MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis D-LC plasmid pCTDLC1

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017433	T	7	7	375	381	0 %	100 %	0 %	0 %	385244959
2	NC_017433	A	6	6	409	414	100 %	0 %	0 %	0 %	385244959
3	NC_017433	A	8	8	520	527	100 %	0 %	0 %	0 %	385244959
4	NC_017433	A	6	6	580	585	100 %	0 %	0 %	0 %	385244959
5	NC_017433	T	6	6	845	850	0 %	100 %	0 %	0 %	385244959
6	NC_017433	T	6	6	991	996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017433	T	6	6	1649	1654	0 %	100 %	0 %	0 %	385244960
8	NC_017433	T	8	8	1876	1883	0 %	100 %	0 %	0 %	385244960
9	NC_017433	A	6	6	1884	1889	100 %	0 %	0 %	0 %	385244960
10	NC_017433	T	7	7	1902	1908	0 %	100 %	0 %	0 %	385244960
11	NC_017433	A	6	6	2089	2094	100 %	0 %	0 %	0 %	385244961
12	NC_017433	T	7	7	2474	2480	0 %	100 %	0 %	0 %	385244961
13	NC_017433	T	6	6	2612	2617	0 %	100 %	0 %	0 %	385244961
14	NC_017433	A	6	6	2692	2697	100 %	0 %	0 %	0 %	385244961
15	NC_017433	T	6	6	2793	2798	0 %	100 %	0 %	0 %	385244962
16	NC_017433	T	6	6	2987	2992	0 %	100 %	0 %	0 %	385244962
17	NC_017433	A	6	6	3144	3149	100 %	0 %	0 %	0 %	385244963
18	NC_017433	T	6	6	3921	3926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017433	T	6	6	4056	4061	0 %	100 %	0 %	0 %	385244964
20	NC_017433	T	7	7	4160	4166	0 %	100 %	0 %	0 %	385244964
21	NC_017433	T	6	6	5030	5035	0 %	100 %	0 %	0 %	385244965
22	NC_017433	T	8	8	5821	5828	0 %	100 %	0 %	0 %	385244965
23	NC_017433	A	7	7	6385	6391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017433	T	6	6	6663	6668	0 %	100 %	0 %	0 %	385244966
25	NC_017433	A	6	6	6757	6762	100 %	0 %	0 %	0 %	385244966
26	NC_017433	T	6	6	6907	6912	0 %	100 %	0 %	0 %	385244966
27	NC_017433	A	8	8	6981	6988	100 %	0 %	0 %	0 %	385244966
28	NC_017433	T	6	6	7478	7483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.