MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis G/11222 chromosome

Total Repeats: 14089

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017430	GCC	2	6	4	9	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017430	TGC	2	6	63	68	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017430	ATT	2	6	75	80	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017430	CGA	2	6	97	102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017430	TAT	2	6	239	244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017430	GAA	2	6	286	291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017430	AGA	2	6	315	320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017430	AGA	2	6	369	374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017430	CAA	2	6	442	447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017430	TTG	2	6	585	590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017430	CTC	2	6	614	619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_017430	GAT	2	6	676	681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017430	GAT	2	6	730	735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017430	ATG	2	6	793	798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017430	CCT	2	6	952	957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_017430	CTT	2	6	1013	1018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017430	CAG	2	6	1078	1083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017430	TGA	2	6	1139	1144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017430	AAG	2	6	1220	1225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017430	TGG	2	6	1236	1241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017430	CTT	2	6	1243	1248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017430	ATG	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240432
23	NC_017430	GTG	2	6	1342	1347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385240432
24	NC_017430	TCC	2	6	1351	1356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240432
25	NC_017430	AGC	2	6	1365	1370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240432
26	NC_017430	AGC	2	6	1392	1397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240432
27	NC_017430	AAG	2	6	1403	1408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240432
28	NC_017430	TAC	2	6	1441	1446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240432
29	NC_017430	GCT	2	6	1451	1456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240432
30	NC_017430	AAC	2	6	1549	1554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240432
31	NC_017430	AGA	2	6	1561	1566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240432
32	NC_017430	TAA	2	6	1651	1656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017430	AGA	2	6	1817	1822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240433
34	NC_017430	ATC	2	6	1824	1829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240433
35	NC_017430	TGC	2	6	1844	1849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240433
36	NC_017430	CAT	2	6	1968	1973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240433
37	NC_017430	AGA	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240433
38	NC_017430	AAG	2	6	2026	2031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240433
39	NC_017430	GGA	2	6	2061	2066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240433
40	NC_017430	ATC	2	6	2190	2195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240434
41	NC_017430	ATA	2	6	2340	2345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240434
42	NC_017430	AAC	2	6	2365	2370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240434
43	NC_017430	GGT	2	6	2419	2424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385240434
44	NC_017430	AAT	2	6	2525	2530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240434
45	NC_017430	TTC	2	6	2560	2565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240434
46	NC_017430	GCA	2	6	2579	2584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240434
47	NC_017430	GGA	2	6	2627	2632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240434
48	NC_017430	CAG	2	6	2646	2651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240434
49	NC_017430	GTT	2	6	2663	2668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240434
50	NC_017430	GGT	2	6	2755	2760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385240434
51	NC_017430	AAG	2	6	2913	2918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240434
52	NC_017430	ATT	2	6	2975	2980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240434
53	NC_017430	TTG	2	6	3027	3032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240434
54	NC_017430	AAG	2	6	3138	3143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240434
55	NC_017430	AAG	2	6	3153	3158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240434
56	NC_017430	CAG	2	6	3195	3200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240434
57	NC_017430	GCT	2	6	3266	3271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240434
58	NC_017430	AAG	2	6	3432	3437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240434
59	NC_017430	CAG	2	6	3482	3487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240434
60	NC_017430	GGA	2	6	3569	3574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240434
61	NC_017430	AAT	2	6	3579	3584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240434
62	NC_017430	ATT	2	6	3659	3664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240435
63	NC_017430	TGA	2	6	3689	3694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240435
64	NC_017430	GTA	2	6	3921	3926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240435
65	NC_017430	AGA	2	6	3968	3973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240435
66	NC_017430	GAA	2	6	4152	4157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240435
67	NC_017430	CGT	2	6	4284	4289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240435
68	NC_017430	GTT	2	6	4335	4340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240435
69	NC_017430	TGA	2	6	4472	4477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240435
70	NC_017430	TTG	2	6	4567	4572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240435
71	NC_017430	TTC	2	6	4708	4713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240435
72	NC_017430	TCT	2	6	4800	4805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240435
73	NC_017430	AGA	2	6	4820	4825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240435
74	NC_017430	GTT	2	6	4847	4852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240435
75	NC_017430	GGT	2	6	4895	4900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385240435
76	NC_017430	CTC	2	6	4999	5004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240435
77	NC_017430	AGC	2	6	5030	5035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240435
78	NC_017430	GCA	2	6	5055	5060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017430	AGA	2	6	5082	5087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017430	ATT	2	6	5149	5154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240436
81	NC_017430	TCT	2	6	5167	5172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240436
82	NC_017430	GCT	2	6	5213	5218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240436
83	NC_017430	GAT	2	6	5248	5253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240436
84	NC_017430	ACG	2	6	5286	5291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240436
85	NC_017430	GAA	2	6	5310	5315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240436
86	NC_017430	AGA	3	9	5387	5395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240436
87	NC_017430	GCT	2	6	5396	5401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240436
88	NC_017430	AGA	2	6	5405	5410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240436
89	NC_017430	TGG	2	6	5441	5446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385240436
90	NC_017430	AGA	3	9	5459	5467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240436
91	NC_017430	GGA	2	6	5468	5473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240436
92	NC_017430	TCA	2	6	5653	5658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240436
93	NC_017430	GGA	2	6	5690	5695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240436
94	NC_017430	CTT	2	6	5750	5755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240436
95	NC_017430	CTG	2	6	5756	5761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240436
96	NC_017430	CAG	2	6	5911	5916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240436
97	NC_017430	CTT	2	6	6362	6367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017430	AGG	2	6	6440	6445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240437
99	NC_017430	GAA	2	6	6484	6489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240437
100	NC_017430	GCA	2	6	6748	6753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240437
101	NC_017430	AAG	2	6	6789	6794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240437
102	NC_017430	TGC	2	6	6822	6827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240437
103	NC_017430	TTA	2	6	7154	7159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017430	GAA	2	6	7203	7208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017430	ATG	2	6	7238	7243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017430	TCG	2	6	7315	7320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240438
107	NC_017430	TCC	2	6	7358	7363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240438
108	NC_017430	GTT	2	6	7466	7471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240438
109	NC_017430	TTA	2	6	7836	7841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240438
110	NC_017430	TTC	2	6	8159	8164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240438
111	NC_017430	GAA	2	6	8303	8308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240439
112	NC_017430	ACC	2	6	8431	8436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385240439
113	NC_017430	CTT	2	6	8484	8489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240439
114	NC_017430	GAG	2	6	8564	8569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240439
115	NC_017430	ATA	2	6	8581	8586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240439
116	NC_017430	AGG	2	6	8605	8610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240439
117	NC_017430	GAA	2	6	8785	8790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240439
118	NC_017430	CAG	2	6	8801	8806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240439
119	NC_017430	TGT	2	6	8872	8877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240439
120	NC_017430	GAG	2	6	8887	8892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240439
121	NC_017430	TAC	2	6	8955	8960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240439
122	NC_017430	GTT	2	6	9059	9064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240439
123	NC_017430	AAG	2	6	9083	9088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240439
124	NC_017430	GAG	2	6	9109	9114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240439
125	NC_017430	TTC	3	9	9176	9184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017430	ATC	2	6	9192	9197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017430	GAA	2	6	9230	9235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017430	CCT	2	6	9331	9336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_017430	TTA	2	6	9397	9402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240440
130	NC_017430	AGA	2	6	9432	9437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240440
131	NC_017430	TGC	2	6	9662	9667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240440
132	NC_017430	GAA	2	6	9689	9694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240440
133	NC_017430	TCG	2	6	9749	9754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240440
134	NC_017430	TGG	2	6	9772	9777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385240440
135	NC_017430	GTA	2	6	9823	9828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240441
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260	NC_017430	AAT	2	6	19795	19800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240448
261	NC_017430	AAG	2	6	19838	19843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240448
262	NC_017430	CTT	3	9	19892	19900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_017430	TAA	2	6	19934	19939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240449
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265	NC_017430	CTT	2	6	20104	20109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240449
266	NC_017430	TCC	2	6	20204	20209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240449
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270	NC_017430	CCT	2	6	20565	20570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
271	NC_017430	GGA	2	6	20611	20616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
272	NC_017430	AGA	3	9	20651	20659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
273	NC_017430	TGG	2	6	20870	20875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
274	NC_017430	AAC	2	6	20909	20914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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278	NC_017430	TCC	2	6	21244	21249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
279	NC_017430	AAT	2	6	21420	21425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_017430	TGT	2	6	21623	21628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240451
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329	NC_017430	GAA	2	6	26430	26435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240452
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336	NC_017430	CTA	2	6	27143	27148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240453
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341	NC_017430	TTC	2	6	27657	27662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240454
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386	NC_017430	ATG	2	6	31192	31197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240457
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