MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/150 chromosome

Total Repeats: 343

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017439	TC	3	6	225	230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017439	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017439	TC	3	6	1670	1675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017439	GA	3	6	6998	7003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017439	TA	3	6	11248	11253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017439	AG	3	6	11309	11314	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017439	TA	3	6	13329	13334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017439	TA	4	8	13553	13560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017439	AG	3	6	17505	17510	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017439	GA	3	6	17518	17523	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017439	CT	3	6	18440	18445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017439	GA	3	6	20664	20669	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017439	AG	3	6	21181	21186	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017439	CT	3	6	21249	21254	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017439	GA	3	6	26501	26506	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017439	CT	3	6	26508	26513	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017439	TC	3	6	27876	27881	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017439	AG	3	6	27959	27964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017439	GA	3	6	36373	36378	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017439	AT	3	6	36475	36480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017439	CT	3	6	38742	38747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017439	CT	3	6	40112	40117	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017439	CT	3	6	42304	42309	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017439	GA	5	10	42579	42588	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017439	AG	3	6	42703	42708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017439	TC	3	6	43795	43800	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017439	AG	3	6	48031	48036	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017439	TG	4	8	51378	51385	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017439	GA	3	6	55702	55707	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017439	CT	3	6	56600	56605	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017439	GT	3	6	56650	56655	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017439	TG	3	6	57288	57293	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017439	CT	3	6	58169	58174	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017439	AG	4	8	64869	64876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017439	TA	3	6	85298	85303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017439	TC	3	6	90519	90524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017439	GA	3	6	90651	90656	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017439	CT	3	6	93001	93006	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017439	GA	3	6	93529	93534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017439	TA	3	6	94145	94150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017439	TC	3	6	100021	100026	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017439	AT	3	6	100072	100077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017439	GC	3	6	102178	102183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017439	TA	3	6	106748	106753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017439	TG	3	6	115990	115995	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017439	CA	3	6	117908	117913	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017439	AG	4	8	118576	118583	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017439	GA	3	6	120398	120403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017439	TA	3	6	122633	122638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017439	GT	3	6	123622	123627	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017439	CT	3	6	128159	128164	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017439	TC	3	6	130481	130486	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017439	TG	3	6	133390	133395	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017439	AG	3	6	138245	138250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017439	GA	3	6	138308	138313	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017439	AT	3	6	142540	142545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017439	AG	3	6	157345	157350	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017439	TC	3	6	171808	171813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017439	AG	3	6	171940	171945	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017439	CT	3	6	171958	171963	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017439	TG	3	6	178449	178454	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017439	GA	3	6	183246	183251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017439	TC	3	6	183653	183658	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017439	GA	3	6	183885	183890	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017439	TG	3	6	185867	185872	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017439	TA	3	6	186285	186290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017439	AT	3	6	192344	192349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017439	AG	3	6	197121	197126	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017439	TC	3	6	200113	200118	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017439	AG	3	6	201945	201950	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017439	CT	3	6	203871	203876	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017439	GA	4	8	206932	206939	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017439	CT	4	8	206980	206987	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017439	AG	4	8	218216	218223	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017439	CA	3	6	218275	218280	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017439	TA	3	6	219770	219775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017439	CT	3	6	221412	221417	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017439	TC	3	6	224413	224418	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017439	AG	3	6	224444	224449	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017439	TC	3	6	238640	238645	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017439	AG	3	6	238666	238671	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017439	CA	3	6	243590	243595	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017439	GT	3	6	243807	243812	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017439	GA	3	6	250674	250679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017439	TG	3	6	250784	250789	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017439	AG	3	6	251586	251591	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017439	AG	3	6	251611	251616	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017439	AG	3	6	252594	252599	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017439	TA	3	6	254400	254405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017439	TC	3	6	256716	256721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017439	AG	3	6	258194	258199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017439	TA	3	6	264554	264559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017439	CA	3	6	266361	266366	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017439	TA	3	6	273814	273819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017439	AT	4	8	284374	284381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017439	CT	3	6	285226	285231	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017439	TC	4	8	285317	285324	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017439	TC	3	6	287008	287013	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017439	TC	3	6	287065	287070	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017439	CT	3	6	287538	287543	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017439	AT	3	6	299553	299558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017439	CA	3	6	301882	301887	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017439	AC	3	6	301923	301928	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017439	GA	3	6	306613	306618	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017439	AG	3	6	315833	315838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017439	CT	3	6	347800	347805	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017439	CT	3	6	350872	350877	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017439	TC	3	6	355098	355103	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017439	CT	3	6	359014	359019	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017439	AC	3	6	362347	362352	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017439	GA	3	6	364259	364264	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017439	TA	3	6	364539	364544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017439	GC	3	6	366068	366073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017439	TC	3	6	366372	366377	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017439	TA	3	6	366442	366447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017439	AC	3	6	367154	367159	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017439	CT	4	8	367326	367333	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017439	CT	3	6	367559	367564	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017439	CA	3	6	367568	367573	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017439	CT	4	8	381655	381662	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017439	CG	3	6	391494	391499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017439	CA	3	6	392544	392549	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017439	TC	3	6	395091	395096	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017439	CT	3	6	395581	395586	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017439	GA	3	6	395711	395716	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017439	GA	3	6	395842	395847	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017439	CT	3	6	410934	410939	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017439	CT	3	6	429662	429667	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017439	CT	3	6	430685	430690	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017439	AG	3	6	431032	431037	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017439	GA	3	6	432727	432732	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017439	AC	3	6	436726	436731	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017439	CT	3	6	441005	441010	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017439	AC	3	6	441043	441048	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017439	CA	3	6	443512	443517	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017439	CT	3	6	444912	444917	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017439	CT	3	6	454194	454199	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017439	CT	3	6	456647	456652	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_017439	AG	3	6	460335	460340	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017439	TC	3	6	466873	466878	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017439	AT	3	6	466942	466947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017439	GA	4	8	468316	468323	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017439	TA	3	6	468359	468364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017439	GA	3	6	468457	468462	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017439	AC	3	6	485766	485771	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017439	GA	4	8	485811	485818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017439	CA	3	6	485848	485853	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_017439	TC	3	6	485889	485894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_017439	AC	3	6	490324	490329	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_017439	AG	3	6	490485	490490	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017439	CT	3	6	490504	490509	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_017439	CT	3	6	493783	493788	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_017439	CT	3	6	494301	494306	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_017439	TG	3	6	494334	494339	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.