MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis A2497 plasmid0001

Total Repeats: 94

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017438	TTG	2	6	249	254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385270624
2	NC_017438	ACC	2	6	1023	1028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_017438	ACC	2	6	1045	1050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017438	ACC	2	6	1067	1072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_017438	GGA	2	6	1148	1153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017438	TGT	2	6	1185	1190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385270625
7	NC_017438	AGA	2	6	1191	1196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385270625
8	NC_017438	AGG	2	6	1207	1212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385270625
9	NC_017438	ATG	2	6	1233	1238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385270625
10	NC_017438	TTC	2	6	1275	1280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385270625
11	NC_017438	AGA	2	6	1535	1540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385270625
12	NC_017438	GTT	2	6	1578	1583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385270625
13	NC_017438	GAG	2	6	1584	1589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385270625
14	NC_017438	AAG	2	6	1640	1645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385270625
15	NC_017438	TCT	2	6	1704	1709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385270625
16	NC_017438	TTC	2	6	1718	1723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385270625
17	NC_017438	AAT	2	6	1752	1757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385270625
18	NC_017438	TCT	2	6	1822	1827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385270625
19	NC_017438	CTT	2	6	1876	1881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385270625
20	NC_017438	TCT	2	6	1973	1978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385270626
21	NC_017438	TCT	2	6	2015	2020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385270626
22	NC_017438	AAG	2	6	2023	2028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385270626
23	NC_017438	CGA	2	6	2051	2056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385270626
24	NC_017438	ATC	2	6	2131	2136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385270626
25	NC_017438	TTC	3	9	2167	2175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385270626
26	NC_017438	CAA	2	6	2271	2276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385270626
27	NC_017438	CTT	2	6	2280	2285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385270626
28	NC_017438	TAT	2	6	2317	2322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385270626
29	NC_017438	GTT	2	6	2371	2376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385270626
30	NC_017438	ATG	2	6	2424	2429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385270626
31	NC_017438	AGA	2	6	2548	2553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385270626
32	NC_017438	GTT	2	6	2639	2644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385270626
33	NC_017438	TCC	2	6	2653	2658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385270626
34	NC_017438	AAT	2	6	2825	2830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385270627
35	NC_017438	TTG	2	6	2848	2853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385270627
36	NC_017438	TAA	2	6	2988	2993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385270627
37	NC_017438	GTT	2	6	3230	3235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385270628
38	NC_017438	TGA	2	6	3292	3297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385270628
39	NC_017438	AAC	2	6	3352	3357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385270628
40	NC_017438	GCC	2	6	3358	3363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385270628
41	NC_017438	AAT	2	6	3379	3384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385270628
42	NC_017438	CTG	2	6	3387	3392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385270628
43	NC_017438	TCC	2	6	3451	3456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385270628
44	NC_017438	TAA	2	6	3457	3462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385270628
45	NC_017438	TTA	2	6	3506	3511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385270628
46	NC_017438	GTT	2	6	3523	3528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385270628
47	NC_017438	CAA	2	6	3538	3543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385270628
48	NC_017438	TAT	2	6	3591	3596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385270628
49	NC_017438	CAA	2	6	3597	3602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385270628
50	NC_017438	TGA	2	6	3703	3708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385270628
51	NC_017438	ATT	2	6	3709	3714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385270628
52	NC_017438	TGT	2	6	3772	3777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385270628
53	NC_017438	ATT	2	6	3785	3790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385270628
54	NC_017438	TTC	2	6	4007	4012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385270629
55	NC_017438	AGA	2	6	4058	4063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385270629
56	NC_017438	TCT	2	6	4085	4090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385270629
57	NC_017438	TAA	2	6	4220	4225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385270629
58	NC_017438	GCT	2	6	4278	4283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385270629
59	NC_017438	TTC	2	6	4484	4489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385270629
60	NC_017438	CTA	2	6	4552	4557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385270629
61	NC_017438	CTT	2	6	4648	4653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385270629
62	NC_017438	GCT	2	6	4842	4847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385270629
63	NC_017438	TCT	2	6	4943	4948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385270629
64	NC_017438	TGA	2	6	4984	4989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385270629
65	NC_017438	AGA	2	6	5116	5121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385270630
66	NC_017438	TCT	2	6	5384	5389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385270630
67	NC_017438	CTT	2	6	5484	5489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385270630
68	NC_017438	AAT	2	6	5498	5503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385270630
69	NC_017438	TCT	2	6	5504	5509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385270630
70	NC_017438	AAT	2	6	5563	5568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385270630
71	NC_017438	CAA	2	6	5574	5579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385270630
72	NC_017438	GCT	2	6	5690	5695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385270630
73	NC_017438	ATC	2	6	5734	5739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385270630
74	NC_017438	GCT	2	6	5798	5803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385270630
75	NC_017438	TTC	2	6	6013	6018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385270630
76	NC_017438	ATC	2	6	6037	6042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385270630
77	NC_017438	CAT	2	6	6090	6095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385270630
78	NC_017438	ACG	2	6	6136	6141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385270630
79	NC_017438	ATG	2	6	6226	6231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385270630
80	NC_017438	AAC	2	6	6308	6313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385270630
81	NC_017438	AAC	2	6	6400	6405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017438	ATT	2	6	6409	6414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017438	GCA	2	6	6485	6490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385270631
84	NC_017438	TTA	2	6	6592	6597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385270631
85	NC_017438	CAA	2	6	6617	6622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385270631
86	NC_017438	CTT	2	6	6766	6771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385270631
87	NC_017438	AGC	2	6	6797	6802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385270631
88	NC_017438	AGG	2	6	7016	7021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385270631
89	NC_017438	CTC	2	6	7028	7033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385270631
90	NC_017438	CAA	2	6	7071	7076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385270631
91	NC_017438	ATT	2	6	7125	7130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385270631
92	NC_017438	TGG	2	6	7219	7224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385270631
93	NC_017438	GAT	2	6	7388	7393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385270631
94	NC_017438	AGA	2	6	7435	7440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385270631

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.