MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis A2497 chromosome

Total Repeats: 2885

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017437	GGAT	2	8	57	64	25 %	25 %	50 %	0 %	385269642
2	NC_017437	GTTC	2	8	109	116	0 %	50 %	25 %	25 %	385269642
3	NC_017437	GCGT	2	8	294	301	0 %	25 %	50 %	25 %	385269642
4	NC_017437	AGTG	2	8	541	548	25 %	25 %	50 %	0 %	385269642
5	NC_017437	TGGC	2	8	575	582	0 %	25 %	50 %	25 %	385269642
6	NC_017437	AATG	2	8	1060	1067	50 %	25 %	25 %	0 %	385269642
7	NC_017437	CTAT	2	8	1394	1401	25 %	50 %	0 %	25 %	385269642
8	NC_017437	AAGG	2	8	1903	1910	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017437	AGTA	2	8	2083	2090	50 %	25 %	25 %	0 %	385269643
10	NC_017437	ATGA	2	8	2487	2494	50 %	25 %	25 %	0 %	385269644
11	NC_017437	GATA	2	8	2525	2532	50 %	25 %	25 %	0 %	385269644
12	NC_017437	TTTC	2	8	2822	2829	0 %	75 %	0 %	25 %	385269645
13	NC_017437	CATG	2	8	3703	3710	25 %	25 %	25 %	25 %	385269645
14	NC_017437	TTCC	2	8	4008	4015	0 %	50 %	0 %	50 %	385269645
15	NC_017437	TTTA	2	8	4406	4413	25 %	75 %	0 %	0 %	385269646
16	NC_017437	ATCC	2	8	4706	4713	25 %	25 %	0 %	50 %	385269646
17	NC_017437	GACG	2	8	5453	5460	25 %	0 %	50 %	25 %	385269646
18	NC_017437	TTGG	2	8	5556	5563	0 %	50 %	50 %	0 %	385269646
19	NC_017437	TGGA	2	8	5917	5924	25 %	25 %	50 %	0 %	385269647
20	NC_017437	CTTT	2	8	6294	6301	0 %	75 %	0 %	25 %	385269647
21	NC_017437	GGGA	2	8	6809	6816	25 %	0 %	75 %	0 %	385269647
22	NC_017437	GGAG	2	8	6900	6907	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017437	GGTG	2	8	7112	7119	0 %	25 %	75 %	0 %	385269648
24	NC_017437	AAAT	2	8	7178	7185	75 %	25 %	0 %	0 %	385269648
25	NC_017437	TATG	2	8	7549	7556	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017437	ATTT	2	8	7690	7697	25 %	75 %	0 %	0 %	385269649
27	NC_017437	TTTG	2	8	7782	7789	0 %	75 %	25 %	0 %	385269649
28	NC_017437	AAGC	2	8	8416	8423	50 %	0 %	25 %	25 %	385269650
29	NC_017437	ATTG	2	8	8814	8821	25 %	50 %	25 %	0 %	385269651
30	NC_017437	AGCG	2	8	9281	9288	25 %	0 %	50 %	25 %	385269651
31	NC_017437	AAAG	2	8	9302	9309	75 %	0 %	25 %	0 %	385269651
32	NC_017437	CTTT	2	8	9642	9649	0 %	75 %	0 %	25 %	385269651
33	NC_017437	TATT	2	8	9904	9911	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017437	TTCG	2	8	10013	10020	0 %	50 %	25 %	25 %	385269652
35	NC_017437	AATT	2	8	10118	10125	50 %	50 %	0 %	0 %	385269652
36	NC_017437	ATGG	2	8	10177	10184	25 %	25 %	50 %	0 %	385269652
37	NC_017437	CTTT	2	8	10802	10809	0 %	75 %	0 %	25 %	385269653
38	NC_017437	GCAA	2	8	11019	11026	50 %	0 %	25 %	25 %	385269653
39	NC_017437	AGCC	2	8	11249	11256	25 %	0 %	25 %	50 %	385269653
40	NC_017437	GAAA	2	8	11392	11399	75 %	0 %	25 %	0 %	385269653
41	NC_017437	AGAA	2	8	11796	11803	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017437	AATG	2	8	12134	12141	50 %	25 %	25 %	0 %	385269654
43	NC_017437	GTTT	2	8	13166	13173	0 %	75 %	25 %	0 %	385269655
44	NC_017437	ATGC	2	8	13596	13603	25 %	25 %	25 %	25 %	385269655
45	NC_017437	AAGG	2	8	14031	14038	50 %	0 %	50 %	0 %	385269656
46	NC_017437	TTGT	2	8	14632	14639	0 %	75 %	25 %	0 %	385269657
47	NC_017437	TTCT	2	8	14803	14810	0 %	75 %	0 %	25 %	385269657
48	NC_017437	ATTT	2	8	15009	15016	25 %	75 %	0 %	0 %	385269657
49	NC_017437	TTTC	2	8	15671	15678	0 %	75 %	0 %	25 %	385269658
50	NC_017437	AAAT	2	8	16153	16160	75 %	25 %	0 %	0 %	385269658
51	NC_017437	CAAA	2	8	16665	16672	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017437	GTAA	2	8	16995	17002	50 %	25 %	25 %	0 %	385269659
53	NC_017437	CTAA	2	8	17188	17195	50 %	25 %	0 %	25 %	385269659
54	NC_017437	AGAA	2	8	17451	17458	75 %	0 %	25 %	0 %	385269659
55	NC_017437	ATTT	2	8	17597	17604	25 %	75 %	0 %	0 %	385269659
56	NC_017437	TGCG	2	8	19119	19126	0 %	25 %	50 %	25 %	385269661
57	NC_017437	GAAG	2	8	20103	20110	50 %	0 %	50 %	0 %	385269661
58	NC_017437	TTTG	2	8	20129	20136	0 %	75 %	25 %	0 %	385269661
59	NC_017437	TGTA	2	8	20821	20828	25 %	50 %	25 %	0 %	385269662
60	NC_017437	CGCT	2	8	21861	21868	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017437	TTAA	2	8	21882	21889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017437	GTTA	2	8	21919	21926	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017437	GATC	2	8	21974	21981	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017437	GATG	2	8	22237	22244	25 %	25 %	50 %	0 %	385269664
65	NC_017437	TTCT	2	8	22935	22942	0 %	75 %	0 %	25 %	385269664
66	NC_017437	CATT	2	8	23296	23303	25 %	50 %	0 %	25 %	385269664
67	NC_017437	GCTT	2	8	23639	23646	0 %	50 %	25 %	25 %	385269664
68	NC_017437	GGTT	2	8	23687	23694	0 %	50 %	50 %	0 %	385269664
69	NC_017437	TTCT	2	8	24057	24064	0 %	75 %	0 %	25 %	385269664
70	NC_017437	TAAC	2	8	24159	24166	50 %	25 %	0 %	25 %	385269664
71	NC_017437	CATT	2	8	24282	24289	25 %	50 %	0 %	25 %	385269664
72	NC_017437	GGTA	2	8	24652	24659	25 %	25 %	50 %	0 %	385269664
73	NC_017437	TTCG	2	8	25792	25799	0 %	50 %	25 %	25 %	385269665
74	NC_017437	TAGG	2	8	25871	25878	25 %	25 %	50 %	0 %	385269665
75	NC_017437	TTCC	2	8	25995	26002	0 %	50 %	0 %	50 %	385269665
76	NC_017437	TAGG	2	8	26109	26116	25 %	25 %	50 %	0 %	385269665
77	NC_017437	GCTT	2	8	26881	26888	0 %	50 %	25 %	25 %	385269665
78	NC_017437	GGAA	2	8	27464	27471	50 %	0 %	50 %	0 %	385269666
79	NC_017437	TTAA	2	8	27537	27544	50 %	50 %	0 %	0 %	385269666
80	NC_017437	AAAG	2	8	27587	27594	75 %	0 %	25 %	0 %	385269666
81	NC_017437	GGGC	2	8	27867	27874	0 %	0 %	75 %	25 %	385269666
82	NC_017437	CAGA	2	8	28172	28179	50 %	0 %	25 %	25 %	385269667
83	NC_017437	ATTG	2	8	28531	28538	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017437	CTTT	2	8	30144	30151	0 %	75 %	0 %	25 %	385269669
85	NC_017437	TTTG	2	8	30159	30166	0 %	75 %	25 %	0 %	385269669
86	NC_017437	TTGT	2	8	30194	30201	0 %	75 %	25 %	0 %	385269669
87	NC_017437	TGGC	2	8	30357	30364	0 %	25 %	50 %	25 %	385269669
88	NC_017437	AAAG	2	8	30917	30924	75 %	0 %	25 %	0 %	385269670
89	NC_017437	AAAC	2	8	30987	30994	75 %	0 %	0 %	25 %	385269670
90	NC_017437	GATG	2	8	31130	31137	25 %	25 %	50 %	0 %	385269670
91	NC_017437	GATA	2	8	32239	32246	50 %	25 %	25 %	0 %	385269672
92	NC_017437	TGAT	2	8	34733	34740	25 %	50 %	25 %	0 %	385269675
93	NC_017437	AAGA	3	12	34861	34872	75 %	0 %	25 %	0 %	385269675
94	NC_017437	AAGC	2	8	35081	35088	50 %	0 %	25 %	25 %	385269676
95	NC_017437	GTTC	2	8	35114	35121	0 %	50 %	25 %	25 %	385269676
96	NC_017437	GGCA	2	8	35493	35500	25 %	0 %	50 %	25 %	385269677
97	NC_017437	TCGA	2	8	35750	35757	25 %	25 %	25 %	25 %	385269677
98	NC_017437	TGCT	2	8	35903	35910	0 %	50 %	25 %	25 %	385269677
99	NC_017437	TATG	2	8	36046	36053	25 %	50 %	25 %	0 %	385269677
100	NC_017437	TTGG	2	8	36135	36142	0 %	50 %	50 %	0 %	385269677
101	NC_017437	AGAT	2	8	36855	36862	50 %	25 %	25 %	0 %	385269677
102	NC_017437	CTTT	2	8	37228	37235	0 %	75 %	0 %	25 %	385269678
103	NC_017437	ATGA	2	8	37718	37725	50 %	25 %	25 %	0 %	385269678
104	NC_017437	TAGG	2	8	37877	37884	25 %	25 %	50 %	0 %	385269678
105	NC_017437	CAAT	2	8	38061	38068	50 %	25 %	0 %	25 %	385269678
106	NC_017437	AATG	2	8	38848	38855	50 %	25 %	25 %	0 %	385269678
107	NC_017437	AGAA	2	8	39685	39692	75 %	0 %	25 %	0 %	385269679
108	NC_017437	AAGA	2	8	39737	39744	75 %	0 %	25 %	0 %	385269679
109	NC_017437	ATCC	2	8	39745	39752	25 %	25 %	0 %	50 %	385269679
110	NC_017437	TAAT	2	8	39956	39963	50 %	50 %	0 %	0 %	385269679
111	NC_017437	GTGC	2	8	42045	42052	0 %	25 %	50 %	25 %	385269680
112	NC_017437	AGAA	2	8	42464	42471	75 %	0 %	25 %	0 %	385269680
113	NC_017437	GGAT	2	8	42616	42623	25 %	25 %	50 %	0 %	385269680
114	NC_017437	AAAC	2	8	43824	43831	75 %	0 %	0 %	25 %	385269685
115	NC_017437	CAAT	2	8	44028	44035	50 %	25 %	0 %	25 %	385269685
116	NC_017437	TGTT	2	8	44408	44415	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017437	AATA	2	8	44647	44654	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017437	ATTT	2	8	44785	44792	25 %	75 %	0 %	0 %	385269687
119	NC_017437	GCTC	2	8	45093	45100	0 %	25 %	25 %	50 %	385269687
120	NC_017437	TTCT	2	8	45235	45242	0 %	75 %	0 %	25 %	385269687
121	NC_017437	TTGA	2	8	45835	45842	25 %	50 %	25 %	0 %	385269688
122	NC_017437	TGTT	2	8	46007	46014	0 %	75 %	25 %	0 %	385269688
123	NC_017437	CTAT	2	8	46037	46044	25 %	50 %	0 %	25 %	385269688
124	NC_017437	TGTT	2	8	46066	46073	0 %	75 %	25 %	0 %	385269688
125	NC_017437	CTAT	2	8	46362	46369	25 %	50 %	0 %	25 %	385269688
126	NC_017437	AAGA	2	8	46857	46864	75 %	0 %	25 %	0 %	385269689
127	NC_017437	AAGA	2	8	46914	46921	75 %	0 %	25 %	0 %	385269689
128	NC_017437	AAAG	2	8	46954	46961	75 %	0 %	25 %	0 %	385269689
129	NC_017437	AAGA	2	8	47069	47076	75 %	0 %	25 %	0 %	385269689
130	NC_017437	ACTT	2	8	47330	47337	25 %	50 %	0 %	25 %	385269689
131	NC_017437	ATGG	2	8	47956	47963	25 %	25 %	50 %	0 %	385269689
132	NC_017437	AGGA	2	8	47987	47994	50 %	0 %	50 %	0 %	385269689
133	NC_017437	GAAC	2	8	48534	48541	50 %	0 %	25 %	25 %	385269689
134	NC_017437	AAGT	2	8	48569	48576	50 %	25 %	25 %	0 %	385269689
135	NC_017437	AACA	2	8	48778	48785	75 %	0 %	0 %	25 %	385269690
136	NC_017437	CTTT	2	8	48974	48981	0 %	75 %	0 %	25 %	385269690
137	NC_017437	CTTT	2	8	49859	49866	0 %	75 %	0 %	25 %	385269692
138	NC_017437	GTAG	2	8	49877	49884	25 %	25 %	50 %	0 %	385269692
139	NC_017437	GAAG	2	8	51305	51312	50 %	0 %	50 %	0 %	385269693
140	NC_017437	TTCA	2	8	51727	51734	25 %	50 %	0 %	25 %	385269693
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