MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-8

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017426	ATTT	3	12	573	584	25 %	75 %	0 %	0 %	387826597
2	NC_017426	ATTA	2	8	944	951	50 %	50 %	0 %	0 %	387826597
3	NC_017426	GTTC	2	8	1677	1684	0 %	50 %	25 %	25 %	387826598
4	NC_017426	ATAC	2	8	1928	1935	50 %	25 %	0 %	25 %	387826598
5	NC_017426	AAGA	2	8	2380	2387	75 %	0 %	25 %	0 %	387826599
6	NC_017426	ATTT	2	8	2516	2523	25 %	75 %	0 %	0 %	387826599
7	NC_017426	TGCT	2	8	2528	2535	0 %	50 %	25 %	25 %	387826599
8	NC_017426	GCAA	2	8	2676	2683	50 %	0 %	25 %	25 %	387826600
9	NC_017426	ATGT	2	8	3014	3021	25 %	50 %	25 %	0 %	387826600
10	NC_017426	GTAT	2	8	3039	3046	25 %	50 %	25 %	0 %	387826600
11	NC_017426	ATAA	2	8	3121	3128	75 %	25 %	0 %	0 %	387826600
12	NC_017426	CAAT	2	8	3203	3210	50 %	25 %	0 %	25 %	387826600
13	NC_017426	TAAA	2	8	3362	3369	75 %	25 %	0 %	0 %	387826601
14	NC_017426	TTTA	2	8	3889	3896	25 %	75 %	0 %	0 %	387826601
15	NC_017426	AGTA	2	8	4782	4789	50 %	25 %	25 %	0 %	387826602
16	NC_017426	CTAC	2	8	4794	4801	25 %	25 %	0 %	50 %	387826602
17	NC_017426	TCAT	2	8	4841	4848	25 %	50 %	0 %	25 %	387826602
18	NC_017426	TACT	2	8	5150	5157	25 %	50 %	0 %	25 %	387826603
19	NC_017426	AATG	2	8	5396	5403	50 %	25 %	25 %	0 %	387826603
20	NC_017426	AAGT	2	8	6061	6068	50 %	25 %	25 %	0 %	387826605
21	NC_017426	AATT	2	8	6555	6562	50 %	50 %	0 %	0 %	387826606
22	NC_017426	TAAT	2	8	6602	6609	50 %	50 %	0 %	0 %	387826606
23	NC_017426	TTTA	2	8	6998	7005	25 %	75 %	0 %	0 %	387826607
24	NC_017426	AGAA	2	8	7219	7226	75 %	0 %	25 %	0 %	387826607
25	NC_017426	CAAG	2	8	7292	7299	50 %	0 %	25 %	25 %	387826607
26	NC_017426	TAGA	2	8	7644	7651	50 %	25 %	25 %	0 %	387826607
27	NC_017426	CAAA	2	8	8244	8251	75 %	0 %	0 %	25 %	387826608
28	NC_017426	ATTT	2	8	8494	8501	25 %	75 %	0 %	0 %	387826609
29	NC_017426	TGAG	2	8	8598	8605	25 %	25 %	50 %	0 %	387826609
30	NC_017426	CTTG	2	8	8796	8803	0 %	50 %	25 %	25 %	387826610
31	NC_017426	AATT	2	8	8942	8949	50 %	50 %	0 %	0 %	387826610
32	NC_017426	TATG	2	8	9454	9461	25 %	50 %	25 %	0 %	387826611
33	NC_017426	AAAT	2	8	9484	9491	75 %	25 %	0 %	0 %	387826611
34	NC_017426	AGGG	2	8	9672	9679	25 %	0 %	75 %	0 %	387826611
35	NC_017426	AGGG	2	8	9879	9886	25 %	0 %	75 %	0 %	387826611
36	NC_017426	TAGT	2	8	10200	10207	25 %	50 %	25 %	0 %	387826611
37	NC_017426	AGAA	2	8	10395	10402	75 %	0 %	25 %	0 %	387826612
38	NC_017426	CTTT	2	8	10706	10713	0 %	75 %	0 %	25 %	387826612
39	NC_017426	TAAT	2	8	10955	10962	50 %	50 %	0 %	0 %	387826612
40	NC_017426	ATTC	2	8	11668	11675	25 %	50 %	0 %	25 %	387826613
41	NC_017426	TCAA	2	8	12175	12182	50 %	25 %	0 %	25 %	387826614
42	NC_017426	AATT	2	8	12448	12455	50 %	50 %	0 %	0 %	387826614
43	NC_017426	TAAT	2	8	13009	13016	50 %	50 %	0 %	0 %	387826616
44	NC_017426	AAAC	2	8	14091	14098	75 %	0 %	0 %	25 %	387826617
45	NC_017426	TAAT	2	8	14628	14635	50 %	50 %	0 %	0 %	387826618
46	NC_017426	TCTA	2	8	14710	14717	25 %	50 %	0 %	25 %	387826618
47	NC_017426	AATA	2	8	15630	15637	75 %	25 %	0 %	0 %	387826620
48	NC_017426	TCAA	2	8	15665	15672	50 %	25 %	0 %	25 %	387826620
49	NC_017426	CTAT	2	8	15749	15756	25 %	50 %	0 %	25 %	387826620
50	NC_017426	AATA	2	8	15765	15772	75 %	25 %	0 %	0 %	387826620
51	NC_017426	TAAC	2	8	15819	15826	50 %	25 %	0 %	25 %	387826621
52	NC_017426	ATAG	2	8	16838	16845	50 %	25 %	25 %	0 %	387826623
53	NC_017426	ATAG	2	8	16892	16899	50 %	25 %	25 %	0 %	387826623
54	NC_017426	ATAG	2	8	16925	16932	50 %	25 %	25 %	0 %	387826623
55	NC_017426	ATAG	2	8	16958	16965	50 %	25 %	25 %	0 %	387826623
56	NC_017426	CAAA	2	8	17707	17714	75 %	0 %	0 %	25 %	387826624
57	NC_017426	CTTG	2	8	18331	18338	0 %	50 %	25 %	25 %	387826625
58	NC_017426	AAGA	3	12	19680	19691	75 %	0 %	25 %	0 %	387826626
59	NC_017426	AATA	2	8	19807	19814	75 %	25 %	0 %	0 %	387826626
60	NC_017426	GAAA	2	8	19873	19880	75 %	0 %	25 %	0 %	387826626
61	NC_017426	AAAT	2	8	19959	19966	75 %	25 %	0 %	0 %	387826626
62	NC_017426	AACA	2	8	20767	20774	75 %	0 %	0 %	25 %	387826627
63	NC_017426	TTTA	2	8	20791	20798	25 %	75 %	0 %	0 %	387826627
64	NC_017426	TCAA	2	8	20911	20918	50 %	25 %	0 %	25 %	387826628
65	NC_017426	TAAA	2	8	21688	21695	75 %	25 %	0 %	0 %	387826629
66	NC_017426	AGAT	2	8	21782	21789	50 %	25 %	25 %	0 %	387826629
67	NC_017426	GAAA	2	8	21845	21852	75 %	0 %	25 %	0 %	387826629
68	NC_017426	AAAG	2	8	22041	22048	75 %	0 %	25 %	0 %	387826629
69	NC_017426	ATAA	2	8	22440	22447	75 %	25 %	0 %	0 %	387826630
70	NC_017426	ATAG	2	8	22473	22480	50 %	25 %	25 %	0 %	387826630
71	NC_017426	ATAA	2	8	22527	22534	75 %	25 %	0 %	0 %	387826630
72	NC_017426	ATAG	2	8	22560	22567	50 %	25 %	25 %	0 %	387826630
73	NC_017426	ATAG	2	8	22614	22621	50 %	25 %	25 %	0 %	387826630
74	NC_017426	ATAG	2	8	22668	22675	50 %	25 %	25 %	0 %	387826630
75	NC_017426	ATAG	2	8	22722	22729	50 %	25 %	25 %	0 %	387826630
76	NC_017426	ATAG	2	8	22776	22783	50 %	25 %	25 %	0 %	387826630
77	NC_017426	TAAG	2	8	23723	23730	50 %	25 %	25 %	0 %	387826631
78	NC_017426	GATA	2	8	23818	23825	50 %	25 %	25 %	0 %	387826631
79	NC_017426	TGTT	2	8	24086	24093	0 %	75 %	25 %	0 %	387826631
80	NC_017426	TGGT	2	8	24108	24115	0 %	50 %	50 %	0 %	387826631
81	NC_017426	AGAT	2	8	24816	24823	50 %	25 %	25 %	0 %	387826631
82	NC_017426	AAAT	2	8	25538	25545	75 %	25 %	0 %	0 %	387826633
83	NC_017426	TTTA	2	8	25569	25576	25 %	75 %	0 %	0 %	387826633
84	NC_017426	ACCA	2	8	25922	25929	50 %	0 %	0 %	50 %	387826633
85	NC_017426	AATT	2	8	25971	25978	50 %	50 %	0 %	0 %	387826633
86	NC_017426	TTTA	2	8	26094	26101	25 %	75 %	0 %	0 %	387826633
87	NC_017426	GAAA	2	8	27640	27647	75 %	0 %	25 %	0 %	387826635
88	NC_017426	AAGA	2	8	27783	27790	75 %	0 %	25 %	0 %	387826635
89	NC_017426	AAAG	2	8	27817	27824	75 %	0 %	25 %	0 %	387826635
90	NC_017426	AAAT	2	8	27864	27871	75 %	25 %	0 %	0 %	387826635
91	NC_017426	AAAT	2	8	28072	28079	75 %	25 %	0 %	0 %	387826635
92	NC_017426	GTAT	2	8	29495	29502	25 %	50 %	25 %	0 %	387826637
93	NC_017426	TAAA	2	8	29540	29547	75 %	25 %	0 %	0 %	387826637
94	NC_017426	CAAG	2	8	29565	29572	50 %	0 %	25 %	25 %	387826637
95	NC_017426	AATT	2	8	29586	29593	50 %	50 %	0 %	0 %	387826637
96	NC_017426	CAAA	2	8	29745	29752	75 %	0 %	0 %	25 %	387826638
97	NC_017426	AAAT	2	8	29783	29790	75 %	25 %	0 %	0 %	387826638
98	NC_017426	AATT	2	8	29834	29841	50 %	50 %	0 %	0 %	387826638
99	NC_017426	TAGC	2	8	29941	29948	25 %	25 %	25 %	25 %	387826638
100	NC_017426	TGAT	2	8	30148	30155	25 %	50 %	25 %	0 %	387826638
101	NC_017426	AGCA	2	8	30509	30516	50 %	0 %	25 %	25 %	387826638
102	NC_017426	AAAT	2	8	30535	30542	75 %	25 %	0 %	0 %	387826638

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.