MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis G/9768 chromosome

Total Repeats: 762

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017429	TGTGA	2	10	3281	3290	20 %	40 %	40 %	0 %	385239513
2	NC_017429	TTGAA	2	10	3637	3646	40 %	40 %	20 %	0 %	385239514
3	NC_017429	GAGAA	2	10	3931	3940	60 %	0 %	40 %	0 %	385239514
4	NC_017429	GAAAA	2	10	4368	4377	80 %	0 %	20 %	0 %	385239514
5	NC_017429	TTACA	2	10	4523	4532	40 %	40 %	0 %	20 %	385239514
6	NC_017429	GTCTT	2	10	5219	5228	0 %	60 %	20 %	20 %	385239515
7	NC_017429	TATTT	2	10	7034	7043	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017429	TGGTA	2	10	7691	7700	20 %	40 %	40 %	0 %	385239517
9	NC_017429	CGAAA	2	10	9099	9108	60 %	0 %	20 %	20 %	385239518
10	NC_017429	GGCTG	2	10	9733	9742	0 %	20 %	60 %	20 %	385239519
11	NC_017429	CCTCT	2	10	10525	10534	0 %	40 %	0 %	60 %	385239520
12	NC_017429	AAAGG	2	10	10684	10693	60 %	0 %	40 %	0 %	385239520
13	NC_017429	AAGAA	2	10	11804	11813	80 %	0 %	20 %	0 %	385239521
14	NC_017429	AAAGA	2	10	13202	13211	80 %	0 %	20 %	0 %	385239522
15	NC_017429	GGTGT	2	10	13306	13315	0 %	40 %	60 %	0 %	385239522
16	NC_017429	GATTT	2	10	15049	15058	20 %	60 %	20 %	0 %	385239524
17	NC_017429	CGTTC	2	10	16160	16169	0 %	40 %	20 %	40 %	385239525
18	NC_017429	GCTTC	2	10	16533	16542	0 %	40 %	20 %	40 %	385239525
19	NC_017429	GAAGG	2	10	16904	16913	40 %	0 %	60 %	0 %	385239525
20	NC_017429	GTTGT	2	10	20330	20339	0 %	60 %	40 %	0 %	385239528
21	NC_017429	AAGAT	2	10	21442	21451	60 %	20 %	20 %	0 %	385239530
22	NC_017429	TTTGC	2	10	22053	22062	0 %	60 %	20 %	20 %	385239530
23	NC_017429	GGAAA	2	10	23807	23816	60 %	0 %	40 %	0 %	385239530
24	NC_017429	AGAGG	2	10	25532	25541	40 %	0 %	60 %	0 %	385239531
25	NC_017429	GGAGA	2	10	27311	27320	40 %	0 %	60 %	0 %	385239532
26	NC_017429	GGATA	2	10	27337	27346	40 %	20 %	40 %	0 %	385239532
27	NC_017429	ATCCG	2	10	28062	28071	20 %	20 %	20 %	40 %	385239534
28	NC_017429	AGGGT	2	10	28580	28589	20 %	20 %	60 %	0 %	385239534
29	NC_017429	CCTAT	2	10	29620	29629	20 %	40 %	0 %	40 %	385239535
30	NC_017429	GAAGG	2	10	30419	30428	40 %	0 %	60 %	0 %	385239536
31	NC_017429	GAGCT	2	10	31459	31468	20 %	20 %	40 %	20 %	385239537
32	NC_017429	AAAGA	2	10	33092	33101	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017429	CTATT	2	10	36133	36142	20 %	60 %	0 %	20 %	385239543
34	NC_017429	TCCTA	2	10	36180	36189	20 %	40 %	0 %	40 %	385239543
35	NC_017429	ACGAT	2	10	38096	38105	40 %	20 %	20 %	20 %	385239544
36	NC_017429	TTTGA	2	10	38461	38470	20 %	60 %	20 %	0 %	385239544
37	NC_017429	AGCAA	2	10	42112	42121	60 %	0 %	20 %	20 %	385239547
38	NC_017429	CGATG	2	10	42169	42178	20 %	20 %	40 %	20 %	385239547
39	NC_017429	TGCAA	2	10	42327	42336	40 %	20 %	20 %	20 %	385239548
40	NC_017429	CAAAA	2	10	42646	42655	80 %	0 %	0 %	20 %	385239548
41	NC_017429	TTTAT	2	10	44243	44252	20 %	80 %	0 %	0 %	385239552
42	NC_017429	CTTTC	2	10	46339	46348	0 %	60 %	0 %	40 %	385239554
43	NC_017429	AGTTT	2	10	46878	46887	20 %	60 %	20 %	0 %	385239554
44	NC_017429	GAAGA	2	10	48011	48020	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017429	CTATT	2	10	49590	49599	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017429	CTTTT	2	10	50041	50050	0 %	80 %	0 %	20 %	385239557
47	NC_017429	CCGTA	2	10	53768	53777	20 %	20 %	20 %	40 %	385239560
48	NC_017429	AATTT	2	10	54008	54017	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017429	TCAGA	2	10	54626	54635	40 %	20 %	20 %	20 %	385239561
50	NC_017429	TTATC	2	10	55153	55162	20 %	60 %	0 %	20 %	385239561
51	NC_017429	TGAGT	2	10	55174	55183	20 %	40 %	40 %	0 %	385239561
52	NC_017429	GTTGT	2	10	56221	56230	0 %	60 %	40 %	0 %	385239562
53	NC_017429	GAGCA	2	10	59733	59742	40 %	0 %	40 %	20 %	385239564
54	NC_017429	TGTGA	2	10	62182	62191	20 %	40 %	40 %	0 %	385239566
55	NC_017429	AGTGA	2	10	63709	63718	40 %	20 %	40 %	0 %	385239567
56	NC_017429	CCTTC	2	10	63983	63992	0 %	40 %	0 %	60 %	385239567
57	NC_017429	AGGAG	2	10	66211	66220	40 %	0 %	60 %	0 %	385239569
58	NC_017429	GTTAA	2	10	66341	66350	40 %	40 %	20 %	0 %	385239569
59	NC_017429	CAAGC	2	10	68719	68728	40 %	0 %	20 %	40 %	385239571
60	NC_017429	AAAAG	2	10	68967	68976	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017429	GCGAT	2	10	69779	69788	20 %	20 %	40 %	20 %	385239572
62	NC_017429	CTCTT	2	10	70133	70142	0 %	60 %	0 %	40 %	385239572
63	NC_017429	AGGGG	2	10	70779	70788	20 %	0 %	80 %	0 %	385239572
64	NC_017429	AAGAA	2	10	70821	70830	80 %	0 %	20 %	0 %	385239572
65	NC_017429	CTTGC	2	10	71910	71919	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_017429	ATTGG	2	10	72111	72120	20 %	40 %	40 %	0 %	385239574
67	NC_017429	GAAAA	2	10	73183	73192	80 %	0 %	20 %	0 %	385239574
68	NC_017429	TGGGA	2	10	73600	73609	20 %	20 %	60 %	0 %	385239575
69	NC_017429	TATTT	2	10	76127	76136	20 %	80 %	0 %	0 %	385239576
70	NC_017429	AAAAG	2	10	76660	76669	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017429	ATCAA	2	10	78358	78367	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017429	TGTCT	2	10	79920	79929	0 %	60 %	20 %	20 %	385239580
73	NC_017429	TTACT	2	10	80427	80436	20 %	60 %	0 %	20 %	385239580
74	NC_017429	AGAAA	2	10	81817	81826	80 %	0 %	20 %	0 %	385239582
75	NC_017429	GGAAG	2	10	82330	82339	40 %	0 %	60 %	0 %	385239582
76	NC_017429	TTTGT	2	10	85095	85104	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017429	GATCC	2	10	85881	85890	20 %	20 %	20 %	40 %	385239585
78	NC_017429	AGAGC	2	10	87216	87225	40 %	0 %	40 %	20 %	385239586
79	NC_017429	AATAA	2	10	88094	88103	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017429	TTTTC	2	10	90948	90957	0 %	80 %	0 %	20 %	385239589
81	NC_017429	GGATG	2	10	91208	91217	20 %	20 %	60 %	0 %	385239590
82	NC_017429	CAACA	2	10	92747	92756	60 %	0 %	0 %	40 %	385239591
83	NC_017429	ACAGC	2	10	93792	93801	40 %	0 %	20 %	40 %	385239593
84	NC_017429	CTTTT	2	10	94166	94175	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017429	GGAAC	2	10	94504	94513	40 %	0 %	40 %	20 %	385239594
86	NC_017429	GGATT	2	10	95404	95413	20 %	40 %	40 %	0 %	385239594
87	NC_017429	CAATC	2	10	96506	96515	40 %	20 %	0 %	40 %	385239596
88	NC_017429	TTTGC	2	10	96640	96649	0 %	60 %	20 %	20 %	385239596
89	NC_017429	ATTCA	2	10	96904	96913	40 %	40 %	0 %	20 %	385239596
90	NC_017429	GATCC	2	10	97163	97172	20 %	20 %	20 %	40 %	385239596
91	NC_017429	GTTTT	2	10	97584	97593	0 %	80 %	20 %	0 %	385239596
92	NC_017429	ACAAA	2	10	97711	97720	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017429	AAGCT	2	10	98787	98796	40 %	20 %	20 %	20 %	385239597
94	NC_017429	AGGGG	2	10	99146	99155	20 %	0 %	80 %	0 %	385239597
95	NC_017429	ATAGC	2	10	99845	99854	40 %	20 %	20 %	20 %	385239598
96	NC_017429	TTCCC	2	10	100449	100458	0 %	40 %	0 %	60 %	385239599
97	NC_017429	AGCGA	2	10	102773	102782	40 %	0 %	40 %	20 %	385239601
98	NC_017429	TTTCT	2	10	103131	103140	0 %	80 %	0 %	20 %	385239601
99	NC_017429	CTTCT	2	10	103185	103194	0 %	60 %	0 %	40 %	385239601
100	NC_017429	ATCAT	2	10	104337	104346	40 %	40 %	0 %	20 %	385239602
101	NC_017429	GGCAT	2	10	105045	105054	20 %	20 %	40 %	20 %	385239602
102	NC_017429	AAAGC	2	10	108771	108780	60 %	0 %	20 %	20 %	385239605
103	NC_017429	GCATT	2	10	109931	109940	20 %	40 %	20 %	20 %	385239607
104	NC_017429	GCTCT	2	10	113984	113993	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_017429	TGTTT	2	10	114608	114617	0 %	80 %	20 %	0 %	385239610
106	NC_017429	CATGT	2	10	114986	114995	20 %	40 %	20 %	20 %	385239610
107	NC_017429	TATCG	2	10	115690	115699	20 %	40 %	20 %	20 %	385239610
108	NC_017429	TTTCT	2	10	116206	116215	0 %	80 %	0 %	20 %	385239611
109	NC_017429	AAAGA	2	10	118451	118460	80 %	0 %	20 %	0 %	385239613
110	NC_017429	GCTTC	2	10	122441	122450	0 %	40 %	20 %	40 %	385239616
111	NC_017429	TACAA	2	10	126230	126239	60 %	20 %	0 %	20 %	385239620
112	NC_017429	ATCCA	2	10	128635	128644	40 %	20 %	0 %	40 %	385239623
113	NC_017429	GAAGA	2	10	130185	130194	60 %	0 %	40 %	0 %	385239623
114	NC_017429	AAAAG	2	10	132098	132107	80 %	0 %	20 %	0 %	385239624
115	NC_017429	GATTC	2	10	132429	132438	20 %	40 %	20 %	20 %	385239624
116	NC_017429	GGATA	2	10	135049	135058	40 %	20 %	40 %	0 %	385239626
117	NC_017429	ATTGG	2	10	135714	135723	20 %	40 %	40 %	0 %	385239627
118	NC_017429	ATTGT	2	10	135747	135756	20 %	60 %	20 %	0 %	385239627
119	NC_017429	TGTTT	2	10	136173	136182	0 %	80 %	20 %	0 %	385239628
120	NC_017429	TTGCA	2	10	136963	136972	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_017429	TCCAG	2	10	139917	139926	20 %	20 %	20 %	40 %	385239634
122	NC_017429	GTACA	2	10	140648	140657	40 %	20 %	20 %	20 %	385239635
123	NC_017429	TAGAT	2	10	141021	141030	40 %	40 %	20 %	0 %	385239635
124	NC_017429	AAAAG	2	10	141433	141442	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017429	AAAAC	2	10	141913	141922	80 %	0 %	0 %	20 %	385239636
126	NC_017429	TGCTA	2	10	142999	143008	20 %	40 %	20 %	20 %	385239638
127	NC_017429	GGAGC	2	10	143046	143055	20 %	0 %	60 %	20 %	385239638
128	NC_017429	CTGGG	2	10	144460	144469	0 %	20 %	60 %	20 %	385239640
129	NC_017429	GTTTT	2	10	145207	145216	0 %	80 %	20 %	0 %	385239641
130	NC_017429	GAACC	2	10	148941	148950	40 %	0 %	20 %	40 %	385239642
131	NC_017429	ATTCT	2	10	152437	152446	20 %	60 %	0 %	20 %	385239646
132	NC_017429	CTGTG	2	10	152641	152650	0 %	40 %	40 %	20 %	385239646
133	NC_017429	TTCTT	2	10	155114	155123	0 %	80 %	0 %	20 %	385239649
134	NC_017429	TTCTA	2	10	157216	157225	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017429	AGGAA	2	10	159670	159679	60 %	0 %	40 %	0 %	385239653
136	NC_017429	CAAAA	2	10	161673	161682	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017429	AGAGA	2	10	162901	162910	60 %	0 %	40 %	0 %	385239656
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