MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis A2497 chromosome

Total Repeats: 764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017437	TGTGA	2	10	3875	3884	20 %	40 %	40 %	0 %	385269645
2	NC_017437	TTGAA	2	10	4231	4240	40 %	40 %	20 %	0 %	385269646
3	NC_017437	GAGAA	2	10	4525	4534	60 %	0 %	40 %	0 %	385269646
4	NC_017437	GAAAA	2	10	4962	4971	80 %	0 %	20 %	0 %	385269646
5	NC_017437	TTACA	2	10	5117	5126	40 %	40 %	0 %	20 %	385269646
6	NC_017437	GTCTT	2	10	5813	5822	0 %	60 %	20 %	20 %	385269647
7	NC_017437	TATTT	2	10	7628	7637	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017437	TGGTA	2	10	8286	8295	20 %	40 %	40 %	0 %	385269650
9	NC_017437	CGAAA	2	10	9694	9703	60 %	0 %	20 %	20 %	385269651
10	NC_017437	GGCTG	2	10	10327	10336	0 %	20 %	60 %	20 %	385269652
11	NC_017437	CCTCT	2	10	11119	11128	0 %	40 %	0 %	60 %	385269653
12	NC_017437	AAAGG	2	10	11278	11287	60 %	0 %	40 %	0 %	385269653
13	NC_017437	AAGAA	2	10	12397	12406	80 %	0 %	20 %	0 %	385269654
14	NC_017437	AAAGA	2	10	13795	13804	80 %	0 %	20 %	0 %	385269655
15	NC_017437	GGTGT	2	10	13899	13908	0 %	40 %	60 %	0 %	385269655
16	NC_017437	GATTT	2	10	15642	15651	20 %	60 %	20 %	0 %	385269658
17	NC_017437	CGTTC	2	10	16753	16762	0 %	40 %	20 %	40 %	385269659
18	NC_017437	GCTTC	2	10	17126	17135	0 %	40 %	20 %	40 %	385269659
19	NC_017437	GAAGG	2	10	17497	17506	40 %	0 %	60 %	0 %	385269659
20	NC_017437	GTTGT	2	10	20923	20932	0 %	60 %	40 %	0 %	385269662
21	NC_017437	AAGAT	2	10	22035	22044	60 %	20 %	20 %	0 %	385269664
22	NC_017437	TTTGC	2	10	22646	22655	0 %	60 %	20 %	20 %	385269664
23	NC_017437	GGAAA	2	10	24400	24409	60 %	0 %	40 %	0 %	385269664
24	NC_017437	AGAGG	2	10	26125	26134	40 %	0 %	60 %	0 %	385269665
25	NC_017437	GGAGA	2	10	27904	27913	40 %	0 %	60 %	0 %	385269666
26	NC_017437	GGATA	2	10	27930	27939	40 %	20 %	40 %	0 %	385269666
27	NC_017437	ATCCG	2	10	28655	28664	20 %	20 %	20 %	40 %	385269668
28	NC_017437	AGGGT	2	10	29173	29182	20 %	20 %	60 %	0 %	385269668
29	NC_017437	CCTAT	2	10	30213	30222	20 %	40 %	0 %	40 %	385269669
30	NC_017437	GAAGG	2	10	31012	31021	40 %	0 %	60 %	0 %	385269670
31	NC_017437	GAGCT	2	10	32052	32061	20 %	20 %	40 %	20 %	385269671
32	NC_017437	AAAGA	2	10	33685	33694	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017437	CTATT	2	10	36725	36734	20 %	60 %	0 %	20 %	385269677
34	NC_017437	TCCTA	2	10	36772	36781	20 %	40 %	0 %	40 %	385269677
35	NC_017437	ACGAT	2	10	38688	38697	40 %	20 %	20 %	20 %	385269678
36	NC_017437	TTTGA	2	10	39053	39062	20 %	60 %	20 %	0 %	385269678
37	NC_017437	AGCAA	2	10	42704	42713	60 %	0 %	20 %	20 %	385269680
38	NC_017437	CGATG	2	10	42761	42770	20 %	20 %	40 %	20 %	385269680
39	NC_017437	CAAAA	2	10	43237	43246	80 %	0 %	0 %	20 %	385269681
40	NC_017437	TTTAT	2	10	44834	44843	20 %	80 %	0 %	0 %	385269687
41	NC_017437	CTTTC	2	10	46930	46939	0 %	60 %	0 %	40 %	385269689
42	NC_017437	AGTTT	2	10	47469	47478	20 %	60 %	20 %	0 %	385269689
43	NC_017437	GAAGA	2	10	48602	48611	60 %	0 %	40 %	0 %	385269689
44	NC_017437	CTATT	2	10	50181	50190	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017437	CTTTT	2	10	50632	50641	0 %	80 %	0 %	20 %	385269693
46	NC_017437	CCGTA	2	10	54297	54306	20 %	20 %	20 %	40 %	385269696
47	NC_017437	AATTT	2	10	54537	54546	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017437	TTATC	2	10	55700	55709	20 %	60 %	0 %	20 %	385269697
49	NC_017437	TGAGT	2	10	55721	55730	20 %	40 %	40 %	0 %	385269697
50	NC_017437	GTTGT	2	10	56756	56765	0 %	60 %	40 %	0 %	385269698
51	NC_017437	GAGCA	2	10	60284	60293	40 %	0 %	40 %	20 %	385269700
52	NC_017437	TGTGA	2	10	62733	62742	20 %	40 %	40 %	0 %	385269703
53	NC_017437	AGTGA	2	10	64254	64263	40 %	20 %	40 %	0 %	385269704
54	NC_017437	CCTTC	2	10	64528	64537	0 %	40 %	0 %	60 %	385269704
55	NC_017437	AGGAG	2	10	66756	66765	40 %	0 %	60 %	0 %	385269706
56	NC_017437	GTTAA	2	10	66886	66895	40 %	40 %	20 %	0 %	385269706
57	NC_017437	CAAGC	2	10	69264	69273	40 %	0 %	20 %	40 %	385269709
58	NC_017437	AAAAG	2	10	69512	69521	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017437	GGAGC	2	10	70134	70143	20 %	0 %	60 %	20 %	385269710
60	NC_017437	GCGAT	2	10	70324	70333	20 %	20 %	40 %	20 %	385269710
61	NC_017437	CTCTT	2	10	70678	70687	0 %	60 %	0 %	40 %	385269710
62	NC_017437	AGGGG	2	10	71324	71333	20 %	0 %	80 %	0 %	385269710
63	NC_017437	AAGAA	2	10	71366	71375	80 %	0 %	20 %	0 %	385269710
64	NC_017437	CTTGC	2	10	72455	72464	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_017437	ATTGG	2	10	72656	72665	20 %	40 %	40 %	0 %	385269712
66	NC_017437	GAAAA	2	10	73728	73737	80 %	0 %	20 %	0 %	385269712
67	NC_017437	TATTT	2	10	76672	76681	20 %	80 %	0 %	0 %	385269714
68	NC_017437	AAAAG	2	10	77205	77214	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017437	ATCAA	2	10	78897	78906	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017437	CTTTC	2	10	80086	80095	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
71	NC_017437	TGTCT	2	10	80459	80468	0 %	60 %	20 %	20 %	385269717
72	NC_017437	TTACT	2	10	80966	80975	20 %	60 %	0 %	20 %	385269717
73	NC_017437	AGAAA	2	10	82356	82365	80 %	0 %	20 %	0 %	385269720
74	NC_017437	GGAAG	2	10	82869	82878	40 %	0 %	60 %	0 %	385269720
75	NC_017437	TTTGT	2	10	85634	85643	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017437	GATCC	2	10	86420	86429	20 %	20 %	20 %	40 %	385269723
77	NC_017437	AGAGC	2	10	87755	87764	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017437	AATAA	2	10	88633	88642	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017437	TTTTC	2	10	91487	91496	0 %	80 %	0 %	20 %	385269726
80	NC_017437	GGATG	2	10	91747	91756	20 %	20 %	60 %	0 %	385269727
81	NC_017437	CAACA	2	10	93286	93295	60 %	0 %	0 %	40 %	385269728
82	NC_017437	TTTAA	2	10	94169	94178	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017437	ACAGC	2	10	94330	94339	40 %	0 %	20 %	40 %	385269730
84	NC_017437	CTTTT	2	10	94704	94713	0 %	80 %	0 %	20 %	385269731
85	NC_017437	GGAAC	2	10	95042	95051	40 %	0 %	40 %	20 %	385269732
86	NC_017437	GGATT	2	10	95942	95951	20 %	40 %	40 %	0 %	385269732
87	NC_017437	CAATC	2	10	97044	97053	40 %	20 %	0 %	40 %	385269734
88	NC_017437	TTTGC	2	10	97178	97187	0 %	60 %	20 %	20 %	385269734
89	NC_017437	ATTCA	2	10	97442	97451	40 %	40 %	0 %	20 %	385269734
90	NC_017437	GATCC	2	10	97701	97710	20 %	20 %	20 %	40 %	385269734
91	NC_017437	GTTTT	2	10	98122	98131	0 %	80 %	20 %	0 %	385269734
92	NC_017437	ACAAA	2	10	98249	98258	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017437	AAGCT	2	10	99325	99334	40 %	20 %	20 %	20 %	385269735
94	NC_017437	AGGGG	2	10	99684	99693	20 %	0 %	80 %	0 %	385269735
95	NC_017437	ATAGC	2	10	100382	100391	40 %	20 %	20 %	20 %	385269736
96	NC_017437	TTCCC	2	10	100986	100995	0 %	40 %	0 %	60 %	385269737
97	NC_017437	AGCGA	2	10	103310	103319	40 %	0 %	40 %	20 %	385269739
98	NC_017437	TTTCT	2	10	103668	103677	0 %	80 %	0 %	20 %	385269739
99	NC_017437	CTTCT	2	10	103722	103731	0 %	60 %	0 %	40 %	385269739
100	NC_017437	ACAGG	2	10	104071	104080	40 %	0 %	40 %	20 %	385269740
101	NC_017437	ATCAT	2	10	104874	104883	40 %	40 %	0 %	20 %	385269740
102	NC_017437	GGCAT	2	10	105582	105591	20 %	20 %	40 %	20 %	385269740
103	NC_017437	AAAGC	2	10	109308	109317	60 %	0 %	20 %	20 %	385269744
104	NC_017437	GCATT	2	10	110468	110477	20 %	40 %	20 %	20 %	385269746
105	NC_017437	GCTCT	2	10	114521	114530	0 %	40 %	20 %	40 %	385269749
106	NC_017437	TGTTT	2	10	115145	115154	0 %	80 %	20 %	0 %	385269750
107	NC_017437	CATGT	2	10	115523	115532	20 %	40 %	20 %	20 %	385269750
108	NC_017437	TATCG	2	10	116227	116236	20 %	40 %	20 %	20 %	385269750
109	NC_017437	TTTCT	2	10	116743	116752	0 %	80 %	0 %	20 %	385269751
110	NC_017437	AAAGA	2	10	118989	118998	80 %	0 %	20 %	0 %	385269754
111	NC_017437	GCTTC	2	10	122979	122988	0 %	40 %	20 %	40 %	385269758
112	NC_017437	TACAA	2	10	126768	126777	60 %	20 %	0 %	20 %	385269762
113	NC_017437	ATCCA	2	10	129173	129182	40 %	20 %	0 %	40 %	385269765
114	NC_017437	GAAGA	2	10	130723	130732	60 %	0 %	40 %	0 %	385269765
115	NC_017437	AAAAG	2	10	132636	132645	80 %	0 %	20 %	0 %	385269768
116	NC_017437	GATTC	2	10	132967	132976	20 %	40 %	20 %	20 %	385269768
117	NC_017437	GGATA	2	10	135573	135582	40 %	20 %	40 %	0 %	385269770
118	NC_017437	ATTGG	2	10	136238	136247	20 %	40 %	40 %	0 %	385269771
119	NC_017437	ATTGT	2	10	136271	136280	20 %	60 %	20 %	0 %	385269771
120	NC_017437	TGTTT	2	10	136697	136706	0 %	80 %	20 %	0 %	385269772
121	NC_017437	TTGCA	2	10	137487	137496	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017437	TCCAG	2	10	140441	140450	20 %	20 %	20 %	40 %	385269779
123	NC_017437	GTACA	2	10	141172	141181	40 %	20 %	20 %	20 %	385269780
124	NC_017437	TAGAT	2	10	141545	141554	40 %	40 %	20 %	0 %	385269780
125	NC_017437	AAAAG	2	10	141957	141966	80 %	0 %	20 %	0 %	385269781
126	NC_017437	AAAAC	2	10	142437	142446	80 %	0 %	0 %	20 %	385269782
127	NC_017437	TGCTA	2	10	143523	143532	20 %	40 %	20 %	20 %	385269784
128	NC_017437	GGAGC	2	10	143570	143579	20 %	0 %	60 %	20 %	385269784
129	NC_017437	CTGGG	2	10	144984	144993	0 %	20 %	60 %	20 %	385269786
130	NC_017437	GTTTT	2	10	145731	145740	0 %	80 %	20 %	0 %	385269787
131	NC_017437	GAACC	2	10	149465	149474	40 %	0 %	20 %	40 %	385269788
132	NC_017437	ATTCT	2	10	152961	152970	20 %	60 %	0 %	20 %	385269792
133	NC_017437	CTGTG	2	10	153165	153174	0 %	40 %	40 %	20 %	385269792
134	NC_017437	TCCGG	2	10	153532	153541	0 %	20 %	40 %	40 %	385269792
135	NC_017437	TTCTT	2	10	155643	155652	0 %	80 %	0 %	20 %	385269796
136	NC_017437	TTCTA	2	10	157748	157757	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017437	AGGAA	2	10	160202	160211	60 %	0 %	40 %	0 %	385269801
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