %	20 %	385245126
129	NC_017439	GGAAT	2	10	179457	179466	40 %	20 %	40 %	0 %	385245127
130	NC_017439	AGAGT	2	10	180415	180424	40 %	20 %	40 %	0 %	385245128
131	NC_017439	TTGAA	2	10	180948	180957	40 %	40 %	20 %	0 %	385245129
132	NC_017439	TTGAG	2	10	182508	182517	20 %	40 %	40 %	0 %	385245130
133	NC_017439	GAATG	2	10	182533	182542	40 %	20 %	40 %	0 %	385245130
134	NC_017439	AGAGA	2	10	184576	184585	60 %	0 %	40 %	0 %	385245133
135	NC_017439	GGATC	2	10	189740	189749	20 %	20 %	40 %	20 %	385245136
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