MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D-EC plasmid pCTDEC1

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017435	T	7	7	375	381	0 %	100 %	0 %	0 %	385244079
2	NC_017435	A	6	6	409	414	100 %	0 %	0 %	0 %	385244079
3	NC_017435	A	8	8	520	527	100 %	0 %	0 %	0 %	385244079
4	NC_017435	A	6	6	580	585	100 %	0 %	0 %	0 %	385244079
5	NC_017435	T	6	6	845	850	0 %	100 %	0 %	0 %	385244079
6	NC_017435	T	6	6	1649	1654	0 %	100 %	0 %	0 %	385244080
7	NC_017435	T	8	8	1876	1883	0 %	100 %	0 %	0 %	385244080
8	NC_017435	A	6	6	1884	1889	100 %	0 %	0 %	0 %	385244080
9	NC_017435	T	7	7	1902	1908	0 %	100 %	0 %	0 %	385244080
10	NC_017435	A	6	6	2089	2094	100 %	0 %	0 %	0 %	385244081
11	NC_017435	T	7	7	2474	2480	0 %	100 %	0 %	0 %	385244081
12	NC_017435	T	6	6	2612	2617	0 %	100 %	0 %	0 %	385244081
13	NC_017435	A	6	6	2692	2697	100 %	0 %	0 %	0 %	385244081
14	NC_017435	T	6	6	2793	2798	0 %	100 %	0 %	0 %	385244082
15	NC_017435	T	6	6	2987	2992	0 %	100 %	0 %	0 %	385244082
16	NC_017435	A	6	6	3144	3149	100 %	0 %	0 %	0 %	385244083
17	NC_017435	T	6	6	4056	4061	0 %	100 %	0 %	0 %	385244084
18	NC_017435	T	7	7	4160	4166	0 %	100 %	0 %	0 %	385244084
19	NC_017435	T	6	6	5030	5035	0 %	100 %	0 %	0 %	385244085
20	NC_017435	T	8	8	5821	5828	0 %	100 %	0 %	0 %	385244085
21	NC_017435	T	6	6	6663	6668	0 %	100 %	0 %	0 %	385244086
22	NC_017435	A	6	6	6757	6762	100 %	0 %	0 %	0 %	385244086
23	NC_017435	T	6	6	6907	6912	0 %	100 %	0 %	0 %	385244086
24	NC_017435	A	8	8	6981	6988	100 %	0 %	0 %	0 %	385244086

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.