MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D-LC chromosome

Total Repeats: 342

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017436	TC	3	6	225	230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017436	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017436	TC	3	6	1670	1675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017436	GA	3	6	6998	7003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017436	TA	3	6	11248	11253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017436	TA	3	6	13339	13344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017436	TA	4	8	13563	13570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017436	AG	3	6	17515	17520	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017436	GA	3	6	17528	17533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017436	AG	3	6	20516	20521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017436	GA	3	6	20674	20679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017436	AG	3	6	21191	21196	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017436	CT	3	6	21260	21265	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017436	GA	3	6	26512	26517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017436	CT	3	6	26519	26524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017436	TC	3	6	27887	27892	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017436	AG	3	6	27970	27975	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017436	GA	3	6	36384	36389	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017436	AT	3	6	36486	36491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017436	CT	3	6	38753	38758	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017436	CT	3	6	40124	40129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017436	AG	3	6	40600	40605	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017436	GC	3	6	40649	40654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017436	GA	3	6	40814	40819	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017436	TC	3	6	40823	40828	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017436	GC	3	6	40888	40893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017436	GA	3	6	41028	41033	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017436	CT	3	6	42316	42321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017436	GA	5	10	42592	42601	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017436	TC	3	6	43808	43813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017436	AG	3	6	48043	48048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017436	TG	4	8	51391	51398	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017436	GA	3	6	55601	55606	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017436	GA	3	6	60679	60684	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017436	AG	4	8	64704	64711	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017436	TA	3	6	69035	69040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017436	CT	3	6	71771	71776	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017436	TA	3	6	85132	85137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017436	TG	3	6	87221	87226	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017436	GA	3	6	90485	90490	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017436	CT	3	6	92835	92840	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017436	GA	3	6	93363	93368	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017436	AT	3	6	99912	99917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017436	TA	3	6	106588	106593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017436	TG	3	6	115830	115835	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017436	AG	4	8	118417	118424	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017436	GA	3	6	120239	120244	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017436	TA	3	6	122474	122479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017436	CT	3	6	127996	128001	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017436	TC	3	6	130318	130323	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017436	AG	3	6	130395	130400	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017436	AG	3	6	130420	130425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017436	AT	3	6	142376	142381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017436	GA	3	6	151614	151619	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017436	AG	3	6	157181	157186	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017436	TC	3	6	171645	171650	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017436	AG	3	6	171777	171782	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017436	CT	3	6	171795	171800	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017436	TG	3	6	178286	178291	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017436	GA	3	6	183772	183777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017436	TC	3	6	191887	191892	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017436	AT	3	6	192229	192234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017436	AG	3	6	196701	196706	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017436	CT	3	6	203450	203455	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017436	GA	4	8	206509	206516	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017436	CT	4	8	206557	206564	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017436	AG	4	8	217830	217837	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017436	TA	3	6	219384	219389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017436	CT	3	6	221024	221029	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017436	TC	3	6	224025	224030	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017436	AG	3	6	224056	224061	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017436	CA	3	6	243206	243211	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017436	GT	3	6	243423	243428	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017436	GA	3	6	250291	250296	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017436	TG	3	6	250401	250406	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017436	AG	3	6	251203	251208	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017436	AG	3	6	252212	252217	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017436	TA	3	6	254018	254023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017436	AG	3	6	256299	256304	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017436	TC	3	6	256325	256330	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017436	AG	3	6	257803	257808	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017436	TA	3	6	264166	264171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017436	TC	3	6	267873	267878	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017436	TA	3	6	273426	273431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017436	AT	4	8	283986	283993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017436	CT	3	6	284838	284843	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017436	TC	4	8	284929	284936	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017436	TC	3	6	286620	286625	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017436	TC	3	6	286677	286682	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017436	CT	3	6	287150	287155	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017436	AT	3	6	299168	299173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017436	CA	3	6	301497	301502	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017436	GA	3	6	306228	306233	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017436	TA	3	6	307921	307926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017436	GA	3	6	308129	308134	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017436	TG	3	6	308339	308344	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017436	TG	3	6	308361	308366	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017436	AG	3	6	315434	315439	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017436	CT	3	6	347385	347390	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017436	CT	3	6	350456	350461	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017436	TC	3	6	354682	354687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017436	TC	3	6	358512	358517	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017436	CT	3	6	358598	358603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017436	AC	3	6	361931	361936	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017436	GA	3	6	363841	363846	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017436	TC	3	6	363919	363924	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017436	TA	3	6	364120	364125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017436	GT	3	6	367380	367385	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017436	CT	4	8	381148	381155	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017436	GA	3	6	385855	385860	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017436	CA	3	6	392036	392041	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017436	TC	3	6	394583	394588	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017436	CT	3	6	395073	395078	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017436	GA	3	6	395203	395208	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017436	GA	3	6	395334	395339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017436	CT	3	6	410417	410422	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017436	CT	3	6	429147	429152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017436	AG	3	6	430517	430522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017436	GA	3	6	432212	432217	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017436	AC	3	6	436210	436215	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017436	CT	3	6	440481	440486	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017436	AC	3	6	440519	440524	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017436	CA	3	6	442988	442993	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017436	CT	3	6	444392	444397	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017436	CT	3	6	453674	453679	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017436	AG	3	6	459815	459820	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017436	TC	3	6	466353	466358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017436	AT	3	6	466422	466427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017436	GA	4	8	467796	467803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017436	TA	3	6	467839	467844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017436	GA	3	6	467937	467942	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017436	TC	3	6	479669	479674	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017436	AC	3	6	485200	485205	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017436	GA	4	8	485245	485252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017436	CA	3	6	485282	485287	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017436	TC	3	6	485323	485328	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017436	AG	3	6	488688	488693	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017436	GC	3	6	488936	488941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_017436	AC	3	6	489758	489763	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_017436	AG	3	6	489920	489925	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017436	CT	3	6	489939	489944	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017436	GA	3	6	491316	491321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017436	CT	3	6	493218	493223	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_017436	CT	3	6	493736	493741	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017436	TG	3	6	493769	493774	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017436	TA	3	6	493882	493887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017436	CT	4	8	499539	499546	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_017436	CT	3	6	508547	508552	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_017436	TA	3	6	514350	514355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017436	AG	3	6	516248	516253	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017436	TC	3	6	517094	517099	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_017436	GA	3	6	517249	517254	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017436	AG	3	6	517285	517290	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017436	AT	3	6	523517	523522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.