MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis A2497 plasmid0001

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017438	CAAT	2	8	468	475	50 %	25 %	0 %	25 %	385270624
2	NC_017438	TAAA	2	8	1108	1115	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017438	TATC	2	8	1294	1301	25 %	50 %	0 %	25 %	385270625
4	NC_017438	GAAG	2	8	1329	1336	50 %	0 %	50 %	0 %	385270625
5	NC_017438	TTGG	2	8	1484	1491	0 %	50 %	50 %	0 %	385270625
6	NC_017438	AACT	2	8	1553	1560	50 %	25 %	0 %	25 %	385270625
7	NC_017438	GGAA	2	8	1811	1818	50 %	0 %	50 %	0 %	385270625
8	NC_017438	CCGA	2	8	2183	2190	25 %	0 %	25 %	50 %	385270626
9	NC_017438	AAAC	2	8	2246	2253	75 %	0 %	0 %	25 %	385270626
10	NC_017438	AATT	2	8	2254	2261	50 %	50 %	0 %	0 %	385270626
11	NC_017438	TGAT	2	8	2469	2476	25 %	50 %	25 %	0 %	385270626
12	NC_017438	GTTT	2	8	3100	3107	0 %	75 %	25 %	0 %	385270628
13	NC_017438	TAAA	2	8	3916	3923	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017438	ATTA	2	8	3949	3956	50 %	50 %	0 %	0 %	385270629
15	NC_017438	TTTA	2	8	4022	4029	25 %	75 %	0 %	0 %	385270629
16	NC_017438	ATCC	2	8	4746	4753	25 %	25 %	0 %	50 %	385270629
17	NC_017438	GAAA	2	8	4866	4873	75 %	0 %	25 %	0 %	385270629
18	NC_017438	TTCC	2	8	5125	5132	0 %	50 %	0 %	50 %	385270630
19	NC_017438	AAAC	2	8	5246	5253	75 %	0 %	0 %	25 %	385270630
20	NC_017438	AAAG	2	8	5770	5777	75 %	0 %	25 %	0 %	385270630
21	NC_017438	TCCT	2	8	6951	6958	0 %	50 %	0 %	50 %	385270631
22	NC_017438	TTTC	2	8	7084	7091	0 %	75 %	0 %	25 %	385270631
23	NC_017438	CAGA	2	8	7110	7117	50 %	0 %	25 %	25 %	385270631

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.