MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/11023 chromosome

Total Repeats: 653

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017431	TGTGA	2	10	3281	3290	20 %	40 %	40 %	0 %	385241362
2	NC_017431	TTGAA	2	10	3637	3646	40 %	40 %	20 %	0 %	385241363
3	NC_017431	GAGAA	2	10	3931	3940	60 %	0 %	40 %	0 %	385241363
4	NC_017431	GAAAA	2	10	4368	4377	80 %	0 %	20 %	0 %	385241363
5	NC_017431	TTACA	2	10	4523	4532	40 %	40 %	0 %	20 %	385241363
6	NC_017431	GTCTT	2	10	5217	5226	0 %	60 %	20 %	20 %	385241364
7	NC_017431	TGGTA	2	10	7690	7699	20 %	40 %	40 %	0 %	385241367
8	NC_017431	CGAAA	2	10	9098	9107	60 %	0 %	20 %	20 %	385241368
9	NC_017431	GGCTG	2	10	9734	9743	0 %	20 %	60 %	20 %	385241369
10	NC_017431	CCTCT	2	10	10526	10535	0 %	40 %	0 %	60 %	385241370
11	NC_017431	AAAGG	2	10	10685	10694	60 %	0 %	40 %	0 %	385241370
12	NC_017431	AAGAA	2	10	11805	11814	80 %	0 %	20 %	0 %	385241371
13	NC_017431	AAAGA	2	10	13203	13212	80 %	0 %	20 %	0 %	385241372
14	NC_017431	GGTGT	2	10	13307	13316	0 %	40 %	60 %	0 %	385241372
15	NC_017431	GATTT	2	10	15050	15059	20 %	60 %	20 %	0 %	385241374
16	NC_017431	CGTTC	2	10	16161	16170	0 %	40 %	20 %	40 %	385241375
17	NC_017431	GCTTC	2	10	16534	16543	0 %	40 %	20 %	40 %	385241375
18	NC_017431	GAAGG	2	10	16905	16914	40 %	0 %	60 %	0 %	385241375
19	NC_017431	GTTGT	2	10	20331	20340	0 %	60 %	40 %	0 %	385241378
20	NC_017431	AAGAT	2	10	21443	21452	60 %	20 %	20 %	0 %	385241379
21	NC_017431	TTTGC	2	10	22054	22063	0 %	60 %	20 %	20 %	385241379
22	NC_017431	GGAAA	2	10	23808	23817	60 %	0 %	40 %	0 %	385241379
23	NC_017431	AGAGG	2	10	25533	25542	40 %	0 %	60 %	0 %	385241380
24	NC_017431	GGAGA	2	10	27312	27321	40 %	0 %	60 %	0 %	385241381
25	NC_017431	ATCCG	2	10	28063	28072	20 %	20 %	20 %	40 %	385241383
26	NC_017431	AGGGT	2	10	28581	28590	20 %	20 %	60 %	0 %	385241383
27	NC_017431	CCTAT	2	10	29621	29630	20 %	40 %	0 %	40 %	385241384
28	NC_017431	AAGGA	2	10	30421	30430	60 %	0 %	40 %	0 %	385241385
29	NC_017431	GAGCT	2	10	31460	31469	20 %	20 %	40 %	20 %	385241386
30	NC_017431	TCAGT	2	10	35700	35709	20 %	40 %	20 %	20 %	385241392
31	NC_017431	CTATT	2	10	36134	36143	20 %	60 %	0 %	20 %	385241392
32	NC_017431	TCCTA	2	10	36181	36190	20 %	40 %	0 %	40 %	385241392
33	NC_017431	ACGAT	2	10	38097	38106	40 %	20 %	20 %	20 %	385241393
34	NC_017431	TTTGA	2	10	38462	38471	20 %	60 %	20 %	0 %	385241393
35	NC_017431	AGCAA	2	10	42113	42122	60 %	0 %	20 %	20 %	385241396
36	NC_017431	CGATG	2	10	42170	42179	20 %	20 %	40 %	20 %	385241396
37	NC_017431	TTTAT	2	10	44243	44252	20 %	80 %	0 %	0 %	385241401
38	NC_017431	CTTTC	2	10	46340	46349	0 %	60 %	0 %	40 %	385241403
39	NC_017431	AGTTT	2	10	46879	46888	20 %	60 %	20 %	0 %	385241403
40	NC_017431	CTTTT	2	10	50048	50057	0 %	80 %	0 %	20 %	385241406
41	NC_017431	CCGTA	2	10	53930	53939	20 %	20 %	20 %	40 %	385241409
42	NC_017431	TTATC	2	10	55333	55342	20 %	60 %	0 %	20 %	385241410
43	NC_017431	GTTGT	2	10	56401	56410	0 %	60 %	40 %	0 %	385241411
44	NC_017431	GAGCA	2	10	59846	59855	40 %	0 %	40 %	20 %	385241413
45	NC_017431	TGTGA	2	10	62295	62304	20 %	40 %	40 %	0 %	385241415
46	NC_017431	AGTGA	2	10	63816	63825	40 %	20 %	40 %	0 %	385241416
47	NC_017431	CCTTC	2	10	64090	64099	0 %	40 %	0 %	60 %	385241416
48	NC_017431	AGGAG	2	10	66318	66327	40 %	0 %	60 %	0 %	385241418
49	NC_017431	GTTAA	2	10	66448	66457	40 %	40 %	20 %	0 %	385241418
50	NC_017431	GGAGC	2	10	69696	69705	20 %	0 %	60 %	20 %	385241421
51	NC_017431	GCGAT	2	10	69886	69895	20 %	20 %	40 %	20 %	385241421
52	NC_017431	CTCTT	2	10	70240	70249	0 %	60 %	0 %	40 %	385241421
53	NC_017431	AGGGG	2	10	70886	70895	20 %	0 %	80 %	0 %	385241421
54	NC_017431	AAGAA	2	10	70928	70937	80 %	0 %	20 %	0 %	385241421
55	NC_017431	CTTGC	2	10	72017	72026	0 %	40 %	20 %	40 %	385241423
56	NC_017431	ATTGG	2	10	72218	72227	20 %	40 %	40 %	0 %	385241424
57	NC_017431	GAAAA	2	10	73290	73299	80 %	0 %	20 %	0 %	385241424
58	NC_017431	TGGGA	2	10	73707	73716	20 %	20 %	60 %	0 %	385241425
59	NC_017431	TATTT	2	10	76234	76243	20 %	80 %	0 %	0 %	385241426
60	NC_017431	TGTCT	2	10	80027	80036	0 %	60 %	20 %	20 %	385241430
61	NC_017431	TTACT	2	10	80534	80543	20 %	60 %	0 %	20 %	385241430
62	NC_017431	AGAAA	2	10	81924	81933	80 %	0 %	20 %	0 %	385241432
63	NC_017431	GGAAG	2	10	82437	82446	40 %	0 %	60 %	0 %	385241432
64	NC_017431	AGCGA	2	10	84903	84912	40 %	0 %	40 %	20 %	385241434
65	NC_017431	GATCC	2	10	85988	85997	20 %	20 %	20 %	40 %	385241435
66	NC_017431	AGAGC	2	10	87323	87332	40 %	0 %	40 %	20 %	385241436
67	NC_017431	TTTTC	2	10	91055	91064	0 %	80 %	0 %	20 %	385241439
68	NC_017431	GGATG	2	10	91315	91324	20 %	20 %	60 %	0 %	385241440
69	NC_017431	CAACA	2	10	92854	92863	60 %	0 %	0 %	40 %	385241441
70	NC_017431	ACAGC	2	10	93898	93907	40 %	0 %	20 %	40 %	385241443
71	NC_017431	GGAAC	2	10	94611	94620	40 %	0 %	40 %	20 %	385241444
72	NC_017431	GGATT	2	10	95511	95520	20 %	40 %	40 %	0 %	385241444
73	NC_017431	CAATC	2	10	96607	96616	40 %	20 %	0 %	40 %	385241446
74	NC_017431	TTTGC	2	10	96741	96750	0 %	60 %	20 %	20 %	385241446
75	NC_017431	ATTCA	2	10	97005	97014	40 %	40 %	0 %	20 %	385241446
76	NC_017431	GATCC	2	10	97264	97273	20 %	20 %	20 %	40 %	385241446
77	NC_017431	GTTTT	2	10	97685	97694	0 %	80 %	20 %	0 %	385241446
78	NC_017431	AAGCT	2	10	98888	98897	40 %	20 %	20 %	20 %	385241447
79	NC_017431	AGGGG	2	10	99247	99256	20 %	0 %	80 %	0 %	385241447
80	NC_017431	ATAGC	2	10	99946	99955	40 %	20 %	20 %	20 %	385241448
81	NC_017431	TTCCC	2	10	100550	100559	0 %	40 %	0 %	60 %	385241449
82	NC_017431	AGCGA	2	10	102874	102883	40 %	0 %	40 %	20 %	385241451
83	NC_017431	TTTCT	2	10	103232	103241	0 %	80 %	0 %	20 %	385241451
84	NC_017431	CTTCT	2	10	103286	103295	0 %	60 %	0 %	40 %	385241451
85	NC_017431	ATCAT	2	10	104438	104447	40 %	40 %	0 %	20 %	385241452
86	NC_017431	GGCAT	2	10	105146	105155	20 %	20 %	40 %	20 %	385241452
87	NC_017431	AAAGC	2	10	108872	108881	60 %	0 %	20 %	20 %	385241455
88	NC_017431	GCATT	2	10	110032	110041	20 %	40 %	20 %	20 %	385241457
89	NC_017431	TGTTT	2	10	114721	114730	0 %	80 %	20 %	0 %	385241460
90	NC_017431	CATGT	2	10	115099	115108	20 %	40 %	20 %	20 %	385241460
91	NC_017431	TATCG	2	10	115803	115812	20 %	40 %	20 %	20 %	385241460
92	NC_017431	TTTCT	2	10	116319	116328	0 %	80 %	0 %	20 %	385241461
93	NC_017431	GGAGA	2	10	116515	116524	40 %	0 %	60 %	0 %	385241461
94	NC_017431	AAAGA	2	10	118565	118574	80 %	0 %	20 %	0 %	385241464
95	NC_017431	GCTTC	2	10	122555	122564	0 %	40 %	20 %	40 %	385241467
96	NC_017431	TACAA	2	10	126343	126352	60 %	20 %	0 %	20 %	385241471
97	NC_017431	ATCCA	2	10	128751	128760	40 %	20 %	0 %	40 %	385241474
98	NC_017431	GAAGA	2	10	130301	130310	60 %	0 %	40 %	0 %	385241474
99	NC_017431	AAAAG	2	10	132214	132223	80 %	0 %	20 %	0 %	385241476
100	NC_017431	GATTC	2	10	132545	132554	20 %	40 %	20 %	20 %	385241476
101	NC_017431	ATTGG	2	10	135830	135839	20 %	40 %	40 %	0 %	385241479
102	NC_017431	TGTTT	2	10	136289	136298	0 %	80 %	20 %	0 %	385241480
103	NC_017431	TCCAG	2	10	140035	140044	20 %	20 %	20 %	40 %	385241486
104	NC_017431	GTACA	2	10	140766	140775	40 %	20 %	20 %	20 %	385241487
105	NC_017431	TAGAT	2	10	141139	141148	40 %	40 %	20 %	0 %	385241487
106	NC_017431	AAAAG	2	10	141551	141560	80 %	0 %	20 %	0 %	385241488
107	NC_017431	AAAAC	2	10	142031	142040	80 %	0 %	0 %	20 %	385241489
108	NC_017431	TGCTA	2	10	143117	143126	20 %	40 %	20 %	20 %	385241491
109	NC_017431	GGAGC	2	10	143164	143173	20 %	0 %	60 %	20 %	385241491
110	NC_017431	CTGGG	2	10	144578	144587	0 %	20 %	60 %	20 %	385241493
111	NC_017431	GTTTT	2	10	145325	145334	0 %	80 %	20 %	0 %	385241494
112	NC_017431	GAACC	2	10	149059	149068	40 %	0 %	20 %	40 %	385241495
113	NC_017431	ATTCT	2	10	152555	152564	20 %	60 %	0 %	20 %	385241499
114	NC_017431	CTGTG	2	10	152759	152768	0 %	40 %	40 %	20 %	385241499
115	NC_017431	TTCTT	2	10	155232	155241	0 %	80 %	0 %	20 %	385241502
116	NC_017431	AGGAA	2	10	159790	159799	60 %	0 %	40 %	0 %	385241506
117	NC_017431	AGAGA	2	10	163021	163030	60 %	0 %	40 %	0 %	385241509
118	NC_017431	AGCAA	2	10	163456	163465	60 %	0 %	20 %	20 %	385241509
119	NC_017431	CAAAA	2	10	166959	166968	80 %	0 %	0 %	20 %	385241511
120	NC_017431	AAGAG	2	10	167792	167801	60 %	0 %	40 %	0 %	385241511
121	NC_017431	GATTG	2	10	168137	168146	20 %	40 %	40 %	0 %	385241511
122	NC_017431	GTTTT	2	10	174619	174628	0 %	80 %	20 %	0 %	385241515
123	NC_017431	TATTG	2	10	174642	174651	20 %	60 %	20 %	0 %	385241515
124	NC_017431	CAGCA	2	10	175001	175010	40 %	0 %	20 %	40 %	385241515
125	NC_017431	TAGGA	2	10	175306	175315	40 %	20 %	40 %	0 %	385241516
126	NC_017431	TGATT	2	10	177233	177242	20 %	60 %	20 %	0 %	385241517
127	NC_017431	TCAAT	2	10	177874	177883	40 %	40 %	0 %	20 %	385241517
128	NC_017431	TTTTC	2	10	177913	177922	0 %	80 %	0 %	20 %	385241517
129	NC_017431	GGAAT	2	10	179480	179489	40 %	20 %	40 %	0 %	385241518
130	NC_017431	AGAGT	2	10	180438	180447	40 %	20 %	40 %	0 %	385241519
131	NC_017431	TTGAA	2	10	180971	180980	40 %	40 %	20 %	0 %	385241520
132	NC_017431	TTGAG	2	10	182531	182540	20 %	40 %	40 %	0 %	385241521
133	NC_017431	GAATG	2	10	182556	182565	40 %	20 %	40 %	0 %	385241521
134	NC_017431	AGAGA	2	10	184599	184608	60 %	0 %	40 %	0 %	385241524
135	NC_017431	ACGAT	2	10	186671	186680	40 %	20 %	20 %	20 %	385241526
136	NC_017431	GGATC	2	10	189761	189770	20 %	20 %	40 %	20 %	385241528
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143	NC_017431	TATCA	2	10	192546	192555	40 %	40 %	0 %	20 %	385241531
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