MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D-EC plasmid pCTDEC1

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017435	CAAT	2	8	468	475	50 %	25 %	0 %	25 %	385244079
2	NC_017435	TATC	2	8	1316	1323	25 %	50 %	0 %	25 %	385244080
3	NC_017435	GAAG	2	8	1351	1358	50 %	0 %	50 %	0 %	385244080
4	NC_017435	TTGG	2	8	1506	1513	0 %	50 %	50 %	0 %	385244080
5	NC_017435	AACT	2	8	1575	1582	50 %	25 %	0 %	25 %	385244080
6	NC_017435	GGAA	2	8	1833	1840	50 %	0 %	50 %	0 %	385244080
7	NC_017435	CCGA	2	8	2205	2212	25 %	0 %	25 %	50 %	385244081
8	NC_017435	AATT	2	8	2276	2283	50 %	50 %	0 %	0 %	385244081
9	NC_017435	TGAT	2	8	2491	2498	25 %	50 %	25 %	0 %	385244081
10	NC_017435	GTTT	2	8	3122	3129	0 %	75 %	25 %	0 %	385244083
11	NC_017435	ATTA	2	8	3971	3978	50 %	50 %	0 %	0 %	385244084
12	NC_017435	TTTA	2	8	4035	4042	25 %	75 %	0 %	0 %	385244084
13	NC_017435	ATCC	2	8	4759	4766	25 %	25 %	0 %	50 %	385244084
14	NC_017435	GAAA	2	8	4879	4886	75 %	0 %	25 %	0 %	385244084
15	NC_017435	TTCC	2	8	5138	5145	0 %	50 %	0 %	50 %	385244085
16	NC_017435	AAAC	2	8	5259	5266	75 %	0 %	0 %	25 %	385244085
17	NC_017435	AAAG	2	8	5783	5790	75 %	0 %	25 %	0 %	385244085
18	NC_017435	TCCT	2	8	6964	6971	0 %	50 %	0 %	50 %	385244086
19	NC_017435	TTTC	2	8	7097	7104	0 %	75 %	0 %	25 %	385244086
20	NC_017435	CAGA	2	8	7123	7130	50 %	0 %	25 %	25 %	385244086

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.