MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/11222 chromosome

Total Repeats: 649

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017430	TGTGA	2	10	3281	3290	20 %	40 %	40 %	0 %	385240434
2	NC_017430	TTGAA	2	10	3637	3646	40 %	40 %	20 %	0 %	385240435
3	NC_017430	GAGAA	2	10	3931	3940	60 %	0 %	40 %	0 %	385240435
4	NC_017430	GAAAA	2	10	4368	4377	80 %	0 %	20 %	0 %	385240435
5	NC_017430	TTACA	2	10	4523	4532	40 %	40 %	0 %	20 %	385240435
6	NC_017430	GTCTT	2	10	5219	5228	0 %	60 %	20 %	20 %	385240436
7	NC_017430	TGGTA	2	10	7691	7700	20 %	40 %	40 %	0 %	385240438
8	NC_017430	CGAAA	2	10	9099	9108	60 %	0 %	20 %	20 %	385240439
9	NC_017430	GGCTG	2	10	9733	9742	0 %	20 %	60 %	20 %	385240440
10	NC_017430	CCTCT	2	10	10525	10534	0 %	40 %	0 %	60 %	385240441
11	NC_017430	AAAGG	2	10	10684	10693	60 %	0 %	40 %	0 %	385240441
12	NC_017430	AAGAA	2	10	11804	11813	80 %	0 %	20 %	0 %	385240442
13	NC_017430	AAAGA	2	10	13202	13211	80 %	0 %	20 %	0 %	385240443
14	NC_017430	GGTGT	2	10	13306	13315	0 %	40 %	60 %	0 %	385240443
15	NC_017430	GATTT	2	10	15049	15058	20 %	60 %	20 %	0 %	385240445
16	NC_017430	CGTTC	2	10	16160	16169	0 %	40 %	20 %	40 %	385240446
17	NC_017430	GCTTC	2	10	16533	16542	0 %	40 %	20 %	40 %	385240446
18	NC_017430	GAAGG	2	10	16904	16913	40 %	0 %	60 %	0 %	385240446
19	NC_017430	GTTGT	2	10	20330	20339	0 %	60 %	40 %	0 %	385240449
20	NC_017430	AAGAT	2	10	21442	21451	60 %	20 %	20 %	0 %	385240451
21	NC_017430	TTTGC	2	10	22053	22062	0 %	60 %	20 %	20 %	385240451
22	NC_017430	GGAAA	2	10	23807	23816	60 %	0 %	40 %	0 %	385240451
23	NC_017430	AGAGG	2	10	25532	25541	40 %	0 %	60 %	0 %	385240452
24	NC_017430	GGAGA	2	10	27311	27320	40 %	0 %	60 %	0 %	385240453
25	NC_017430	GGATA	2	10	27337	27346	40 %	20 %	40 %	0 %	385240453
26	NC_017430	ATCCG	2	10	28062	28071	20 %	20 %	20 %	40 %	385240455
27	NC_017430	AGGGT	2	10	28580	28589	20 %	20 %	60 %	0 %	385240455
28	NC_017430	CCTAT	2	10	29620	29629	20 %	40 %	0 %	40 %	385240456
29	NC_017430	GAAGG	2	10	30419	30428	40 %	0 %	60 %	0 %	385240457
30	NC_017430	GAGCT	2	10	31459	31468	20 %	20 %	40 %	20 %	385240458
31	NC_017430	CTATT	2	10	36133	36142	20 %	60 %	0 %	20 %	385240464
32	NC_017430	TCCTA	2	10	36180	36189	20 %	40 %	0 %	40 %	385240464
33	NC_017430	ACGAT	2	10	38096	38105	40 %	20 %	20 %	20 %	385240465
34	NC_017430	TTTGA	2	10	38461	38470	20 %	60 %	20 %	0 %	385240465
35	NC_017430	AGCAA	2	10	42112	42121	60 %	0 %	20 %	20 %	385240468
36	NC_017430	CGATG	2	10	42169	42178	20 %	20 %	40 %	20 %	385240468
37	NC_017430	TGCAA	2	10	42327	42336	40 %	20 %	20 %	20 %	385240469
38	NC_017430	CAAAA	2	10	42646	42655	80 %	0 %	0 %	20 %	385240469
39	NC_017430	TTTAT	2	10	44243	44252	20 %	80 %	0 %	0 %	385240473
40	NC_017430	CTTTC	2	10	46339	46348	0 %	60 %	0 %	40 %	385240475
41	NC_017430	AGTTT	2	10	46878	46887	20 %	60 %	20 %	0 %	385240475
42	NC_017430	CTTTT	2	10	50041	50050	0 %	80 %	0 %	20 %	385240478
43	NC_017430	CCGTA	2	10	53816	53825	20 %	20 %	20 %	40 %	385240481
44	NC_017430	TCAGA	2	10	54707	54716	40 %	20 %	20 %	20 %	385240482
45	NC_017430	TTATC	2	10	55234	55243	20 %	60 %	0 %	20 %	385240482
46	NC_017430	TGAGT	2	10	55255	55264	20 %	40 %	40 %	0 %	385240482
47	NC_017430	GTTGT	2	10	56302	56311	0 %	60 %	40 %	0 %	385240483
48	NC_017430	GAGCA	2	10	59818	59827	40 %	0 %	40 %	20 %	385240485
49	NC_017430	TGTGA	2	10	62267	62276	20 %	40 %	40 %	0 %	385240487
50	NC_017430	AGTGA	2	10	63794	63803	40 %	20 %	40 %	0 %	385240488
51	NC_017430	CCTTC	2	10	64068	64077	0 %	40 %	0 %	60 %	385240488
52	NC_017430	AGGAG	2	10	66296	66305	40 %	0 %	60 %	0 %	385240490
53	NC_017430	GTTAA	2	10	66426	66435	40 %	40 %	20 %	0 %	385240490
54	NC_017430	CAAGC	2	10	68804	68813	40 %	0 %	20 %	40 %	385240492
55	NC_017430	GCGAT	2	10	69864	69873	20 %	20 %	40 %	20 %	385240493
56	NC_017430	CTCTT	2	10	70218	70227	0 %	60 %	0 %	40 %	385240493
57	NC_017430	AGGGG	2	10	70864	70873	20 %	0 %	80 %	0 %	385240493
58	NC_017430	AAGAA	2	10	70906	70915	80 %	0 %	20 %	0 %	385240493
59	NC_017430	ATTGG	2	10	72196	72205	20 %	40 %	40 %	0 %	385240495
60	NC_017430	GAAAA	2	10	73268	73277	80 %	0 %	20 %	0 %	385240495
61	NC_017430	TGGGA	2	10	73685	73694	20 %	20 %	60 %	0 %	385240496
62	NC_017430	TATTT	2	10	76298	76307	20 %	80 %	0 %	0 %	385240497
63	NC_017430	TGTCT	2	10	80090	80099	0 %	60 %	20 %	20 %	385240501
64	NC_017430	TTACT	2	10	80597	80606	20 %	60 %	0 %	20 %	385240501
65	NC_017430	AGAAA	2	10	81987	81996	80 %	0 %	20 %	0 %	385240503
66	NC_017430	GGAAG	2	10	82500	82509	40 %	0 %	60 %	0 %	385240503
67	NC_017430	GATCC	2	10	86051	86060	20 %	20 %	20 %	40 %	385240506
68	NC_017430	AGAGC	2	10	87386	87395	40 %	0 %	40 %	20 %	385240507
69	NC_017430	TTTTC	2	10	91118	91127	0 %	80 %	0 %	20 %	385240510
70	NC_017430	GGATG	2	10	91378	91387	20 %	20 %	60 %	0 %	385240511
71	NC_017430	CAACA	2	10	92917	92926	60 %	0 %	0 %	40 %	385240512
72	NC_017430	ACAGC	2	10	93962	93971	40 %	0 %	20 %	40 %	385240514
73	NC_017430	GGAAC	2	10	94674	94683	40 %	0 %	40 %	20 %	385240515
74	NC_017430	GGATT	2	10	95574	95583	20 %	40 %	40 %	0 %	385240515
75	NC_017430	AGCAT	2	10	95595	95604	40 %	20 %	20 %	20 %	385240515
76	NC_017430	TTTGC	2	10	96810	96819	0 %	60 %	20 %	20 %	385240517
77	NC_017430	ATTCA	2	10	97074	97083	40 %	40 %	0 %	20 %	385240517
78	NC_017430	GATCC	2	10	97333	97342	20 %	20 %	20 %	40 %	385240517
79	NC_017430	GTTTT	2	10	97754	97763	0 %	80 %	20 %	0 %	385240517
80	NC_017430	AAGCT	2	10	98957	98966	40 %	20 %	20 %	20 %	385240518
81	NC_017430	AGGGG	2	10	99316	99325	20 %	0 %	80 %	0 %	385240518
82	NC_017430	ATAGC	2	10	100015	100024	40 %	20 %	20 %	20 %	385240519
83	NC_017430	AGCGA	2	10	102942	102951	40 %	0 %	40 %	20 %	385240521
84	NC_017430	TTTCT	2	10	103300	103309	0 %	80 %	0 %	20 %	385240521
85	NC_017430	ATCAT	2	10	104506	104515	40 %	40 %	0 %	20 %	385240522
86	NC_017430	GGCAT	2	10	105214	105223	20 %	20 %	40 %	20 %	385240522
87	NC_017430	AAAGC	2	10	108940	108949	60 %	0 %	20 %	20 %	385240525
88	NC_017430	GCATT	2	10	110100	110109	20 %	40 %	20 %	20 %	385240527
89	NC_017430	TGTTT	2	10	114777	114786	0 %	80 %	20 %	0 %	385240530
90	NC_017430	CATGT	2	10	115155	115164	20 %	40 %	20 %	20 %	385240530
91	NC_017430	TATCG	2	10	115859	115868	20 %	40 %	20 %	20 %	385240530
92	NC_017430	TTTCT	2	10	116375	116384	0 %	80 %	0 %	20 %	385240531
93	NC_017430	AAAGA	2	10	118620	118629	80 %	0 %	20 %	0 %	385240533
94	NC_017430	GCTTC	2	10	122610	122619	0 %	40 %	20 %	40 %	385240536
95	NC_017430	TACAA	2	10	126399	126408	60 %	20 %	0 %	20 %	385240540
96	NC_017430	ATCCA	2	10	128804	128813	40 %	20 %	0 %	40 %	385240543
97	NC_017430	GAAGA	2	10	130354	130363	60 %	0 %	40 %	0 %	385240543
98	NC_017430	AAAAG	2	10	132267	132276	80 %	0 %	20 %	0 %	385240544
99	NC_017430	GATTC	2	10	132598	132607	20 %	40 %	20 %	20 %	385240544
100	NC_017430	ATTGG	2	10	135883	135892	20 %	40 %	40 %	0 %	385240547
101	NC_017430	ATTGT	2	10	135916	135925	20 %	60 %	20 %	0 %	385240547
102	NC_017430	TGTTT	2	10	136342	136351	0 %	80 %	20 %	0 %	385240548
103	NC_017430	TCCAG	2	10	140088	140097	20 %	20 %	20 %	40 %	385240554
104	NC_017430	GTACA	2	10	140819	140828	40 %	20 %	20 %	20 %	385240555
105	NC_017430	TAGAT	2	10	141192	141201	40 %	40 %	20 %	0 %	385240555
106	NC_017430	AAAAC	2	10	142084	142093	80 %	0 %	0 %	20 %	385240556
107	NC_017430	TGCTA	2	10	143170	143179	20 %	40 %	20 %	20 %	385240558
108	NC_017430	GGAGC	2	10	143217	143226	20 %	0 %	60 %	20 %	385240558
109	NC_017430	CTGGG	2	10	144631	144640	0 %	20 %	60 %	20 %	385240560
110	NC_017430	GTTTT	2	10	145378	145387	0 %	80 %	20 %	0 %	385240561
111	NC_017430	GAACC	2	10	149112	149121	40 %	0 %	20 %	40 %	385240562
112	NC_017430	ATTCT	2	10	152608	152617	20 %	60 %	0 %	20 %	385240566
113	NC_017430	CTGTG	2	10	152812	152821	0 %	40 %	40 %	20 %	385240566
114	NC_017430	TTCTT	2	10	155285	155294	0 %	80 %	0 %	20 %	385240569
115	NC_017430	AGGAA	2	10	159842	159851	60 %	0 %	40 %	0 %	385240573
116	NC_017430	AGAGA	2	10	163073	163082	60 %	0 %	40 %	0 %	385240576
117	NC_017430	AGCAA	2	10	163508	163517	60 %	0 %	20 %	20 %	385240576
118	NC_017430	CAAAA	2	10	167011	167020	80 %	0 %	0 %	20 %	385240578
119	NC_017430	AAGAG	2	10	167844	167853	60 %	0 %	40 %	0 %	385240578
120	NC_017430	GTTTT	2	10	174668	174677	0 %	80 %	20 %	0 %	385240582
121	NC_017430	TATTG	2	10	174691	174700	20 %	60 %	20 %	0 %	385240582
122	NC_017430	CAGCA	2	10	175050	175059	40 %	0 %	20 %	40 %	385240582
123	NC_017430	TAGGA	2	10	175357	175366	40 %	20 %	40 %	0 %	385240583
124	NC_017430	TGATT	2	10	177284	177293	20 %	60 %	20 %	0 %	385240584
125	NC_017430	TCAAT	2	10	177925	177934	40 %	40 %	0 %	20 %	385240584
126	NC_017430	TTTTC	2	10	177964	177973	0 %	80 %	0 %	20 %	385240584
127	NC_017430	AGAGT	2	10	180477	180486	40 %	20 %	40 %	0 %	385240586
128	NC_017430	TTGAA	2	10	181010	181019	40 %	40 %	20 %	0 %	385240587
129	NC_017430	TTGAG	2	10	182570	182579	20 %	40 %	40 %	0 %	385240588
130	NC_017430	GAATG	2	10	182595	182604	40 %	20 %	40 %	0 %	385240588
131	NC_017430	AGAGA	2	10	184638	184647	60 %	0 %	40 %	0 %	385240591
132	NC_017430	ACGAT	2	10	186710	186719	40 %	20 %	20 %	20 %	385240593
133	NC_017430	GGATC	2	10	189800	189809	20 %	20 %	40 %	20 %	385240595
134	NC_017430	CAGAT	2	10	189915	189924	40 %	20 %	20 %	20 %	385240595
135	NC_017430	ACGAT	2	10	190834	190843	40 %	20 %	20 %	20 %	385240596
136	NC_017430	TTGTA	2	10	191812	191821	20 %	60 %	20 %	0 %	385240596
137	NC_017430	TATGC	2	10	192217	192226	20 %	40 %	20 %	20 %	385240597
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140	NC_017430	TATCA	2	10	192585	192594	40 %	40 %	0 %	20 %	385240598
141	NC_017430	GATCT	2	10	192731	192740	20 %	40 %	20 %	20 %	385240598
142	NC_017430	GATTA	2	10	193984	193993	40 %	40 %	20 %	0 %	385240600
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157	NC_017430	TTTTC	2	10	224718	224727	0 %	80 %	0 %	20 %	385240630
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262	NC_017430	CTTGG	2	10	405135	405144	0 %	40 %	40 %	20 %	385240791
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