MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis A2497 chromosome

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017437	CAAAAA	2	12	6846	6857	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017437	AAAAAT	2	12	61433	61444	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017437	ATCTAG	2	12	77156	77167	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017437	TTTTAG	2	12	116420	116431	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017437	TAAAAA	2	12	121017	121028	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017437	AGGATC	2	12	121444	121455	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017437	AGAAAA	2	12	183212	183223	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017437	TATGAA	2	12	196982	196993	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017437	TTTTAC	2	12	222993	223004	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017437	AACCCT	2	12	256708	256719	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017437	AGGAGA	2	12	272605	272616	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017437	ATATTA	2	12	281503	281514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017437	AAAAAG	2	12	325661	325672	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017437	AGAATA	2	12	363136	363147	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017437	CCAATC	2	12	490549	490560	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017437	TAACTA	2	12	504854	504865	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017437	AAGAAA	2	12	504867	504878	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017437	AGAATA	2	12	510842	510853	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017437	AACTAA	2	12	516579	516590	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017437	AAAAAT	2	12	568868	568879	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017437	TAGGGG	2	12	608031	608042	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017437	TTATTT	2	12	651236	651247	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017437	TCTGCA	2	12	747710	747721	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017437	TATTTT	2	12	757188	757199	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017437	GAGAAA	2	12	804639	804650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017437	TTTTCT	2	12	807097	807108	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017437	ATTTTT	2	12	810876	810887	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017437	TTTTTA	2	12	837314	837325	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017437	TGGATG	2	12	857560	857571	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017437	TAAGGA	2	12	858277	858288	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017437	CCGGAG	2	12	859195	859206	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017437	CCTCTA	2	12	872341	872352	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017437	TGGATG	2	12	879607	879618	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017437	TAAGGA	2	12	880324	880335	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017437	CCGGAG	2	12	881242	881253	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017437	AAACAA	2	12	925359	925370	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017437	ATTTTT	2	12	1040728	1040739	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017437	TAAAAT	2	12	1044283	1044294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.