MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-10

Total Repeats: 16

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017428	TAGAAA	2	12	598	609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387826682
2	NC_017428	AAATGG	2	12	2390	2401	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387826684
3	NC_017428	CTGATA	2	12	2986	2997	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387826685
4	NC_017428	ATCAAG	2	12	3232	3243	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387826685
5	NC_017428	GAATTT	2	12	5210	5221	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387826688
6	NC_017428	TGAACT	2	12	5248	5259	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387826688
7	NC_017428	AATGGA	2	12	6897	6908	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387826692
8	NC_017428	ACAGAA	2	12	13721	13732	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387826700
9	NC_017428	TTGATA	2	12	14892	14903	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387826701
10	NC_017428	AATGGT	2	12	15333	15344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826702
11	NC_017428	CAAAAG	2	12	15960	15971	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387826704
12	NC_017428	AGTTAA	2	12	16222	16233	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387826705
13	NC_017428	TTTATT	2	12	17223	17234	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387826707
14	NC_017428	ATATTG	2	12	20882	20893	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387826711
15	NC_017428	TAAAAA	2	12	21221	21232	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387826711
16	NC_017428	TACTGA	2	12	26643	26654	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387826717

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.