MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis G/9768 chromosome

Total Repeats: 2358

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017429	TC	3	6	225	230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017429	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017429	TC	3	6	1670	1675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017429	AG	3	6	2153	2158	50 %	0 %	50 %	0 %	385239513
5	NC_017429	GA	3	6	2821	2826	50 %	0 %	50 %	0 %	385239513
6	NC_017429	AT	3	6	4514	4519	50 %	50 %	0 %	0 %	385239514
7	NC_017429	TC	3	6	5264	5269	0 %	50 %	0 %	50 %	385239515
8	NC_017429	GA	3	6	5275	5280	50 %	0 %	50 %	0 %	385239515
9	NC_017429	AT	3	6	5379	5384	50 %	50 %	0 %	0 %	385239515
10	NC_017429	TG	3	6	5532	5537	0 %	50 %	50 %	0 %	385239515
11	NC_017429	AG	3	6	5940	5945	50 %	0 %	50 %	0 %	385239515
12	NC_017429	GA	3	6	6998	7003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017429	AC	3	6	7648	7653	50 %	0 %	0 %	50 %	385239517
14	NC_017429	AG	3	6	8391	8396	50 %	0 %	50 %	0 %	385239518
15	NC_017429	CT	4	8	8510	8517	0 %	50 %	0 %	50 %	385239518
16	NC_017429	GT	3	6	8592	8597	0 %	50 %	50 %	0 %	385239518
17	NC_017429	GA	3	6	9866	9871	50 %	0 %	50 %	0 %	385239520
18	NC_017429	AG	3	6	10083	10088	50 %	0 %	50 %	0 %	385239520
19	NC_017429	TA	3	6	11248	11253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017429	AG	3	6	11309	11314	50 %	0 %	50 %	0 %	385239521
21	NC_017429	TA	3	6	11869	11874	50 %	50 %	0 %	0 %	385239521
22	NC_017429	TG	3	6	12772	12777	0 %	50 %	50 %	0 %	385239522
23	NC_017429	AG	3	6	12921	12926	50 %	0 %	50 %	0 %	385239522
24	NC_017429	AG	4	8	13077	13084	50 %	0 %	50 %	0 %	385239522
25	NC_017429	TA	3	6	13339	13344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017429	TA	4	8	13563	13570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017429	AC	3	6	14406	14411	50 %	0 %	0 %	50 %	385239523
28	NC_017429	AG	3	6	15745	15750	50 %	0 %	50 %	0 %	385239524
29	NC_017429	TC	3	6	15785	15790	0 %	50 %	0 %	50 %	385239524
30	NC_017429	GA	3	6	16314	16319	50 %	0 %	50 %	0 %	385239525
31	NC_017429	AG	3	6	16385	16390	50 %	0 %	50 %	0 %	385239525
32	NC_017429	GA	3	6	17169	17174	50 %	0 %	50 %	0 %	385239525
33	NC_017429	AG	3	6	17515	17520	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017429	GA	3	6	17528	17533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017429	GA	3	6	17772	17777	50 %	0 %	50 %	0 %	385239526
36	NC_017429	TC	3	6	18222	18227	0 %	50 %	0 %	50 %	385239526
37	NC_017429	CT	3	6	18450	18455	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017429	TC	3	6	18650	18655	0 %	50 %	0 %	50 %	385239527
39	NC_017429	GA	3	6	18665	18670	50 %	0 %	50 %	0 %	385239527
40	NC_017429	GA	3	6	18764	18769	50 %	0 %	50 %	0 %	385239527
41	NC_017429	AG	3	6	19230	19235	50 %	0 %	50 %	0 %	385239527
42	NC_017429	AG	4	8	19516	19523	50 %	0 %	50 %	0 %	385239527
43	NC_017429	GT	3	6	19779	19784	0 %	50 %	50 %	0 %	385239527
44	NC_017429	AG	3	6	20007	20012	50 %	0 %	50 %	0 %	385239528
45	NC_017429	TG	3	6	20120	20125	0 %	50 %	50 %	0 %	385239528
46	NC_017429	AG	3	6	20516	20521	50 %	0 %	50 %	0 %	385239529
47	NC_017429	GA	3	6	20674	20679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017429	AG	3	6	21191	21196	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017429	CT	3	6	21260	21265	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017429	CT	4	8	21917	21924	0 %	50 %	0 %	50 %	385239530
51	NC_017429	AT	3	6	22187	22192	50 %	50 %	0 %	0 %	385239530
52	NC_017429	AT	3	6	22511	22516	50 %	50 %	0 %	0 %	385239530
53	NC_017429	GA	3	6	23830	23835	50 %	0 %	50 %	0 %	385239530
54	NC_017429	GA	3	6	23922	23927	50 %	0 %	50 %	0 %	385239530
55	NC_017429	AG	3	6	24303	24308	50 %	0 %	50 %	0 %	385239530
56	NC_017429	GA	3	6	25720	25725	50 %	0 %	50 %	0 %	385239531
57	NC_017429	GT	3	6	25740	25745	0 %	50 %	50 %	0 %	385239531
58	NC_017429	TA	3	6	25942	25947	50 %	50 %	0 %	0 %	385239531
59	NC_017429	GA	3	6	26388	26393	50 %	0 %	50 %	0 %	385239531
60	NC_017429	GA	3	6	26512	26517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017429	CT	3	6	26519	26524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017429	AT	3	6	26805	26810	50 %	50 %	0 %	0 %	385239532
63	NC_017429	GA	3	6	27019	27024	50 %	0 %	50 %	0 %	385239532
64	NC_017429	TC	3	6	27887	27892	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017429	AG	3	6	27970	27975	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017429	TG	3	6	28393	28398	0 %	50 %	50 %	0 %	385239534
67	NC_017429	TC	3	6	28446	28451	0 %	50 %	0 %	50 %	385239534
68	NC_017429	GC	4	8	28860	28867	0 %	0 %	50 %	50 %	385239534
69	NC_017429	TA	3	6	28982	28987	50 %	50 %	0 %	0 %	385239534
70	NC_017429	GA	3	6	29933	29938	50 %	0 %	50 %	0 %	385239535
71	NC_017429	AG	3	6	30031	30036	50 %	0 %	50 %	0 %	385239536
72	NC_017429	TC	3	6	30140	30145	0 %	50 %	0 %	50 %	385239536
73	NC_017429	GA	3	6	30761	30766	50 %	0 %	50 %	0 %	385239536
74	NC_017429	GA	3	6	31229	31234	50 %	0 %	50 %	0 %	385239536
75	NC_017429	AT	3	6	31370	31375	50 %	50 %	0 %	0 %	385239537
76	NC_017429	TC	3	6	31655	31660	0 %	50 %	0 %	50 %	385239538
77	NC_017429	GC	3	6	32085	32090	0 %	0 %	50 %	50 %	385239538
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79	NC_017429	AG	3	6	32267	32272	50 %	0 %	50 %	0 %	385239538
80	NC_017429	TC	3	6	33764	33769	0 %	50 %	0 %	50 %	385239540
81	NC_017429	AG	3	6	33777	33782	50 %	0 %	50 %	0 %	385239540
82	NC_017429	AG	3	6	33915	33920	50 %	0 %	50 %	0 %	385239541
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84	NC_017429	GA	4	8	34631	34638	50 %	0 %	50 %	0 %	385239542
85	NC_017429	GA	3	6	36384	36389	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017429	AT	3	6	36486	36491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017429	GA	3	6	36534	36539	50 %	0 %	50 %	0 %	385239544
88	NC_017429	CT	3	6	37018	37023	0 %	50 %	0 %	50 %	385239544
89	NC_017429	AG	3	6	37529	37534	50 %	0 %	50 %	0 %	385239544
90	NC_017429	AG	3	6	38075	38080	50 %	0 %	50 %	0 %	385239544
91	NC_017429	AG	3	6	38602	38607	50 %	0 %	50 %	0 %	385239544
92	NC_017429	CT	3	6	38753	38758	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017429	GA	3	6	39386	39391	50 %	0 %	50 %	0 %	385239545
94	NC_017429	AG	3	6	39523	39528	50 %	0 %	50 %	0 %	385239545
95	NC_017429	AG	3	6	39623	39628	50 %	0 %	50 %	0 %	385239545
96	NC_017429	CT	3	6	40124	40129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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99	NC_017429	GA	3	6	40814	40819	50 %	0 %	50 %	0 %	385239546
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101	NC_017429	GC	3	6	40888	40893	0 %	0 %	50 %	50 %	385239546
102	NC_017429	GA	3	6	41028	41033	50 %	0 %	50 %	0 %	385239546
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104	NC_017429	GA	3	6	42004	42009	50 %	0 %	50 %	0 %	385239547
105	NC_017429	GA	4	8	42014	42021	50 %	0 %	50 %	0 %	385239547
106	NC_017429	AG	3	6	42250	42255	50 %	0 %	50 %	0 %	385239547
107	NC_017429	CT	3	6	42316	42321	0 %	50 %	0 %	50 %	385239548
108	NC_017429	GA	5	10	42592	42601	50 %	0 %	50 %	0 %	385239548
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111	NC_017429	TC	3	6	43808	43813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017429	TA	3	6	43961	43966	50 %	50 %	0 %	0 %	385239551
113	NC_017429	TC	3	6	44873	44878	0 %	50 %	0 %	50 %	385239552
114	NC_017429	GA	3	6	45356	45361	50 %	0 %	50 %	0 %	385239553
115	NC_017429	TG	3	6	45574	45579	0 %	50 %	50 %	0 %	385239553
116	NC_017429	AG	3	6	45585	45590	50 %	0 %	50 %	0 %	385239553
117	NC_017429	AG	4	8	46026	46033	50 %	0 %	50 %	0 %	385239554
118	NC_017429	CT	3	6	46217	46222	0 %	50 %	0 %	50 %	385239554
119	NC_017429	TG	3	6	46418	46423	0 %	50 %	50 %	0 %	385239554
120	NC_017429	AG	3	6	46471	46476	50 %	0 %	50 %	0 %	385239554
121	NC_017429	AG	3	6	48043	48048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017429	AG	3	6	49395	49400	50 %	0 %	50 %	0 %	385239556
123	NC_017429	CA	3	6	50061	50066	50 %	0 %	0 %	50 %	385239557
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125	NC_017429	TC	3	6	52856	52861	0 %	50 %	0 %	50 %	385239559
126	NC_017429	CA	3	6	52907	52912	50 %	0 %	0 %	50 %	385239559
127	NC_017429	GA	3	6	53328	53333	50 %	0 %	50 %	0 %	385239560
128	NC_017429	CT	3	6	53645	53650	0 %	50 %	0 %	50 %	385239560
129	NC_017429	CT	3	6	54308	54313	0 %	50 %	0 %	50 %	385239561
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131	NC_017429	GA	3	6	55535	55540	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017429	CT	3	6	56433	56438	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017429	GT	3	6	56483	56488	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017429	TG	3	6	57187	57192	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017429	CT	3	6	58068	58073	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017429	GA	3	6	59633	59638	50 %	0 %	50 %	0 %	385239564
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139	NC_017429	GA	3	6	60747	60752	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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141	NC_017429	AT	3	6	61395	61400	50 %	50 %	0 %	0 %	385239566
142	NC_017429	GA	3	6	61418	61423	50 %	0 %	50 %	0 %	385239566
143	NC_017429	GA	3	6	61544	61549	50 %	0 %	50 %	0 %	385239566
144	NC_017429	GA	3	6	62359	62364	50 %	0 %	50 %	0 %	385239566
145	NC_017429	TC	3	6	62780	62785	0 %	50 %	0 %	50 %	385239566
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