MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis E/11023 chromosome

Total Repeats: 2381

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017431	TC	3	6	225	230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017431	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017431	TC	3	6	1670	1675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017431	AG	3	6	2153	2158	50 %	0 %	50 %	0 %	385241362
5	NC_017431	GA	3	6	2821	2826	50 %	0 %	50 %	0 %	385241362
6	NC_017431	AT	3	6	4514	4519	50 %	50 %	0 %	0 %	385241363
7	NC_017431	TC	3	6	5262	5267	0 %	50 %	0 %	50 %	385241364
8	NC_017431	GA	3	6	5273	5278	50 %	0 %	50 %	0 %	385241364
9	NC_017431	AT	3	6	5377	5382	50 %	50 %	0 %	0 %	385241364
10	NC_017431	TG	3	6	5530	5535	0 %	50 %	50 %	0 %	385241364
11	NC_017431	AG	3	6	5938	5943	50 %	0 %	50 %	0 %	385241364
12	NC_017431	AG	3	6	6412	6417	50 %	0 %	50 %	0 %	385241365
13	NC_017431	GA	3	6	6996	7001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017431	AC	3	6	7647	7652	50 %	0 %	0 %	50 %	385241367
15	NC_017431	AG	3	6	8390	8395	50 %	0 %	50 %	0 %	385241368
16	NC_017431	CT	4	8	8509	8516	0 %	50 %	0 %	50 %	385241368
17	NC_017431	GT	3	6	8591	8596	0 %	50 %	50 %	0 %	385241368
18	NC_017431	AG	3	6	9351	9356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017431	GA	3	6	9867	9872	50 %	0 %	50 %	0 %	385241370
20	NC_017431	AG	3	6	10084	10089	50 %	0 %	50 %	0 %	385241370
21	NC_017431	TA	3	6	11249	11254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017431	AG	3	6	11310	11315	50 %	0 %	50 %	0 %	385241371
23	NC_017431	TA	3	6	11870	11875	50 %	50 %	0 %	0 %	385241371
24	NC_017431	TG	3	6	12773	12778	0 %	50 %	50 %	0 %	385241372
25	NC_017431	AG	3	6	12922	12927	50 %	0 %	50 %	0 %	385241372
26	NC_017431	TC	3	6	13056	13061	0 %	50 %	0 %	50 %	385241372
27	NC_017431	AG	4	8	13078	13085	50 %	0 %	50 %	0 %	385241372
28	NC_017431	TA	3	6	13340	13345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017431	TA	4	8	13564	13571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017431	AC	3	6	14407	14412	50 %	0 %	0 %	50 %	385241373
31	NC_017431	AG	3	6	15746	15751	50 %	0 %	50 %	0 %	385241374
32	NC_017431	TC	3	6	15786	15791	0 %	50 %	0 %	50 %	385241374
33	NC_017431	GA	3	6	16315	16320	50 %	0 %	50 %	0 %	385241375
34	NC_017431	AG	3	6	16386	16391	50 %	0 %	50 %	0 %	385241375
35	NC_017431	GA	3	6	17170	17175	50 %	0 %	50 %	0 %	385241375
36	NC_017431	AG	3	6	17516	17521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017431	GA	3	6	17529	17534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017431	GA	3	6	17773	17778	50 %	0 %	50 %	0 %	385241376
39	NC_017431	TC	3	6	18223	18228	0 %	50 %	0 %	50 %	385241376
40	NC_017431	CT	3	6	18451	18456	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017431	TC	3	6	18651	18656	0 %	50 %	0 %	50 %	385241377
42	NC_017431	GA	3	6	18666	18671	50 %	0 %	50 %	0 %	385241377
43	NC_017431	GA	3	6	18765	18770	50 %	0 %	50 %	0 %	385241377
44	NC_017431	AG	3	6	19231	19236	50 %	0 %	50 %	0 %	385241377
45	NC_017431	AG	4	8	19517	19524	50 %	0 %	50 %	0 %	385241377
46	NC_017431	GT	3	6	19780	19785	0 %	50 %	50 %	0 %	385241377
47	NC_017431	TG	3	6	20121	20126	0 %	50 %	50 %	0 %	385241378
48	NC_017431	AG	3	6	20517	20522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017431	GA	3	6	20675	20680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017431	AG	3	6	21192	21197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017431	CT	3	6	21261	21266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017431	CT	4	8	21918	21925	0 %	50 %	0 %	50 %	385241379
53	NC_017431	AT	3	6	22188	22193	50 %	50 %	0 %	0 %	385241379
54	NC_017431	AT	3	6	22512	22517	50 %	50 %	0 %	0 %	385241379
55	NC_017431	GA	3	6	23831	23836	50 %	0 %	50 %	0 %	385241379
56	NC_017431	GA	3	6	23923	23928	50 %	0 %	50 %	0 %	385241379
57	NC_017431	AG	3	6	24304	24309	50 %	0 %	50 %	0 %	385241379
58	NC_017431	GA	3	6	25721	25726	50 %	0 %	50 %	0 %	385241380
59	NC_017431	GT	3	6	25741	25746	0 %	50 %	50 %	0 %	385241380
60	NC_017431	GA	3	6	26389	26394	50 %	0 %	50 %	0 %	385241380
61	NC_017431	GA	3	6	26513	26518	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017431	CT	3	6	26520	26525	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017431	AT	3	6	26806	26811	50 %	50 %	0 %	0 %	385241381
64	NC_017431	GA	3	6	27020	27025	50 %	0 %	50 %	0 %	385241381
65	NC_017431	TC	3	6	27888	27893	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017431	AG	3	6	27971	27976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017431	TG	3	6	28394	28399	0 %	50 %	50 %	0 %	385241383
68	NC_017431	TC	3	6	28447	28452	0 %	50 %	0 %	50 %	385241383
69	NC_017431	GC	4	8	28861	28868	0 %	0 %	50 %	50 %	385241383
70	NC_017431	TA	3	6	28983	28988	50 %	50 %	0 %	0 %	385241383
71	NC_017431	GA	3	6	29934	29939	50 %	0 %	50 %	0 %	385241384
72	NC_017431	AG	3	6	30032	30037	50 %	0 %	50 %	0 %	385241385
73	NC_017431	TC	3	6	30141	30146	0 %	50 %	0 %	50 %	385241385
74	NC_017431	GA	3	6	30762	30767	50 %	0 %	50 %	0 %	385241385
75	NC_017431	GA	3	6	31230	31235	50 %	0 %	50 %	0 %	385241385
76	NC_017431	TC	3	6	31656	31661	0 %	50 %	0 %	50 %	385241387
77	NC_017431	CT	3	6	32136	32141	0 %	50 %	0 %	50 %	385241387
78	NC_017431	AG	3	6	32268	32273	50 %	0 %	50 %	0 %	385241387
79	NC_017431	TC	3	6	33765	33770	0 %	50 %	0 %	50 %	385241389
80	NC_017431	AG	3	6	33778	33783	50 %	0 %	50 %	0 %	385241389
81	NC_017431	AG	3	6	33916	33921	50 %	0 %	50 %	0 %	385241390
82	NC_017431	AG	3	6	34609	34614	50 %	0 %	50 %	0 %	385241391
83	NC_017431	GA	4	8	34632	34639	50 %	0 %	50 %	0 %	385241391
84	NC_017431	TG	3	6	35457	35462	0 %	50 %	50 %	0 %	385241392
85	NC_017431	GA	3	6	36385	36390	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017431	AT	3	6	36487	36492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017431	GA	3	6	36535	36540	50 %	0 %	50 %	0 %	385241393
88	NC_017431	CT	3	6	37019	37024	0 %	50 %	0 %	50 %	385241393
89	NC_017431	AG	3	6	37530	37535	50 %	0 %	50 %	0 %	385241393
90	NC_017431	AG	3	6	38076	38081	50 %	0 %	50 %	0 %	385241393
91	NC_017431	AG	3	6	38603	38608	50 %	0 %	50 %	0 %	385241393
92	NC_017431	CT	3	6	38754	38759	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017431	GA	3	6	39387	39392	50 %	0 %	50 %	0 %	385241394
94	NC_017431	AG	3	6	39524	39529	50 %	0 %	50 %	0 %	385241394
95	NC_017431	AG	3	6	39624	39629	50 %	0 %	50 %	0 %	385241394
96	NC_017431	CT	3	6	40125	40130	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017431	AG	3	6	40601	40606	50 %	0 %	50 %	0 %	385241395
98	NC_017431	GC	3	6	40650	40655	0 %	0 %	50 %	50 %	385241395
99	NC_017431	GA	3	6	40815	40820	50 %	0 %	50 %	0 %	385241395
100	NC_017431	TC	3	6	40824	40829	0 %	50 %	0 %	50 %	385241395
101	NC_017431	GC	3	6	40889	40894	0 %	0 %	50 %	50 %	385241395
102	NC_017431	GA	3	6	41029	41034	50 %	0 %	50 %	0 %	385241395
103	NC_017431	GT	3	6	41467	41472	0 %	50 %	50 %	0 %	385241396
104	NC_017431	GA	3	6	42005	42010	50 %	0 %	50 %	0 %	385241396
105	NC_017431	GA	4	8	42015	42022	50 %	0 %	50 %	0 %	385241396
106	NC_017431	AG	3	6	42251	42256	50 %	0 %	50 %	0 %	385241396
107	NC_017431	CT	3	6	42317	42322	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017431	GA	5	10	42592	42601	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017431	AG	3	6	42716	42721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017431	TG	3	6	43079	43084	0 %	50 %	50 %	0 %	385241398
111	NC_017431	AC	3	6	43474	43479	50 %	0 %	0 %	50 %	385241399
112	NC_017431	TC	3	6	43643	43648	0 %	50 %	0 %	50 %	385241399
113	NC_017431	TC	3	6	43808	43813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017431	TA	3	6	43961	43966	50 %	50 %	0 %	0 %	385241400
115	NC_017431	TC	3	6	44873	44878	0 %	50 %	0 %	50 %	385241401
116	NC_017431	GA	3	6	45356	45361	50 %	0 %	50 %	0 %	385241402
117	NC_017431	TG	3	6	45574	45579	0 %	50 %	50 %	0 %	385241402
118	NC_017431	AG	3	6	45585	45590	50 %	0 %	50 %	0 %	385241402
119	NC_017431	AG	4	8	46027	46034	50 %	0 %	50 %	0 %	385241403
120	NC_017431	CT	3	6	46218	46223	0 %	50 %	0 %	50 %	385241403
121	NC_017431	TG	3	6	46419	46424	0 %	50 %	50 %	0 %	385241403
122	NC_017431	AG	3	6	46472	46477	50 %	0 %	50 %	0 %	385241403
123	NC_017431	AG	3	6	48044	48049	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017431	AG	3	6	49402	49407	50 %	0 %	50 %	0 %	385241405
125	NC_017431	CA	3	6	50068	50073	50 %	0 %	0 %	50 %	385241406
126	NC_017431	TG	4	8	51397	51404	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017431	TC	3	6	53018	53023	0 %	50 %	0 %	50 %	385241408
128	NC_017431	CA	3	6	53069	53074	50 %	0 %	0 %	50 %	385241408
129	NC_017431	GA	3	6	53490	53495	50 %	0 %	50 %	0 %	385241409
130	NC_017431	CT	3	6	53807	53812	0 %	50 %	0 %	50 %	385241409
131	NC_017431	CT	3	6	54470	54475	0 %	50 %	0 %	50 %	385241410
132	NC_017431	AT	3	6	55678	55683	50 %	50 %	0 %	0 %	385241410
133	NC_017431	GA	3	6	55715	55720	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017431	AG	3	6	56314	56319	50 %	0 %	50 %	0 %	385241411
135	NC_017431	CT	3	6	56613	56618	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017431	GT	3	6	56663	56668	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017431	TG	3	6	57301	57306	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017431	CT	3	6	58185	58190	0 %	50 %	0 %	50 %	385241412
139	NC_017431	GA	3	6	59746	59751	50 %	0 %	50 %	0 %	385241413
140	NC_017431	GT	3	6	59884	59889	0 %	50 %	50 %	0 %	385241413
141	NC_017431	TC	3	6	60632	60637	0 %	50 %	0 %	50 %	385241414
142	NC_017431	GA	3	6	60860	60865	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017431	CA	3	6	61258	61263	50 %	0 %	0 %	50 %	385241415
144	NC_017431	AT	3	6	61508	61513	50 %	50 %	0 %	0 %	385241415
145	NC_017431	GA	3	6	61531	61536	50 %	0 %	50 %	0 %	385241415
146	NC_017431	GA	3	6	61657	61662	50 %	0 %	50 %	0 %	385241415
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