MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis G/9768 chromosome

Total Repeats: 14092

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017429	GCC	2	6	4	9	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017429	TGC	2	6	63	68	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017429	ATT	2	6	75	80	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017429	CGA	2	6	97	102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017429	TAT	2	6	239	244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017429	GAA	2	6	286	291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017429	AGA	2	6	315	320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017429	AGA	2	6	369	374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017429	CAA	2	6	442	447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017429	TTG	2	6	585	590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017429	CTC	2	6	614	619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_017429	GAT	2	6	676	681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017429	GAT	2	6	730	735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017429	ATG	2	6	793	798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017429	CCT	2	6	952	957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_017429	CTT	2	6	1013	1018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017429	CAG	2	6	1078	1083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017429	TGA	2	6	1139	1144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017429	AAG	2	6	1220	1225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017429	TGG	2	6	1236	1241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017429	CTT	2	6	1243	1248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017429	ATG	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239511
23	NC_017429	GTG	2	6	1342	1347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385239511
24	NC_017429	TCC	2	6	1351	1356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385239511
25	NC_017429	AGC	2	6	1365	1370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239511
26	NC_017429	AGC	2	6	1392	1397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239511
27	NC_017429	AAG	2	6	1403	1408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239511
28	NC_017429	TAC	2	6	1441	1446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239511
29	NC_017429	GCT	2	6	1451	1456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239511
30	NC_017429	AAC	2	6	1549	1554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385239511
31	NC_017429	AGA	2	6	1561	1566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239511
32	NC_017429	TAA	2	6	1651	1656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017429	AGA	2	6	1817	1822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239512
34	NC_017429	ATC	2	6	1824	1829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239512
35	NC_017429	TGC	2	6	1844	1849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239512
36	NC_017429	CAT	2	6	1968	1973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239512
37	NC_017429	AGA	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239512
38	NC_017429	AAG	2	6	2026	2031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239512
39	NC_017429	GGA	2	6	2061	2066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385239512
40	NC_017429	ATC	2	6	2190	2195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239513
41	NC_017429	ATA	2	6	2340	2345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239513
42	NC_017429	AAC	2	6	2365	2370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385239513
43	NC_017429	GGT	2	6	2419	2424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385239513
44	NC_017429	AAT	2	6	2525	2530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239513
45	NC_017429	TTC	2	6	2560	2565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239513
46	NC_017429	GCA	2	6	2579	2584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239513
47	NC_017429	GGA	2	6	2627	2632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385239513
48	NC_017429	CAG	2	6	2646	2651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239513
49	NC_017429	GTT	2	6	2663	2668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385239513
50	NC_017429	GGT	2	6	2755	2760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385239513
51	NC_017429	AAG	2	6	2913	2918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239513
52	NC_017429	ATT	2	6	2975	2980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385239513
53	NC_017429	TTG	2	6	3027	3032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385239513
54	NC_017429	AAG	2	6	3138	3143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239513
55	NC_017429	AAG	2	6	3153	3158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239513
56	NC_017429	CAG	2	6	3195	3200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239513
57	NC_017429	GCT	2	6	3266	3271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239513
58	NC_017429	AAG	2	6	3432	3437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239513
59	NC_017429	CAG	2	6	3482	3487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239513
60	NC_017429	GGA	2	6	3569	3574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385239513
61	NC_017429	AAT	2	6	3579	3584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239513
62	NC_017429	ATT	2	6	3659	3664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385239514
63	NC_017429	TGA	2	6	3689	3694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239514
64	NC_017429	GTA	2	6	3921	3926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239514
65	NC_017429	AGA	2	6	3968	3973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239514
66	NC_017429	GAA	2	6	4152	4157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239514
67	NC_017429	CGT	2	6	4284	4289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239514
68	NC_017429	GTT	2	6	4335	4340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385239514
69	NC_017429	TGA	2	6	4472	4477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239514
70	NC_017429	TTG	2	6	4567	4572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385239514
71	NC_017429	TTC	2	6	4708	4713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239514
72	NC_017429	TCT	2	6	4800	4805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239514
73	NC_017429	AGA	2	6	4820	4825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239514
74	NC_017429	GTT	2	6	4847	4852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385239514
75	NC_017429	GGT	2	6	4895	4900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385239514
76	NC_017429	CTC	2	6	4999	5004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385239514
77	NC_017429	AGC	2	6	5030	5035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239514
78	NC_017429	GCA	2	6	5055	5060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017429	AGA	2	6	5082	5087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017429	ATT	2	6	5149	5154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385239515
81	NC_017429	TCT	2	6	5167	5172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239515
82	NC_017429	GCT	2	6	5213	5218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239515
83	NC_017429	GAT	2	6	5248	5253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239515
84	NC_017429	ACG	2	6	5286	5291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239515
85	NC_017429	GAA	2	6	5310	5315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239515
86	NC_017429	AGA	3	9	5387	5395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239515
87	NC_017429	GCT	2	6	5396	5401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239515
88	NC_017429	AGA	2	6	5405	5410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239515
89	NC_017429	TGG	2	6	5441	5446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385239515
90	NC_017429	AGA	3	9	5459	5467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239515
91	NC_017429	GGA	2	6	5468	5473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385239515
92	NC_017429	TCA	2	6	5653	5658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239515
93	NC_017429	GGA	2	6	5690	5695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385239515
94	NC_017429	CTT	2	6	5750	5755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239515
95	NC_017429	CTG	2	6	5756	5761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239515
96	NC_017429	CAG	2	6	5911	5916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239515
97	NC_017429	CTT	2	6	6362	6367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017429	AGG	2	6	6440	6445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385239516
99	NC_017429	GAA	2	6	6484	6489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239516
100	NC_017429	GCA	2	6	6748	6753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239516
101	NC_017429	AAG	2	6	6789	6794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239516
102	NC_017429	TGC	2	6	6822	6827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239516
103	NC_017429	TTA	2	6	7154	7159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017429	GAA	2	6	7203	7208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017429	ATG	2	6	7238	7243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017429	TCG	2	6	7315	7320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239517
107	NC_017429	TCC	2	6	7358	7363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385239517
108	NC_017429	GTT	2	6	7466	7471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385239517
109	NC_017429	TTA	2	6	7836	7841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385239517
110	NC_017429	TTC	2	6	8159	8164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239517
111	NC_017429	GAA	2	6	8303	8308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239518
112	NC_017429	ACC	2	6	8431	8436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385239518
113	NC_017429	CTT	2	6	8484	8489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239518
114	NC_017429	GAG	2	6	8564	8569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385239518
115	NC_017429	ATA	2	6	8581	8586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239518
116	NC_017429	AGG	2	6	8605	8610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385239518
117	NC_017429	GAA	2	6	8785	8790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239518
118	NC_017429	CAG	2	6	8801	8806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239518
119	NC_017429	TGT	2	6	8872	8877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385239518
120	NC_017429	GAG	2	6	8887	8892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385239518
121	NC_017429	TAC	2	6	8955	8960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239518
122	NC_017429	GTT	2	6	9059	9064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385239518
123	NC_017429	AAG	2	6	9083	9088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239518
124	NC_017429	GAG	2	6	9109	9114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385239518
125	NC_017429	TTC	3	9	9176	9184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017429	ATC	2	6	9192	9197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017429	GAA	2	6	9230	9235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017429	CCT	2	6	9331	9336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_017429	TTA	2	6	9397	9402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385239519
130	NC_017429	AGA	2	6	9432	9437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239519
131	NC_017429	TGC	2	6	9662	9667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239519
132	NC_017429	GAA	2	6	9689	9694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239519
133	NC_017429	TCG	2	6	9749	9754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239519
134	NC_017429	TGG	2	6	9772	9777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385239519
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