MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/150 chromosome

Total Repeats: 12763

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017439	ATG	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244969
2	NC_017439	GTG	2	6	1342	1347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385244969
3	NC_017439	TCC	2	6	1351	1356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385244969
4	NC_017439	AGC	2	6	1365	1370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244969
5	NC_017439	AGC	2	6	1392	1397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244969
6	NC_017439	AAG	2	6	1403	1408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244969
7	NC_017439	TAC	2	6	1441	1446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244969
8	NC_017439	GCT	2	6	1451	1456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244969
9	NC_017439	AAC	2	6	1549	1554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385244969
10	NC_017439	AGA	2	6	1561	1566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244969
11	NC_017439	AGA	2	6	1817	1822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244970
12	NC_017439	ATC	2	6	1824	1829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244970
13	NC_017439	TGC	2	6	1844	1849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244970
14	NC_017439	CAT	2	6	1968	1973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244970
15	NC_017439	AGA	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244970
16	NC_017439	AAG	2	6	2026	2031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244970
17	NC_017439	GGA	2	6	2061	2066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244970
18	NC_017439	ATC	2	6	2190	2195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244971
19	NC_017439	ATA	2	6	2340	2345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385244971
20	NC_017439	AAC	2	6	2365	2370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385244971
21	NC_017439	GGT	2	6	2419	2424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385244971
22	NC_017439	AAT	2	6	2525	2530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385244971
23	NC_017439	TTC	2	6	2560	2565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244971
24	NC_017439	GCA	2	6	2579	2584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244971
25	NC_017439	GGA	2	6	2627	2632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244971
26	NC_017439	CAG	2	6	2646	2651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244971
27	NC_017439	GTT	2	6	2663	2668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244971
28	NC_017439	GGT	2	6	2755	2760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385244971
29	NC_017439	AAG	2	6	2913	2918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244971
30	NC_017439	ATT	2	6	2975	2980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244971
31	NC_017439	TTG	2	6	3027	3032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244971
32	NC_017439	AAG	2	6	3138	3143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244971
33	NC_017439	AAG	2	6	3153	3158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244971
34	NC_017439	CAG	2	6	3195	3200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244971
35	NC_017439	GCT	2	6	3266	3271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244971
36	NC_017439	AAG	2	6	3432	3437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244971
37	NC_017439	CAG	2	6	3482	3487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244971
38	NC_017439	GGA	2	6	3569	3574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244971
39	NC_017439	AAT	2	6	3579	3584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385244971
40	NC_017439	ATT	2	6	3659	3664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244972
41	NC_017439	TGA	2	6	3689	3694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244972
42	NC_017439	GTA	2	6	3921	3926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244972
43	NC_017439	AGA	2	6	3968	3973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244972
44	NC_017439	GAA	2	6	4152	4157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244972
45	NC_017439	CGT	2	6	4284	4289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244972
46	NC_017439	GTT	2	6	4335	4340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244972
47	NC_017439	TGA	2	6	4472	4477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244972
48	NC_017439	TTG	2	6	4567	4572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244972
49	NC_017439	TTC	2	6	4708	4713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244972
50	NC_017439	TCT	2	6	4800	4805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244972
51	NC_017439	AGA	2	6	4820	4825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244972
52	NC_017439	GTT	2	6	4847	4852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244972
53	NC_017439	GGT	2	6	4895	4900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385244972
54	NC_017439	CTC	2	6	4999	5004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385244972
55	NC_017439	AGC	2	6	5030	5035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244972
56	NC_017439	ATT	2	6	5149	5154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244973
57	NC_017439	TCT	2	6	5167	5172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244973
58	NC_017439	GCT	2	6	5213	5218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244973
59	NC_017439	GAT	2	6	5248	5253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244973
60	NC_017439	ACG	2	6	5286	5291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244973
61	NC_017439	GAA	2	6	5310	5315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244973
62	NC_017439	AGA	3	9	5387	5395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244973
63	NC_017439	GCT	2	6	5396	5401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244973
64	NC_017439	AGA	2	6	5405	5410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244973
65	NC_017439	TGG	2	6	5441	5446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385244973
66	NC_017439	AGA	3	9	5459	5467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244973
67	NC_017439	GGA	2	6	5468	5473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244973
68	NC_017439	TCA	2	6	5653	5658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244973
69	NC_017439	GGA	2	6	5690	5695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244973
70	NC_017439	CTT	2	6	5750	5755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244973
71	NC_017439	CTG	2	6	5756	5761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244973
72	NC_017439	CAG	2	6	5911	5916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244973
73	NC_017439	AGG	2	6	6440	6445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244974
74	NC_017439	GAA	2	6	6484	6489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244974
75	NC_017439	GCA	2	6	6748	6753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244974
76	NC_017439	AAG	2	6	6789	6794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244974
77	NC_017439	TGC	2	6	6822	6827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244974
78	NC_017439	TCG	2	6	7315	7320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244975
79	NC_017439	TCC	2	6	7358	7363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385244975
80	NC_017439	GTT	2	6	7466	7471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244975
81	NC_017439	TTA	2	6	7836	7841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244975
82	NC_017439	TTC	2	6	8159	8164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244975
83	NC_017439	GAA	2	6	8303	8308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244976
84	NC_017439	ACC	2	6	8431	8436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385244976
85	NC_017439	CTT	2	6	8484	8489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244976
86	NC_017439	GAG	2	6	8564	8569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244976
87	NC_017439	ATA	2	6	8581	8586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385244976
88	NC_017439	AGG	2	6	8605	8610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244976
89	NC_017439	GAA	2	6	8785	8790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244976
90	NC_017439	CAG	2	6	8801	8806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244976
91	NC_017439	TGT	2	6	8872	8877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244976
92	NC_017439	GAG	2	6	8887	8892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244976
93	NC_017439	TAC	2	6	8955	8960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244976
94	NC_017439	GTT	2	6	9059	9064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244976
95	NC_017439	AAG	2	6	9083	9088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244976
96	NC_017439	GAG	2	6	9109	9114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244976
97	NC_017439	TTA	2	6	9397	9402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244977
98	NC_017439	AGA	2	6	9432	9437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244977
99	NC_017439	TGC	2	6	9662	9667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244977
100	NC_017439	GAA	2	6	9689	9694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244977
101	NC_017439	TCG	2	6	9749	9754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244977
102	NC_017439	TGG	2	6	9772	9777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385244977
103	NC_017439	GTA	2	6	9823	9828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244978
104	NC_017439	AGC	2	6	9983	9988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244978
105	NC_017439	CTT	2	6	9997	10002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244978
106	NC_017439	ATG	2	6	10158	10163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244978
107	NC_017439	CGT	2	6	10185	10190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244978
108	NC_017439	GAC	2	6	10355	10360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244978
109	NC_017439	GGT	2	6	10442	10447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385244978
110	NC_017439	GAA	2	6	10488	10493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244978
111	NC_017439	CAA	2	6	10510	10515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385244978
112	NC_017439	GGA	2	6	10572	10577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244978
113	NC_017439	CGA	2	6	10629	10634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244978
114	NC_017439	CTT	2	6	10735	10740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244978
115	NC_017439	TTG	2	6	10775	10780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244978
116	NC_017439	CTT	2	6	10789	10794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244978
117	NC_017439	ATC	2	6	10899	10904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244978
118	NC_017439	TGT	2	6	10905	10910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244978
119	NC_017439	AGA	2	6	11011	11016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244978
120	NC_017439	AGG	2	6	11050	11055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244978
121	NC_017439	GAT	2	6	11110	11115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244978
122	NC_017439	CGA	2	6	11116	11121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244978
123	NC_017439	AGG	2	6	11562	11567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244979
124	NC_017439	ATA	3	9	11572	11580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385244979
125	NC_017439	TAT	2	6	11591	11596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244979
126	NC_017439	ACA	2	6	11602	11607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385244979
127	NC_017439	TAC	2	6	11895	11900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244979
128	NC_017439	TCA	2	6	11902	11907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244979
129	NC_017439	TTC	2	6	11940	11945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244979
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