MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-8

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017426	GT	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	387826597
2	NC_017426	GA	3	6	1739	1744	50 %	0 %	50 %	0 %	387826598
3	NC_017426	GT	3	6	2299	2304	0 %	50 %	50 %	0 %	387826599
4	NC_017426	CA	3	6	2498	2503	50 %	0 %	0 %	50 %	387826599
5	NC_017426	TA	3	6	2964	2969	50 %	50 %	0 %	0 %	387826600
6	NC_017426	AT	3	6	3178	3183	50 %	50 %	0 %	0 %	387826600
7	NC_017426	AT	3	6	4271	4276	50 %	50 %	0 %	0 %	387826602
8	NC_017426	TG	3	6	5380	5385	0 %	50 %	50 %	0 %	387826603
9	NC_017426	AG	3	6	5521	5526	50 %	0 %	50 %	0 %	387826604
10	NC_017426	AT	3	6	5914	5919	50 %	50 %	0 %	0 %	387826605
11	NC_017426	TA	3	6	5930	5935	50 %	50 %	0 %	0 %	387826605
12	NC_017426	AT	4	8	6406	6413	50 %	50 %	0 %	0 %	387826606
13	NC_017426	AT	3	6	6543	6548	50 %	50 %	0 %	0 %	387826606
14	NC_017426	AC	3	6	7051	7056	50 %	0 %	0 %	50 %	387826607
15	NC_017426	TA	3	6	7499	7504	50 %	50 %	0 %	0 %	387826607
16	NC_017426	AG	3	6	9170	9175	50 %	0 %	50 %	0 %	387826611
17	NC_017426	AT	3	6	9801	9806	50 %	50 %	0 %	0 %	387826611
18	NC_017426	AT	3	6	9930	9935	50 %	50 %	0 %	0 %	387826611
19	NC_017426	TA	3	6	10179	10184	50 %	50 %	0 %	0 %	387826611
20	NC_017426	TA	3	6	10692	10697	50 %	50 %	0 %	0 %	387826612
21	NC_017426	AT	3	6	11222	11227	50 %	50 %	0 %	0 %	387826613
22	NC_017426	AT	4	8	11537	11544	50 %	50 %	0 %	0 %	387826613
23	NC_017426	AC	3	6	11730	11735	50 %	0 %	0 %	50 %	387826613
24	NC_017426	AC	3	6	11745	11750	50 %	0 %	0 %	50 %	387826613
25	NC_017426	CA	3	6	12113	12118	50 %	0 %	0 %	50 %	387826614
26	NC_017426	TA	3	6	12236	12241	50 %	50 %	0 %	0 %	387826614
27	NC_017426	AT	3	6	12557	12562	50 %	50 %	0 %	0 %	387826615
28	NC_017426	CA	3	6	12788	12793	50 %	0 %	0 %	50 %	387826615
29	NC_017426	AT	3	6	13185	13190	50 %	50 %	0 %	0 %	387826616
30	NC_017426	AT	3	6	13870	13875	50 %	50 %	0 %	0 %	387826617
31	NC_017426	TA	3	6	15092	15097	50 %	50 %	0 %	0 %	387826618
32	NC_017426	AT	3	6	15111	15116	50 %	50 %	0 %	0 %	387826618
33	NC_017426	TA	3	6	15179	15184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017426	AT	3	6	15494	15499	50 %	50 %	0 %	0 %	387826620
35	NC_017426	AT	3	6	15904	15909	50 %	50 %	0 %	0 %	387826621
36	NC_017426	AT	3	6	16072	16077	50 %	50 %	0 %	0 %	387826621
37	NC_017426	AT	3	6	16377	16382	50 %	50 %	0 %	0 %	387826622
38	NC_017426	AT	3	6	16604	16609	50 %	50 %	0 %	0 %	387826623
39	NC_017426	AT	3	6	16782	16787	50 %	50 %	0 %	0 %	387826623
40	NC_017426	AT	3	6	17010	17015	50 %	50 %	0 %	0 %	387826623
41	NC_017426	TA	3	6	18873	18878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017426	GA	3	6	19216	19221	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017426	TA	3	6	20826	20831	50 %	50 %	0 %	0 %	387826627
44	NC_017426	AT	3	6	21607	21612	50 %	50 %	0 %	0 %	387826628
45	NC_017426	AT	3	6	22417	22422	50 %	50 %	0 %	0 %	387826630
46	NC_017426	AT	3	6	22504	22509	50 %	50 %	0 %	0 %	387826630
47	NC_017426	AT	3	6	22591	22596	50 %	50 %	0 %	0 %	387826630
48	NC_017426	AT	3	6	22645	22650	50 %	50 %	0 %	0 %	387826630
49	NC_017426	AT	3	6	22699	22704	50 %	50 %	0 %	0 %	387826630
50	NC_017426	AT	3	6	22753	22758	50 %	50 %	0 %	0 %	387826630
51	NC_017426	TA	4	8	23391	23398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017426	TA	3	6	23547	23552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017426	AT	3	6	24734	24739	50 %	50 %	0 %	0 %	387826631
54	NC_017426	AT	3	6	25122	25127	50 %	50 %	0 %	0 %	387826632
55	NC_017426	GA	3	6	25563	25568	50 %	0 %	50 %	0 %	387826633
56	NC_017426	TA	3	6	25817	25822	50 %	50 %	0 %	0 %	387826633
57	NC_017426	AT	3	6	26235	26240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017426	AT	3	6	26396	26401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017426	GA	3	6	26471	26476	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017426	TA	3	6	26543	26548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017426	GA	3	6	27257	27262	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017426	TA	3	6	28300	28305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017426	TA	3	6	28440	28445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017426	CT	3	6	28446	28451	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017426	TA	3	6	28464	28469	50 %	50 %	0 %	0 %	387826636
66	NC_017426	TG	3	6	29274	29279	0 %	50 %	50 %	0 %	387826637
67	NC_017426	AT	3	6	29616	29621	50 %	50 %	0 %	0 %	387826637
68	NC_017426	AT	3	6	29800	29805	50 %	50 %	0 %	0 %	387826638
69	NC_017426	AT	3	6	30140	30145	50 %	50 %	0 %	0 %	387826638
70	NC_017426	AG	3	6	31044	31049	50 %	0 %	50 %	0 %	387826638

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.