MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-3

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017427	GT	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	387826640
2	NC_017427	GA	3	6	1739	1744	50 %	0 %	50 %	0 %	387826641
3	NC_017427	GT	3	6	2299	2304	0 %	50 %	50 %	0 %	387826642
4	NC_017427	CA	3	6	2498	2503	50 %	0 %	0 %	50 %	387826642
5	NC_017427	TA	3	6	2964	2969	50 %	50 %	0 %	0 %	387826643
6	NC_017427	AT	3	6	3178	3183	50 %	50 %	0 %	0 %	387826643
7	NC_017427	AT	3	6	4271	4276	50 %	50 %	0 %	0 %	387826645
8	NC_017427	TG	3	6	5380	5385	0 %	50 %	50 %	0 %	387826646
9	NC_017427	AG	3	6	5521	5526	50 %	0 %	50 %	0 %	387826647
10	NC_017427	AT	3	6	5914	5919	50 %	50 %	0 %	0 %	387826648
11	NC_017427	TA	3	6	5930	5935	50 %	50 %	0 %	0 %	387826648
12	NC_017427	AT	4	8	6406	6413	50 %	50 %	0 %	0 %	387826649
13	NC_017427	AT	3	6	6543	6548	50 %	50 %	0 %	0 %	387826649
14	NC_017427	AC	3	6	7051	7056	50 %	0 %	0 %	50 %	387826650
15	NC_017427	TA	3	6	7499	7504	50 %	50 %	0 %	0 %	387826650
16	NC_017427	AG	3	6	9170	9175	50 %	0 %	50 %	0 %	387826654
17	NC_017427	AT	3	6	9801	9806	50 %	50 %	0 %	0 %	387826654
18	NC_017427	AT	3	6	9930	9935	50 %	50 %	0 %	0 %	387826654
19	NC_017427	TA	3	6	10179	10184	50 %	50 %	0 %	0 %	387826654
20	NC_017427	TA	3	6	10692	10697	50 %	50 %	0 %	0 %	387826655
21	NC_017427	AT	3	6	11222	11227	50 %	50 %	0 %	0 %	387826656
22	NC_017427	AT	4	8	11537	11544	50 %	50 %	0 %	0 %	387826656
23	NC_017427	AC	3	6	11730	11735	50 %	0 %	0 %	50 %	387826656
24	NC_017427	AC	3	6	11745	11750	50 %	0 %	0 %	50 %	387826656
25	NC_017427	CA	3	6	12113	12118	50 %	0 %	0 %	50 %	387826657
26	NC_017427	TA	3	6	12236	12241	50 %	50 %	0 %	0 %	387826657
27	NC_017427	AT	3	6	12557	12562	50 %	50 %	0 %	0 %	387826658
28	NC_017427	CA	3	6	12788	12793	50 %	0 %	0 %	50 %	387826658
29	NC_017427	AT	3	6	13185	13190	50 %	50 %	0 %	0 %	387826659
30	NC_017427	AT	3	6	13870	13875	50 %	50 %	0 %	0 %	387826660
31	NC_017427	TA	3	6	15092	15097	50 %	50 %	0 %	0 %	387826661
32	NC_017427	AT	3	6	15111	15116	50 %	50 %	0 %	0 %	387826661
33	NC_017427	TA	3	6	15179	15184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017427	AT	3	6	15494	15499	50 %	50 %	0 %	0 %	387826663
35	NC_017427	AT	3	6	15904	15909	50 %	50 %	0 %	0 %	387826664
36	NC_017427	AT	3	6	16072	16077	50 %	50 %	0 %	0 %	387826664
37	NC_017427	AT	3	6	16377	16382	50 %	50 %	0 %	0 %	387826665
38	NC_017427	AT	3	6	16604	16609	50 %	50 %	0 %	0 %	387826666
39	NC_017427	AT	3	6	16782	16787	50 %	50 %	0 %	0 %	387826666
40	NC_017427	AT	3	6	17010	17015	50 %	50 %	0 %	0 %	387826666
41	NC_017427	AT	3	6	17843	17848	50 %	50 %	0 %	0 %	387826668
42	NC_017427	TA	3	6	18813	18818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017427	AT	3	6	19237	19242	50 %	50 %	0 %	0 %	387826669
44	NC_017427	AC	3	6	19286	19291	50 %	0 %	0 %	50 %	387826669
45	NC_017427	TA	3	6	20190	20195	50 %	50 %	0 %	0 %	387826669
46	NC_017427	TA	3	6	21201	21206	50 %	50 %	0 %	0 %	387826671
47	NC_017427	TA	3	6	21516	21521	50 %	50 %	0 %	0 %	387826671
48	NC_017427	AG	3	6	21957	21962	50 %	0 %	50 %	0 %	387826672
49	NC_017427	AT	3	6	22331	22336	50 %	50 %	0 %	0 %	387826673
50	NC_017427	AT	3	6	22935	22940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017427	AT	4	8	23051	23058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017427	TA	3	6	23206	23211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017427	TA	3	6	23597	23602	50 %	50 %	0 %	0 %	387826674
54	NC_017427	AG	3	6	23638	23643	50 %	0 %	50 %	0 %	387826674
55	NC_017427	TA	3	6	23678	23683	50 %	50 %	0 %	0 %	387826674
56	NC_017427	AG	3	6	24094	24099	50 %	0 %	50 %	0 %	387826674
57	NC_017427	AT	3	6	24787	24792	50 %	50 %	0 %	0 %	387826675
58	NC_017427	GA	3	6	25228	25233	50 %	0 %	50 %	0 %	387826676
59	NC_017427	TA	3	6	25482	25487	50 %	50 %	0 %	0 %	387826676
60	NC_017427	AT	3	6	26043	26048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017427	TA	3	6	26190	26195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017427	AG	3	6	26645	26650	50 %	0 %	50 %	0 %	387826677
63	NC_017427	TA	3	6	27062	27067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017427	CT	3	6	27068	27073	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017427	TG	3	6	27896	27901	0 %	50 %	50 %	0 %	387826679
66	NC_017427	AT	3	6	28238	28243	50 %	50 %	0 %	0 %	387826679
67	NC_017427	AT	3	6	28762	28767	50 %	50 %	0 %	0 %	387826680
68	NC_017427	AG	3	6	29666	29671	50 %	0 %	50 %	0 %	387826680

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.