MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis D-EC plasmid pCTDEC1

Total Repeats: 17

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017435	AC	4	8	82	89	50 %	0 %	0 %	50 %	385244079
2	NC_017435	GA	3	6	101	106	50 %	0 %	50 %	0 %	385244079
3	NC_017435	AT	3	6	626	631	50 %	50 %	0 %	0 %	385244079
4	NC_017435	TC	4	8	1107	1114	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017435	TA	5	10	1138	1147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017435	AT	5	10	1152	1161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017435	AT	3	6	1459	1464	50 %	50 %	0 %	0 %	385244080
8	NC_017435	GA	3	6	2060	2065	50 %	0 %	50 %	0 %	385244081
9	NC_017435	TA	3	6	2126	2131	50 %	50 %	0 %	0 %	385244081
10	NC_017435	AG	3	6	4062	4067	50 %	0 %	50 %	0 %	385244084
11	NC_017435	AT	3	6	4204	4209	50 %	50 %	0 %	0 %	385244084
12	NC_017435	AT	3	6	5311	5316	50 %	50 %	0 %	0 %	385244085
13	NC_017435	AG	3	6	5525	5530	50 %	0 %	50 %	0 %	385244085
14	NC_017435	AT	3	6	5863	5868	50 %	50 %	0 %	0 %	385244085
15	NC_017435	AC	3	6	6038	6043	50 %	0 %	0 %	50 %	385244085
16	NC_017435	TA	3	6	6380	6385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017435	TC	3	6	7262	7267	0 %	50 %	0 %	50 %	385244086

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.