MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis D-LC chromosome

Total Repeats: 2363

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017436	TC	3	6	225	230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017436	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017436	TC	3	6	1670	1675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017436	AG	3	6	2153	2158	50 %	0 %	50 %	0 %	385244091
5	NC_017436	GA	3	6	2821	2826	50 %	0 %	50 %	0 %	385244091
6	NC_017436	AT	3	6	4514	4519	50 %	50 %	0 %	0 %	385244092
7	NC_017436	TC	3	6	5264	5269	0 %	50 %	0 %	50 %	385244093
8	NC_017436	GA	3	6	5275	5280	50 %	0 %	50 %	0 %	385244093
9	NC_017436	AT	3	6	5379	5384	50 %	50 %	0 %	0 %	385244093
10	NC_017436	TG	3	6	5532	5537	0 %	50 %	50 %	0 %	385244093
11	NC_017436	AG	3	6	5940	5945	50 %	0 %	50 %	0 %	385244093
12	NC_017436	GA	3	6	6998	7003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017436	AC	3	6	7648	7653	50 %	0 %	0 %	50 %	385244095
14	NC_017436	AG	3	6	8391	8396	50 %	0 %	50 %	0 %	385244096
15	NC_017436	CT	4	8	8510	8517	0 %	50 %	0 %	50 %	385244096
16	NC_017436	GT	3	6	8592	8597	0 %	50 %	50 %	0 %	385244096
17	NC_017436	GA	3	6	9866	9871	50 %	0 %	50 %	0 %	385244098
18	NC_017436	AG	3	6	10083	10088	50 %	0 %	50 %	0 %	385244098
19	NC_017436	TA	3	6	11248	11253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017436	AG	3	6	11309	11314	50 %	0 %	50 %	0 %	385244099
21	NC_017436	TA	3	6	11869	11874	50 %	50 %	0 %	0 %	385244099
22	NC_017436	TG	3	6	12772	12777	0 %	50 %	50 %	0 %	385244100
23	NC_017436	AG	3	6	12921	12926	50 %	0 %	50 %	0 %	385244100
24	NC_017436	AG	4	8	13077	13084	50 %	0 %	50 %	0 %	385244100
25	NC_017436	TA	3	6	13339	13344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017436	TA	4	8	13563	13570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017436	AC	3	6	14406	14411	50 %	0 %	0 %	50 %	385244101
28	NC_017436	AG	3	6	15745	15750	50 %	0 %	50 %	0 %	385244102
29	NC_017436	TC	3	6	15785	15790	0 %	50 %	0 %	50 %	385244102
30	NC_017436	GA	3	6	16314	16319	50 %	0 %	50 %	0 %	385244103
31	NC_017436	AG	3	6	16385	16390	50 %	0 %	50 %	0 %	385244103
32	NC_017436	GA	3	6	17169	17174	50 %	0 %	50 %	0 %	385244103
33	NC_017436	AG	3	6	17515	17520	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017436	GA	3	6	17528	17533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017436	GA	3	6	17772	17777	50 %	0 %	50 %	0 %	385244104
36	NC_017436	TC	3	6	18222	18227	0 %	50 %	0 %	50 %	385244104
37	NC_017436	CT	3	6	18450	18455	0 %	50 %	0 %	50 %	385244105
38	NC_017436	TC	3	6	18650	18655	0 %	50 %	0 %	50 %	385244105
39	NC_017436	GA	3	6	18665	18670	50 %	0 %	50 %	0 %	385244105
40	NC_017436	GA	3	6	18764	18769	50 %	0 %	50 %	0 %	385244105
41	NC_017436	AG	3	6	19230	19235	50 %	0 %	50 %	0 %	385244105
42	NC_017436	AG	4	8	19516	19523	50 %	0 %	50 %	0 %	385244105
43	NC_017436	GT	3	6	19779	19784	0 %	50 %	50 %	0 %	385244105
44	NC_017436	AG	3	6	20007	20012	50 %	0 %	50 %	0 %	385244106
45	NC_017436	TG	3	6	20120	20125	0 %	50 %	50 %	0 %	385244106
46	NC_017436	AG	3	6	20516	20521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017436	GA	3	6	20674	20679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017436	AG	3	6	21191	21196	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017436	CT	3	6	21260	21265	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017436	CT	4	8	21917	21924	0 %	50 %	0 %	50 %	385244107
51	NC_017436	AT	3	6	22187	22192	50 %	50 %	0 %	0 %	385244107
52	NC_017436	AT	3	6	22511	22516	50 %	50 %	0 %	0 %	385244107
53	NC_017436	GA	3	6	23830	23835	50 %	0 %	50 %	0 %	385244107
54	NC_017436	GA	3	6	23922	23927	50 %	0 %	50 %	0 %	385244107
55	NC_017436	AG	3	6	24303	24308	50 %	0 %	50 %	0 %	385244107
56	NC_017436	GA	3	6	25720	25725	50 %	0 %	50 %	0 %	385244108
57	NC_017436	GT	3	6	25740	25745	0 %	50 %	50 %	0 %	385244108
58	NC_017436	TA	3	6	25942	25947	50 %	50 %	0 %	0 %	385244108
59	NC_017436	GA	3	6	26388	26393	50 %	0 %	50 %	0 %	385244108
60	NC_017436	GA	3	6	26512	26517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017436	CT	3	6	26519	26524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017436	AT	3	6	26805	26810	50 %	50 %	0 %	0 %	385244109
63	NC_017436	GA	3	6	27019	27024	50 %	0 %	50 %	0 %	385244109
64	NC_017436	TC	3	6	27887	27892	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017436	AG	3	6	27970	27975	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017436	TG	3	6	28393	28398	0 %	50 %	50 %	0 %	385244111
67	NC_017436	TC	3	6	28446	28451	0 %	50 %	0 %	50 %	385244111
68	NC_017436	GC	4	8	28860	28867	0 %	0 %	50 %	50 %	385244111
69	NC_017436	TA	3	6	28982	28987	50 %	50 %	0 %	0 %	385244111
70	NC_017436	GA	3	6	29933	29938	50 %	0 %	50 %	0 %	385244112
71	NC_017436	AG	3	6	30031	30036	50 %	0 %	50 %	0 %	385244113
72	NC_017436	TC	3	6	30140	30145	0 %	50 %	0 %	50 %	385244113
73	NC_017436	GA	3	6	30761	30766	50 %	0 %	50 %	0 %	385244113
74	NC_017436	GA	3	6	31229	31234	50 %	0 %	50 %	0 %	385244113
75	NC_017436	AT	3	6	31370	31375	50 %	50 %	0 %	0 %	385244114
76	NC_017436	TC	3	6	31655	31660	0 %	50 %	0 %	50 %	385244115
77	NC_017436	GC	3	6	32085	32090	0 %	0 %	50 %	50 %	385244115
78	NC_017436	CT	3	6	32135	32140	0 %	50 %	0 %	50 %	385244115
79	NC_017436	AG	3	6	32267	32272	50 %	0 %	50 %	0 %	385244115
80	NC_017436	TC	3	6	33764	33769	0 %	50 %	0 %	50 %	385244117
81	NC_017436	AG	3	6	33777	33782	50 %	0 %	50 %	0 %	385244117
82	NC_017436	AG	3	6	33915	33920	50 %	0 %	50 %	0 %	385244118
83	NC_017436	GA	4	8	34607	34614	50 %	0 %	50 %	0 %	385244119
84	NC_017436	GA	4	8	34631	34638	50 %	0 %	50 %	0 %	385244119
85	NC_017436	GA	3	6	36384	36389	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017436	AT	3	6	36486	36491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017436	GA	3	6	36534	36539	50 %	0 %	50 %	0 %	385244121
88	NC_017436	CT	3	6	37018	37023	0 %	50 %	0 %	50 %	385244121
89	NC_017436	AG	3	6	37529	37534	50 %	0 %	50 %	0 %	385244121
90	NC_017436	AG	3	6	38075	38080	50 %	0 %	50 %	0 %	385244121
91	NC_017436	AG	3	6	38602	38607	50 %	0 %	50 %	0 %	385244121
92	NC_017436	CT	3	6	38753	38758	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017436	GA	3	6	39386	39391	50 %	0 %	50 %	0 %	385244122
94	NC_017436	AG	3	6	39523	39528	50 %	0 %	50 %	0 %	385244122
95	NC_017436	AG	3	6	39623	39628	50 %	0 %	50 %	0 %	385244122
96	NC_017436	CT	3	6	40124	40129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017436	AG	3	6	40600	40605	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017436	GC	3	6	40649	40654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017436	GA	3	6	40814	40819	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017436	TC	3	6	40823	40828	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017436	GC	3	6	40888	40893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017436	GA	3	6	41028	41033	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017436	GT	3	6	41466	41471	0 %	50 %	50 %	0 %	385244123
104	NC_017436	GA	3	6	42004	42009	50 %	0 %	50 %	0 %	385244123
105	NC_017436	GA	4	8	42014	42021	50 %	0 %	50 %	0 %	385244123
106	NC_017436	AG	3	6	42250	42255	50 %	0 %	50 %	0 %	385244123
107	NC_017436	CT	3	6	42316	42321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017436	GA	5	10	42592	42601	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017436	AC	3	6	43474	43479	50 %	0 %	0 %	50 %	385244125
110	NC_017436	TC	3	6	43643	43648	0 %	50 %	0 %	50 %	385244125
111	NC_017436	TC	3	6	43808	43813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017436	TA	3	6	43961	43966	50 %	50 %	0 %	0 %	385244126
113	NC_017436	TC	3	6	44873	44878	0 %	50 %	0 %	50 %	385244127
114	NC_017436	GA	3	6	45356	45361	50 %	0 %	50 %	0 %	385244128
115	NC_017436	TG	3	6	45574	45579	0 %	50 %	50 %	0 %	385244128
116	NC_017436	AG	3	6	45585	45590	50 %	0 %	50 %	0 %	385244128
117	NC_017436	AG	4	8	46026	46033	50 %	0 %	50 %	0 %	385244129
118	NC_017436	CT	3	6	46217	46222	0 %	50 %	0 %	50 %	385244129
119	NC_017436	TG	3	6	46418	46423	0 %	50 %	50 %	0 %	385244129
120	NC_017436	AG	3	6	46471	46476	50 %	0 %	50 %	0 %	385244129
121	NC_017436	AG	3	6	48043	48048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017436	AG	3	6	49395	49400	50 %	0 %	50 %	0 %	385244131
123	NC_017436	CA	3	6	50061	50066	50 %	0 %	0 %	50 %	385244132
124	NC_017436	TG	4	8	51391	51398	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017436	TC	3	6	52904	52909	0 %	50 %	0 %	50 %	385244134
126	NC_017436	CA	3	6	52955	52960	50 %	0 %	0 %	50 %	385244134
127	NC_017436	GA	3	6	53376	53381	50 %	0 %	50 %	0 %	385244135
128	NC_017436	CT	3	6	53693	53698	0 %	50 %	0 %	50 %	385244135
129	NC_017436	CT	3	6	54356	54361	0 %	50 %	0 %	50 %	385244136
130	NC_017436	GA	3	6	55601	55606	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017436	AG	3	6	55881	55886	50 %	0 %	50 %	0 %	385244137
132	NC_017436	TG	3	6	57118	57123	0 %	50 %	50 %	0 %	385244137
133	NC_017436	CT	3	6	57999	58004	0 %	50 %	0 %	50 %	385244138
134	NC_017436	GA	3	6	59565	59570	50 %	0 %	50 %	0 %	385244139
135	NC_017436	GT	3	6	59703	59708	0 %	50 %	50 %	0 %	385244139
136	NC_017436	TC	3	6	60451	60456	0 %	50 %	0 %	50 %	385244140
137	NC_017436	GA	3	6	60679	60684	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017436	CA	3	6	61077	61082	50 %	0 %	0 %	50 %	385244141
139	NC_017436	AT	3	6	61327	61332	50 %	50 %	0 %	0 %	385244141
140	NC_017436	GA	3	6	61350	61355	50 %	0 %	50 %	0 %	385244141
141	NC_017436	GA	3	6	61476	61481	50 %	0 %	50 %	0 %	385244141
142	NC_017436	GA	3	6	62291	62296	50 %	0 %	50 %	0 %	385244141
143	NC_017436	GA	3	6	62556	62561	50 %	0 %	50 %	0 %	385244141
144	NC_017436	TC	3	6	62712	62717	0 %	50 %	0 %	50 %	385244141
145	NC_017436	AT	3	6	62893	62898	50 %	50 %	0 %	0 %	385244141
146	NC_017436	AG	3	6	63093	63098	50 %	0 %	50 %	0 %	385244141
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