MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/9301 chromosome

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017432	GAAGGA	2	12	760	771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017432	CAAAAA	2	12	6252	6263	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017432	GAAAAG	2	12	56311	56322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017432	AGTTGT	2	12	57659	57670	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017432	TCTTGT	2	12	58577	58588	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017432	AAAAAT	2	12	60882	60893	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017432	ATCTAG	2	12	76611	76622	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017432	TTTTAG	2	12	115883	115894	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017432	TAAAAA	2	12	120479	120490	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017432	AGAAAA	2	12	182534	182545	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017432	TATGAA	2	12	195342	195353	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017432	TTTTAC	2	12	221354	221365	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017432	AACCCT	2	12	255071	255082	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017432	ATTTTT	2	12	255875	255886	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017432	AGGAGA	2	12	270977	270988	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017432	ATATTA	2	12	279875	279886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017432	AAAAAG	2	12	324039	324050	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017432	AGAATA	2	12	361511	361522	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017432	TTTTAA	2	12	409667	409678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017432	TAACTA	2	12	503196	503207	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017432	AAGAAA	2	12	503209	503220	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017432	AGAATA	2	12	509184	509195	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017432	AACTAA	2	12	514916	514927	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017432	TCCCTC	2	12	548580	548591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_017432	AAAAAT	2	12	566552	566563	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017432	TAGGGG	2	12	605720	605731	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017432	TCTTTT	2	12	617715	617726	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017432	TTATTT	2	12	648924	648935	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017432	TATTTT	2	12	754870	754881	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017432	GAGAAA	2	12	802334	802345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017432	TTTTCT	2	12	804792	804803	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017432	ATTTTT	2	12	808571	808582	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017432	TTTTTA	2	12	835009	835020	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017432	TAAGGA	2	12	855973	855984	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017432	CCGGAG	2	12	856891	856902	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017432	CCTCTA	2	12	870037	870048	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017432	TAAGGA	2	12	878019	878030	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017432	CCGGAG	2	12	878937	878948	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017432	GACGGC	2	12	921368	921379	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017432	AAACAA	2	12	923056	923067	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017432	ATTTTT	2	12	1038543	1038554	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017432	TAAAAT	2	12	1042168	1042179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.