MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-8

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017426	TAGAAA	2	12	598	609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387826597
2	NC_017426	CTGATA	2	12	2984	2995	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387826600
3	NC_017426	GATAAA	2	12	4479	4490	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387826602
4	NC_017426	GAATTT	2	12	5203	5214	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387826603
5	NC_017426	TGAACT	2	12	5241	5252	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387826603
6	NC_017426	AAATCT	2	12	7672	7683	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387826607
7	NC_017426	AAATAA	2	12	10255	10266	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387826611
8	NC_017426	TTGATA	2	12	14946	14957	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387826618
9	NC_017426	AGTTAA	2	12	16277	16288	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387826622
10	NC_017426	AATTTA	2	12	16877	16888	50 %	50 %	0 %	0 %	387826623
11	NC_017426	AATTTA	2	12	17084	17095	50 %	50 %	0 %	0 %	387826623
12	NC_017426	TAATGA	2	12	17407	17418	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387826624
13	NC_017426	TTTTCG	2	12	18351	18362	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	387826625
14	NC_017426	GATTAT	2	12	21241	21252	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387826628
15	NC_017426	TAAAAA	2	12	21392	21403	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387826628
16	NC_017426	AGAAAA	2	12	27676	27687	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387826635
17	NC_017426	AAGAGA	2	12	27688	27699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826635
18	NC_017426	AAATGT	2	12	28135	28146	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387826635
19	NC_017426	AAGATA	2	12	28212	28223	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387826635

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.