MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/11222 chromosome

Total Repeats: 12781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017430	ATG	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240432
2	NC_017430	GTG	2	6	1342	1347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385240432
3	NC_017430	TCC	2	6	1351	1356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240432
4	NC_017430	AGC	2	6	1365	1370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240432
5	NC_017430	AGC	2	6	1392	1397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240432
6	NC_017430	AAG	2	6	1403	1408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240432
7	NC_017430	TAC	2	6	1441	1446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240432
8	NC_017430	GCT	2	6	1451	1456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240432
9	NC_017430	AAC	2	6	1549	1554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240432
10	NC_017430	AGA	2	6	1561	1566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240432
11	NC_017430	AGA	2	6	1817	1822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240433
12	NC_017430	ATC	2	6	1824	1829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240433
13	NC_017430	TGC	2	6	1844	1849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240433
14	NC_017430	CAT	2	6	1968	1973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240433
15	NC_017430	AGA	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240433
16	NC_017430	AAG	2	6	2026	2031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240433
17	NC_017430	GGA	2	6	2061	2066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240433
18	NC_017430	ATC	2	6	2190	2195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240434
19	NC_017430	ATA	2	6	2340	2345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240434
20	NC_017430	AAC	2	6	2365	2370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240434
21	NC_017430	GGT	2	6	2419	2424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385240434
22	NC_017430	AAT	2	6	2525	2530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240434
23	NC_017430	TTC	2	6	2560	2565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240434
24	NC_017430	GCA	2	6	2579	2584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240434
25	NC_017430	GGA	2	6	2627	2632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240434
26	NC_017430	CAG	2	6	2646	2651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240434
27	NC_017430	GTT	2	6	2663	2668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240434
28	NC_017430	GGT	2	6	2755	2760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385240434
29	NC_017430	AAG	2	6	2913	2918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240434
30	NC_017430	ATT	2	6	2975	2980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240434
31	NC_017430	TTG	2	6	3027	3032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240434
32	NC_017430	AAG	2	6	3138	3143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240434
33	NC_017430	AAG	2	6	3153	3158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240434
34	NC_017430	CAG	2	6	3195	3200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240434
35	NC_017430	GCT	2	6	3266	3271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240434
36	NC_017430	AAG	2	6	3432	3437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240434
37	NC_017430	CAG	2	6	3482	3487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240434
38	NC_017430	GGA	2	6	3569	3574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240434
39	NC_017430	AAT	2	6	3579	3584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240434
40	NC_017430	ATT	2	6	3659	3664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240435
41	NC_017430	TGA	2	6	3689	3694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240435
42	NC_017430	GTA	2	6	3921	3926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240435
43	NC_017430	AGA	2	6	3968	3973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240435
44	NC_017430	GAA	2	6	4152	4157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240435
45	NC_017430	CGT	2	6	4284	4289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240435
46	NC_017430	GTT	2	6	4335	4340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240435
47	NC_017430	TGA	2	6	4472	4477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240435
48	NC_017430	TTG	2	6	4567	4572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240435
49	NC_017430	TTC	2	6	4708	4713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240435
50	NC_017430	TCT	2	6	4800	4805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240435
51	NC_017430	AGA	2	6	4820	4825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240435
52	NC_017430	GTT	2	6	4847	4852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240435
53	NC_017430	GGT	2	6	4895	4900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385240435
54	NC_017430	CTC	2	6	4999	5004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240435
55	NC_017430	AGC	2	6	5030	5035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240435
56	NC_017430	ATT	2	6	5149	5154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240436
57	NC_017430	TCT	2	6	5167	5172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240436
58	NC_017430	GCT	2	6	5213	5218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240436
59	NC_017430	GAT	2	6	5248	5253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240436
60	NC_017430	ACG	2	6	5286	5291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240436
61	NC_017430	GAA	2	6	5310	5315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240436
62	NC_017430	AGA	3	9	5387	5395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240436
63	NC_017430	GCT	2	6	5396	5401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240436
64	NC_017430	AGA	2	6	5405	5410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240436
65	NC_017430	TGG	2	6	5441	5446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385240436
66	NC_017430	AGA	3	9	5459	5467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240436
67	NC_017430	GGA	2	6	5468	5473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240436
68	NC_017430	TCA	2	6	5653	5658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240436
69	NC_017430	GGA	2	6	5690	5695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240436
70	NC_017430	CTT	2	6	5750	5755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240436
71	NC_017430	CTG	2	6	5756	5761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240436
72	NC_017430	CAG	2	6	5911	5916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240436
73	NC_017430	AGG	2	6	6440	6445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240437
74	NC_017430	GAA	2	6	6484	6489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240437
75	NC_017430	GCA	2	6	6748	6753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240437
76	NC_017430	AAG	2	6	6789	6794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240437
77	NC_017430	TGC	2	6	6822	6827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240437
78	NC_017430	TCG	2	6	7315	7320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240438
79	NC_017430	TCC	2	6	7358	7363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240438
80	NC_017430	GTT	2	6	7466	7471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240438
81	NC_017430	TTA	2	6	7836	7841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240438
82	NC_017430	TTC	2	6	8159	8164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240438
83	NC_017430	GAA	2	6	8303	8308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240439
84	NC_017430	ACC	2	6	8431	8436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385240439
85	NC_017430	CTT	2	6	8484	8489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240439
86	NC_017430	GAG	2	6	8564	8569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240439
87	NC_017430	ATA	2	6	8581	8586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240439
88	NC_017430	AGG	2	6	8605	8610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240439
89	NC_017430	GAA	2	6	8785	8790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240439
90	NC_017430	CAG	2	6	8801	8806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240439
91	NC_017430	TGT	2	6	8872	8877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240439
92	NC_017430	GAG	2	6	8887	8892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240439
93	NC_017430	TAC	2	6	8955	8960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240439
94	NC_017430	GTT	2	6	9059	9064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240439
95	NC_017430	AAG	2	6	9083	9088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240439
96	NC_017430	GAG	2	6	9109	9114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240439
97	NC_017430	TTA	2	6	9397	9402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240440
98	NC_017430	AGA	2	6	9432	9437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240440
99	NC_017430	TGC	2	6	9662	9667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240440
100	NC_017430	GAA	2	6	9689	9694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240440
101	NC_017430	TCG	2	6	9749	9754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240440
102	NC_017430	TGG	2	6	9772	9777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385240440
103	NC_017430	GTA	2	6	9823	9828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240441
104	NC_017430	AGC	2	6	9983	9988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240441
105	NC_017430	CTT	2	6	9997	10002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240441
106	NC_017430	ATG	2	6	10158	10163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240441
107	NC_017430	CGT	2	6	10185	10190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240441
108	NC_017430	GAC	2	6	10355	10360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240441
109	NC_017430	GGT	2	6	10442	10447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385240441
110	NC_017430	GAA	2	6	10488	10493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240441
111	NC_017430	CAA	2	6	10510	10515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240441
112	NC_017430	GGA	2	6	10572	10577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240441
113	NC_017430	CGA	2	6	10629	10634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240441
114	NC_017430	CTT	2	6	10735	10740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240441
115	NC_017430	TTG	2	6	10775	10780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240441
116	NC_017430	CTT	2	6	10789	10794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240441
117	NC_017430	ATC	2	6	10899	10904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240441
118	NC_017430	TGT	2	6	10905	10910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240441
119	NC_017430	AGA	2	6	11011	11016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240441
120	NC_017430	AGG	2	6	11050	11055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240441
121	NC_017430	GAT	2	6	11110	11115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240441
122	NC_017430	CGA	2	6	11116	11121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240441
123	NC_017430	AAT	2	6	11329	11334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240442
124	NC_017430	AGG	2	6	11572	11577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240442
125	NC_017430	ATA	3	9	11582	11590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240442
126	NC_017430	TAT	2	6	11601	11606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240442
127	NC_017430	ACA	2	6	11612	11617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240442
128	NC_017430	TAC	2	6	11905	11910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240442
129	NC_017430	TCA	2	6	11912	11917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240442
130	NC_017430	TTC	2	6	11950	11955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240442
131	NC_017430	TTA	2	6	11966	11971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240442
132	NC_017430	AGA	2	6	12007	12012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240442
133	NC_017430	CAA	2	6	12309	12314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240442
134	NC_017430	ATC	2	6	12332	12337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240442
135	NC_017430	ATA	2	6	12473	12478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240442
136	NC_017430	ATA	2	6	12565	12570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240443
137	NC_017430	TAC	2	6	12693	12698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240443
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140	NC_017430	CAT	2	6	12845	12850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240443
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142	NC_017430	TTC	2	6	12888	12893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240443
143	NC_017430	TGA	2	6	13043	13048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240443
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145	NC_017430	CAA	2	6	13212	13217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240443
146	NC_017430	AAT	2	6	13265	13270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240443
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153	NC_017430	TGT	2	6	14172	14177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240444
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157	NC_017430	AAG	2	6	14668	14673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240444
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161	NC_017430	TTA	2	6	14869	14874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240444
162	NC_017430	CTT	2	6	14890	14895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240444
163	NC_017430	TTC	2	6	14986	14991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240445
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169	NC_017430	TAT	2	6	15466	15471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240445
170	NC_017430	TCA	2	6	15697	15702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240445
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