MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis G/9301 chromosome

Total Repeats: 14092

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017432	GCC	2	6	4	9	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017432	TGC	2	6	63	68	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017432	ATT	2	6	75	80	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017432	CGA	2	6	97	102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017432	TAT	2	6	239	244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017432	GAA	2	6	286	291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017432	AGA	2	6	315	320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017432	AGA	2	6	369	374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017432	CAA	2	6	442	447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017432	TTG	2	6	585	590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017432	CTC	2	6	614	619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_017432	GAT	2	6	676	681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017432	GAT	2	6	730	735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017432	ATG	2	6	793	798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017432	CCT	2	6	952	957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_017432	CTT	2	6	1013	1018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017432	CAG	2	6	1078	1083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017432	TGA	2	6	1139	1144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017432	AAG	2	6	1220	1225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017432	TGG	2	6	1236	1241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017432	CTT	2	6	1243	1248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017432	ATG	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242287
23	NC_017432	GTG	2	6	1342	1347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385242287
24	NC_017432	TCC	2	6	1351	1356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242287
25	NC_017432	AGC	2	6	1365	1370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242287
26	NC_017432	AGC	2	6	1392	1397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242287
27	NC_017432	AAG	2	6	1403	1408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242287
28	NC_017432	TAC	2	6	1441	1446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242287
29	NC_017432	GCT	2	6	1451	1456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242287
30	NC_017432	AAC	2	6	1549	1554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242287
31	NC_017432	AGA	2	6	1561	1566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242287
32	NC_017432	TAA	2	6	1651	1656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017432	AGA	2	6	1817	1822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242288
34	NC_017432	ATC	2	6	1824	1829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242288
35	NC_017432	TGC	2	6	1844	1849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242288
36	NC_017432	CAT	2	6	1968	1973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242288
37	NC_017432	AGA	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242288
38	NC_017432	AAG	2	6	2026	2031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242288
39	NC_017432	GGA	2	6	2061	2066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242288
40	NC_017432	ATC	2	6	2190	2195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242289
41	NC_017432	ATA	2	6	2340	2345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242289
42	NC_017432	AAC	2	6	2365	2370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242289
43	NC_017432	GGT	2	6	2419	2424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385242289
44	NC_017432	AAT	2	6	2525	2530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242289
45	NC_017432	TTC	2	6	2560	2565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242289
46	NC_017432	GCA	2	6	2579	2584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242289
47	NC_017432	GGA	2	6	2627	2632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242289
48	NC_017432	CAG	2	6	2646	2651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242289
49	NC_017432	GTT	2	6	2663	2668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242289
50	NC_017432	GGT	2	6	2755	2760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385242289
51	NC_017432	AAG	2	6	2913	2918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242289
52	NC_017432	ATT	2	6	2975	2980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242289
53	NC_017432	TTG	2	6	3027	3032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242289
54	NC_017432	AAG	2	6	3138	3143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242289
55	NC_017432	AAG	2	6	3153	3158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242289
56	NC_017432	CAG	2	6	3195	3200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242289
57	NC_017432	GCT	2	6	3266	3271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242289
58	NC_017432	AAG	2	6	3432	3437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242289
59	NC_017432	CAG	2	6	3482	3487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242289
60	NC_017432	GGA	2	6	3569	3574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242289
61	NC_017432	AAT	2	6	3579	3584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242289
62	NC_017432	ATT	2	6	3659	3664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242290
63	NC_017432	TGA	2	6	3689	3694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242290
64	NC_017432	GTA	2	6	3921	3926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242290
65	NC_017432	AGA	2	6	3968	3973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242290
66	NC_017432	GAA	2	6	4152	4157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242290
67	NC_017432	CGT	2	6	4284	4289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242290
68	NC_017432	GTT	2	6	4335	4340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242290
69	NC_017432	TGA	2	6	4472	4477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242290
70	NC_017432	TTG	2	6	4567	4572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242290
71	NC_017432	TTC	2	6	4708	4713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242290
72	NC_017432	TCT	2	6	4800	4805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242290
73	NC_017432	AGA	2	6	4820	4825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242290
74	NC_017432	GTT	2	6	4847	4852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242290
75	NC_017432	GGT	2	6	4895	4900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385242290
76	NC_017432	CTC	2	6	4999	5004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242290
77	NC_017432	AGC	2	6	5030	5035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242290
78	NC_017432	GCA	2	6	5055	5060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017432	AGA	2	6	5082	5087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017432	ATT	2	6	5149	5154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242291
81	NC_017432	TCT	2	6	5167	5172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242291
82	NC_017432	GCT	2	6	5213	5218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242291
83	NC_017432	GAT	2	6	5248	5253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242291
84	NC_017432	ACG	2	6	5286	5291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242291
85	NC_017432	GAA	2	6	5310	5315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242291
86	NC_017432	AGA	3	9	5387	5395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242291
87	NC_017432	GCT	2	6	5396	5401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242291
88	NC_017432	AGA	2	6	5405	5410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242291
89	NC_017432	TGG	2	6	5441	5446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385242291
90	NC_017432	AGA	3	9	5459	5467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242291
91	NC_017432	GGA	2	6	5468	5473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242291
92	NC_017432	TCA	2	6	5653	5658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242291
93	NC_017432	GGA	2	6	5690	5695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242291
94	NC_017432	CTT	2	6	5750	5755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242291
95	NC_017432	CTG	2	6	5756	5761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242291
96	NC_017432	CAG	2	6	5911	5916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242291
97	NC_017432	CTT	2	6	6362	6367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017432	AGG	2	6	6440	6445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242292
99	NC_017432	GAA	2	6	6484	6489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242292
100	NC_017432	GCA	2	6	6748	6753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242292
101	NC_017432	AAG	2	6	6789	6794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242292
102	NC_017432	TGC	2	6	6822	6827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242292
103	NC_017432	TTA	2	6	7154	7159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017432	GAA	2	6	7203	7208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017432	ATG	2	6	7238	7243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017432	TCG	2	6	7315	7320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242293
107	NC_017432	TCC	2	6	7358	7363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242293
108	NC_017432	GTT	2	6	7466	7471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242293
109	NC_017432	TTA	2	6	7836	7841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242293
110	NC_017432	TTC	2	6	8159	8164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242293
111	NC_017432	GAA	2	6	8303	8308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242294
112	NC_017432	ACC	2	6	8431	8436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385242294
113	NC_017432	CTT	2	6	8484	8489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242294
114	NC_017432	GAG	2	6	8564	8569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242294
115	NC_017432	ATA	2	6	8581	8586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242294
116	NC_017432	AGG	2	6	8605	8610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242294
117	NC_017432	GAA	2	6	8785	8790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242294
118	NC_017432	CAG	2	6	8801	8806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242294
119	NC_017432	TGT	2	6	8872	8877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242294
120	NC_017432	GAG	2	6	8887	8892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242294
121	NC_017432	TAC	2	6	8955	8960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242294
122	NC_017432	GTT	2	6	9059	9064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242294
123	NC_017432	AAG	2	6	9083	9088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242294
124	NC_017432	GAG	2	6	9109	9114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242294
125	NC_017432	TTC	3	9	9176	9184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017432	ATC	2	6	9192	9197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017432	GAA	2	6	9230	9235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017432	CCT	2	6	9331	9336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_017432	TTA	2	6	9397	9402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242295
130	NC_017432	AGA	2	6	9432	9437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242295
131	NC_017432	TGC	2	6	9662	9667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242295
132	NC_017432	GAA	2	6	9689	9694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242295
133	NC_017432	TCG	2	6	9749	9754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242295
134	NC_017432	TGG	2	6	9772	9777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385242295
135	NC_017432	GTA	2	6	9823	9828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242296
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155	NC_017432	TAG	2	6	11192	11197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017432	CTT	2	6	11242	11247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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258	NC_017432	CTA	2	6	19730	19735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242303
259	NC_017432	AAT	2	6	19795	19800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242303
260	NC_017432	AAG	2	6	19838	19843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242303
261	NC_017432	CTT	3	9	19892	19900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
262	NC_017432	TAA	2	6	19934	19939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242304
263	NC_017432	GAG	2	6	19963	19968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242304
264	NC_017432	CTT	2	6	20104	20109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242304
265	NC_017432	TCC	2	6	20204	20209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242304
266	NC_017432	ACG	2	6	20318	20323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242304
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268	NC_017432	GAA	2	6	20417	20422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242305
269	NC_017432	CCT	2	6	20565	20570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
270	NC_017432	GGA	2	6	20611	20616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
271	NC_017432	AGA	3	9	20651	20659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
272	NC_017432	TGG	2	6	20870	20875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
273	NC_017432	AAC	2	6	20909	20914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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275	NC_017432	AGG	2	6	21015	21020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_017432	TCC	2	6	21244	21249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
278	NC_017432	AAT	2	6	21420	21425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_017432	TTC	2	6	22342	22347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242306
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312	NC_017432	TTA	2	6	24573	24578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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386	NC_017432	AAG	2	6	31204	31209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242312
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390	NC_017432	AGC	2	6	31610	31615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242313
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497	NC_017432	TTC	2	6	41049	41054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242322
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499	NC_017432	TAG	2	6	41191	41196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242323
500	NC_017432	ATA	2	6	41228	41233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242323

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