MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-8

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017426	AAAAC	2	10	81	90	80 %	0 %	0 %	20 %	387826597
2	NC_017426	ATTAA	2	10	1780	1789	60 %	40 %	0 %	0 %	387826598
3	NC_017426	TAAAT	2	10	2415	2424	60 %	40 %	0 %	0 %	387826599
4	NC_017426	ATTTA	2	10	5695	5704	40 %	60 %	0 %	0 %	387826604
5	NC_017426	GAAAA	2	10	6918	6927	80 %	0 %	20 %	0 %	387826607
6	NC_017426	GAAAA	2	10	10355	10364	80 %	0 %	20 %	0 %	387826612
7	NC_017426	TTAAA	2	10	11868	11877	60 %	40 %	0 %	0 %	387826613
8	NC_017426	AACTT	2	10	12737	12746	40 %	40 %	0 %	20 %	387826615
9	NC_017426	TACTT	2	10	13295	13304	20 %	60 %	0 %	20 %	387826616
10	NC_017426	GAAAA	2	10	13373	13382	80 %	0 %	20 %	0 %	387826616
11	NC_017426	AAAGT	2	10	13395	13404	60 %	20 %	20 %	0 %	387826616
12	NC_017426	ATTCA	2	10	14203	14212	40 %	40 %	0 %	20 %	387826617
13	NC_017426	AGACA	2	10	14503	14512	60 %	0 %	20 %	20 %	387826618
14	NC_017426	ATTAA	2	10	15238	15247	60 %	40 %	0 %	0 %	387826619
15	NC_017426	AGTAA	2	10	15875	15884	60 %	20 %	20 %	0 %	387826621
16	NC_017426	TCACT	2	10	16032	16041	20 %	40 %	0 %	40 %	387826621
17	NC_017426	TTGCT	2	10	16129	16138	0 %	60 %	20 %	20 %	387826622
18	NC_017426	TATGT	2	10	16239	16248	20 %	60 %	20 %	0 %	387826622
19	NC_017426	TAAAA	2	10	17623	17632	80 %	20 %	0 %	0 %	387826624
20	NC_017426	CACTA	2	10	19399	19408	40 %	20 %	0 %	40 %	387826626
21	NC_017426	AGAAA	2	10	21804	21813	80 %	0 %	20 %	0 %	387826629
22	NC_017426	GAGTT	2	10	24524	24533	20 %	40 %	40 %	0 %	387826631
23	NC_017426	ATAAA	2	10	24968	24977	80 %	20 %	0 %	0 %	387826632
24	NC_017426	ACTTG	2	10	25317	25326	20 %	40 %	20 %	20 %	387826632
25	NC_017426	ATTTT	2	10	26065	26074	20 %	80 %	0 %	0 %	387826633
26	NC_017426	GATAA	2	10	26618	26627	60 %	20 %	20 %	0 %	387826634

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.