MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis E/11023 chromosome

Total Repeats: 2868

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017431	AATG	2	8	466	473	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017431	CTAT	2	8	800	807	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017431	AAGG	2	8	1309	1316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017431	AGTA	2	8	1489	1496	50 %	25 %	25 %	0 %	385241360
5	NC_017431	ATGA	2	8	1893	1900	50 %	25 %	25 %	0 %	385241361
6	NC_017431	GATA	2	8	1931	1938	50 %	25 %	25 %	0 %	385241361
7	NC_017431	TTTC	2	8	2228	2235	0 %	75 %	0 %	25 %	385241362
8	NC_017431	CATG	2	8	3109	3116	25 %	25 %	25 %	25 %	385241362
9	NC_017431	TTCC	2	8	3414	3421	0 %	50 %	0 %	50 %	385241362
10	NC_017431	TTTA	2	8	3812	3819	25 %	75 %	0 %	0 %	385241363
11	NC_017431	ATCC	2	8	4112	4119	25 %	25 %	0 %	50 %	385241363
12	NC_017431	GACG	2	8	4859	4866	25 %	0 %	50 %	25 %	385241363
13	NC_017431	TTGG	2	8	4962	4969	0 %	50 %	50 %	0 %	385241363
14	NC_017431	TGGA	2	8	5321	5328	25 %	25 %	50 %	0 %	385241364
15	NC_017431	CTTT	2	8	5698	5705	0 %	75 %	0 %	25 %	385241364
16	NC_017431	GGGA	2	8	6213	6220	25 %	0 %	75 %	0 %	385241364
17	NC_017431	GGAG	2	8	6304	6311	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017431	GGTG	2	8	6516	6523	0 %	25 %	75 %	0 %	385241365
19	NC_017431	AAAT	2	8	6582	6589	75 %	25 %	0 %	0 %	385241365
20	NC_017431	TATG	2	8	6953	6960	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017431	ATTT	2	8	7094	7101	25 %	75 %	0 %	0 %	385241366
22	NC_017431	ATTT	2	8	7185	7192	25 %	75 %	0 %	0 %	385241366
23	NC_017431	AAGC	2	8	7820	7827	50 %	0 %	25 %	25 %	385241367
24	NC_017431	ATTG	2	8	8218	8225	25 %	50 %	25 %	0 %	385241368
25	NC_017431	AGCG	2	8	8685	8692	25 %	0 %	50 %	25 %	385241368
26	NC_017431	AAAG	2	8	8706	8713	75 %	0 %	25 %	0 %	385241368
27	NC_017431	CTTT	2	8	9046	9053	0 %	75 %	0 %	25 %	385241368
28	NC_017431	TATT	2	8	9309	9316	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017431	TTCG	2	8	9420	9427	0 %	50 %	25 %	25 %	385241369
30	NC_017431	AATT	2	8	9525	9532	50 %	50 %	0 %	0 %	385241369
31	NC_017431	ATGG	2	8	9584	9591	25 %	25 %	50 %	0 %	385241369
32	NC_017431	CTTT	2	8	10209	10216	0 %	75 %	0 %	25 %	385241370
33	NC_017431	GCAA	2	8	10426	10433	50 %	0 %	25 %	25 %	385241370
34	NC_017431	AGCC	2	8	10656	10663	25 %	0 %	25 %	50 %	385241370
35	NC_017431	GAAA	2	8	10799	10806	75 %	0 %	25 %	0 %	385241370
36	NC_017431	AGAA	2	8	11203	11210	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017431	AATG	2	8	11542	11549	50 %	25 %	25 %	0 %	385241371
38	NC_017431	GTTT	2	8	12574	12581	0 %	75 %	25 %	0 %	385241372
39	NC_017431	ATGC	2	8	13004	13011	25 %	25 %	25 %	25 %	385241372
40	NC_017431	AAGG	2	8	13439	13446	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017431	TTGT	2	8	14040	14047	0 %	75 %	25 %	0 %	385241373
42	NC_017431	TTCT	2	8	14211	14218	0 %	75 %	0 %	25 %	385241373
43	NC_017431	ATTT	2	8	14417	14424	25 %	75 %	0 %	0 %	385241373
44	NC_017431	TTTC	2	8	15079	15086	0 %	75 %	0 %	25 %	385241374
45	NC_017431	AAAT	2	8	15561	15568	75 %	25 %	0 %	0 %	385241374
46	NC_017431	CAAA	2	8	16073	16080	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017431	GTAA	2	8	16403	16410	50 %	25 %	25 %	0 %	385241375
48	NC_017431	CTAA	2	8	16596	16603	50 %	25 %	0 %	25 %	385241375
49	NC_017431	AGAA	2	8	16859	16866	75 %	0 %	25 %	0 %	385241375
50	NC_017431	ATTT	2	8	17005	17012	25 %	75 %	0 %	0 %	385241375
51	NC_017431	TGCG	2	8	18527	18534	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017431	GAAG	2	8	19511	19518	50 %	0 %	50 %	0 %	385241377
53	NC_017431	TTTG	2	8	19537	19544	0 %	75 %	25 %	0 %	385241377
54	NC_017431	TGTA	2	8	20229	20236	25 %	50 %	25 %	0 %	385241378
55	NC_017431	GCCA	2	8	21021	21028	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017431	CGCT	2	8	21269	21276	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017431	TTAA	2	8	21290	21297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017431	GTTA	2	8	21327	21334	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017431	GATC	2	8	21382	21389	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017431	TGGG	2	8	21647	21654	0 %	25 %	75 %	0 %	385241379
61	NC_017431	CATT	2	8	22704	22711	25 %	50 %	0 %	25 %	385241379
62	NC_017431	GCTT	2	8	23047	23054	0 %	50 %	25 %	25 %	385241379
63	NC_017431	GGTT	2	8	23095	23102	0 %	50 %	50 %	0 %	385241379
64	NC_017431	TTCT	2	8	23465	23472	0 %	75 %	0 %	25 %	385241379
65	NC_017431	TAAC	2	8	23567	23574	50 %	25 %	0 %	25 %	385241379
66	NC_017431	CATT	2	8	23690	23697	25 %	50 %	0 %	25 %	385241379
67	NC_017431	GGTA	2	8	24060	24067	25 %	25 %	50 %	0 %	385241379
68	NC_017431	TTGA	2	8	25055	25062	25 %	50 %	25 %	0 %	385241380
69	NC_017431	TTCG	2	8	25200	25207	0 %	50 %	25 %	25 %	385241380
70	NC_017431	TAGG	2	8	25279	25286	25 %	25 %	50 %	0 %	385241380
71	NC_017431	TTCC	2	8	25403	25410	0 %	50 %	0 %	50 %	385241380
72	NC_017431	TAGG	2	8	25517	25524	25 %	25 %	50 %	0 %	385241380
73	NC_017431	TTTC	2	8	25952	25959	0 %	75 %	0 %	25 %	385241380
74	NC_017431	GCTT	2	8	26289	26296	0 %	50 %	25 %	25 %	385241380
75	NC_017431	GGAA	2	8	26872	26879	50 %	0 %	50 %	0 %	385241381
76	NC_017431	TTAA	2	8	26945	26952	50 %	50 %	0 %	0 %	385241381
77	NC_017431	AAAG	2	8	26995	27002	75 %	0 %	25 %	0 %	385241381
78	NC_017431	GGGC	2	8	27275	27282	0 %	0 %	75 %	25 %	385241381
79	NC_017431	GTTT	2	8	27558	27565	0 %	75 %	25 %	0 %	385241382
80	NC_017431	CAGA	2	8	27580	27587	50 %	0 %	25 %	25 %	385241382
81	NC_017431	ATTG	2	8	27939	27946	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017431	CTTT	2	8	29552	29559	0 %	75 %	0 %	25 %	385241384
83	NC_017431	TTTG	2	8	29567	29574	0 %	75 %	25 %	0 %	385241384
84	NC_017431	TTGT	2	8	29602	29609	0 %	75 %	25 %	0 %	385241384
85	NC_017431	TGGC	2	8	29765	29772	0 %	25 %	50 %	25 %	385241384
86	NC_017431	AAAG	2	8	30325	30332	75 %	0 %	25 %	0 %	385241385
87	NC_017431	AAAC	2	8	30395	30402	75 %	0 %	0 %	25 %	385241385
88	NC_017431	GATG	2	8	30538	30545	25 %	25 %	50 %	0 %	385241385
89	NC_017431	GATA	2	8	31647	31654	50 %	25 %	25 %	0 %	385241387
90	NC_017431	TGAT	2	8	34142	34149	25 %	50 %	25 %	0 %	385241390
91	NC_017431	AAGA	3	12	34270	34281	75 %	0 %	25 %	0 %	385241390
92	NC_017431	AAGC	2	8	34490	34497	50 %	0 %	25 %	25 %	385241391
93	NC_017431	GTTC	2	8	34523	34530	0 %	50 %	25 %	25 %	385241391
94	NC_017431	GGCA	2	8	34902	34909	25 %	0 %	50 %	25 %	385241392
95	NC_017431	TCGA	2	8	35159	35166	25 %	25 %	25 %	25 %	385241392
96	NC_017431	TGCT	2	8	35312	35319	0 %	50 %	25 %	25 %	385241392
97	NC_017431	TTGG	2	8	35544	35551	0 %	50 %	50 %	0 %	385241392
98	NC_017431	AGAT	2	8	36264	36271	50 %	25 %	25 %	0 %	385241392
99	NC_017431	CTTT	2	8	36637	36644	0 %	75 %	0 %	25 %	385241393
100	NC_017431	ATGA	2	8	37127	37134	50 %	25 %	25 %	0 %	385241393
101	NC_017431	TAGG	2	8	37286	37293	25 %	25 %	50 %	0 %	385241393
102	NC_017431	CAAT	2	8	37470	37477	50 %	25 %	0 %	25 %	385241393
103	NC_017431	AATG	2	8	38257	38264	50 %	25 %	25 %	0 %	385241393
104	NC_017431	AGAA	2	8	39094	39101	75 %	0 %	25 %	0 %	385241394
105	NC_017431	AAGA	2	8	39146	39153	75 %	0 %	25 %	0 %	385241394
106	NC_017431	ATCC	2	8	39154	39161	25 %	25 %	0 %	50 %	385241394
107	NC_017431	TAAT	2	8	39365	39372	50 %	50 %	0 %	0 %	385241394
108	NC_017431	GTGC	2	8	41454	41461	0 %	25 %	50 %	25 %	385241396
109	NC_017431	AGAA	2	8	41873	41880	75 %	0 %	25 %	0 %	385241396
110	NC_017431	GGAT	2	8	42025	42032	25 %	25 %	50 %	0 %	385241396
111	NC_017431	AAAC	2	8	43233	43240	75 %	0 %	0 %	25 %	385241399
112	NC_017431	CAAT	2	8	43437	43444	50 %	25 %	0 %	25 %	385241399
113	NC_017431	TGTT	2	8	43817	43824	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017431	AATA	2	8	44056	44063	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017431	ATTT	2	8	44194	44201	25 %	75 %	0 %	0 %	385241401
116	NC_017431	GCTC	2	8	44502	44509	0 %	25 %	25 %	50 %	385241401
117	NC_017431	TTCT	2	8	44644	44651	0 %	75 %	0 %	25 %	385241401
118	NC_017431	TTGA	2	8	45244	45251	25 %	50 %	25 %	0 %	385241402
119	NC_017431	TGTT	2	8	45416	45423	0 %	75 %	25 %	0 %	385241402
120	NC_017431	CTAT	2	8	45446	45453	25 %	50 %	0 %	25 %	385241402
121	NC_017431	TGTT	2	8	45475	45482	0 %	75 %	25 %	0 %	385241402
122	NC_017431	CTAT	2	8	45771	45778	25 %	50 %	0 %	25 %	385241402
123	NC_017431	AAGA	2	8	46267	46274	75 %	0 %	25 %	0 %	385241403
124	NC_017431	AAGA	2	8	46324	46331	75 %	0 %	25 %	0 %	385241403
125	NC_017431	AAAG	2	8	46364	46371	75 %	0 %	25 %	0 %	385241403
126	NC_017431	AAGA	2	8	46479	46486	75 %	0 %	25 %	0 %	385241403
127	NC_017431	ACTT	2	8	46740	46747	25 %	50 %	0 %	25 %	385241403
128	NC_017431	ATGG	2	8	47366	47373	25 %	25 %	50 %	0 %	385241403
129	NC_017431	AGGA	2	8	47397	47404	50 %	0 %	50 %	0 %	385241403
130	NC_017431	GAAC	2	8	47944	47951	50 %	0 %	25 %	25 %	385241403
131	NC_017431	AAGT	2	8	47979	47986	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017431	AACA	2	8	48188	48195	75 %	0 %	0 %	25 %	385241404
133	NC_017431	CTTT	2	8	48384	48391	0 %	75 %	0 %	25 %	385241404
134	NC_017431	CTTT	2	8	49275	49282	0 %	75 %	0 %	25 %	385241405
135	NC_017431	GTAG	2	8	49293	49300	25 %	25 %	50 %	0 %	385241405
136	NC_017431	GAAG	2	8	50721	50728	50 %	0 %	50 %	0 %	385241406
137	NC_017431	TTCA	2	8	51143	51150	25 %	50 %	0 %	25 %	385241406
138	NC_017431	TCTA	2	8	51360	51367	25 %	50 %	0 %	25 %	385241406
139	NC_017431	TATT	2	8	52294	52301	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017431	GGAA	2	8	52525	52532	50 %	0 %	50 %	0 %	385241408
141	NC_017431	TTAA	2	8	53266	53273	50 %	50 %	0 %	0 %	385241408
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