MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-8

Total Repeats: 114

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017426	T	6	6	135	140	0 %	100 %	0 %	0 %	387826597
2	NC_017426	T	6	6	629	634	0 %	100 %	0 %	0 %	387826597
3	NC_017426	T	6	6	749	754	0 %	100 %	0 %	0 %	387826597
4	NC_017426	A	6	6	1791	1796	100 %	0 %	0 %	0 %	387826598
5	NC_017426	T	6	6	2141	2146	0 %	100 %	0 %	0 %	387826599
6	NC_017426	T	6	6	3501	3506	0 %	100 %	0 %	0 %	387826601
7	NC_017426	A	6	6	4093	4098	100 %	0 %	0 %	0 %	387826602
8	NC_017426	A	6	6	4507	4512	100 %	0 %	0 %	0 %	387826602
9	NC_017426	A	6	6	5224	5229	100 %	0 %	0 %	0 %	387826603
10	NC_017426	G	6	6	5295	5300	0 %	0 %	100 %	0 %	387826603
11	NC_017426	T	6	6	6955	6960	0 %	100 %	0 %	0 %	387826607
12	NC_017426	A	7	7	7027	7033	100 %	0 %	0 %	0 %	387826607
13	NC_017426	T	8	8	7149	7156	0 %	100 %	0 %	0 %	387826607
14	NC_017426	A	6	6	7504	7509	100 %	0 %	0 %	0 %	387826607
15	NC_017426	A	6	6	8232	8237	100 %	0 %	0 %	0 %	387826608
16	NC_017426	A	6	6	8576	8581	100 %	0 %	0 %	0 %	387826609
17	NC_017426	A	7	7	8781	8787	100 %	0 %	0 %	0 %	387826610
18	NC_017426	A	7	7	8868	8874	100 %	0 %	0 %	0 %	387826610
19	NC_017426	A	6	6	9022	9027	100 %	0 %	0 %	0 %	387826611
20	NC_017426	A	6	6	9074	9079	100 %	0 %	0 %	0 %	387826611
21	NC_017426	A	6	6	9131	9136	100 %	0 %	0 %	0 %	387826611
22	NC_017426	A	6	6	9206	9211	100 %	0 %	0 %	0 %	387826611
23	NC_017426	A	6	6	9470	9475	100 %	0 %	0 %	0 %	387826611
24	NC_017426	A	8	8	9887	9894	100 %	0 %	0 %	0 %	387826611
25	NC_017426	A	6	6	10159	10164	100 %	0 %	0 %	0 %	387826611
26	NC_017426	A	6	6	10361	10366	100 %	0 %	0 %	0 %	387826612
27	NC_017426	A	6	6	10374	10379	100 %	0 %	0 %	0 %	387826612
28	NC_017426	T	6	6	10471	10476	0 %	100 %	0 %	0 %	387826612
29	NC_017426	T	6	6	10529	10534	0 %	100 %	0 %	0 %	387826612
30	NC_017426	A	7	7	11247	11253	100 %	0 %	0 %	0 %	387826613
31	NC_017426	A	6	6	12118	12123	100 %	0 %	0 %	0 %	387826614
32	NC_017426	A	6	6	12708	12713	100 %	0 %	0 %	0 %	387826615
33	NC_017426	T	8	8	12799	12806	0 %	100 %	0 %	0 %	387826615
34	NC_017426	T	7	7	13029	13035	0 %	100 %	0 %	0 %	387826616
35	NC_017426	T	6	6	13524	13529	0 %	100 %	0 %	0 %	387826616
36	NC_017426	A	8	8	13632	13639	100 %	0 %	0 %	0 %	387826616
37	NC_017426	A	6	6	13717	13722	100 %	0 %	0 %	0 %	387826616
38	NC_017426	T	6	6	13905	13910	0 %	100 %	0 %	0 %	387826617
39	NC_017426	A	6	6	14143	14148	100 %	0 %	0 %	0 %	387826617
40	NC_017426	G	6	6	14329	14334	0 %	0 %	100 %	0 %	387826617
41	NC_017426	T	6	6	14485	14490	0 %	100 %	0 %	0 %	387826618
42	NC_017426	A	6	6	14760	14765	100 %	0 %	0 %	0 %	387826618
43	NC_017426	A	7	7	15021	15027	100 %	0 %	0 %	0 %	387826618
44	NC_017426	A	6	6	15099	15104	100 %	0 %	0 %	0 %	387826618
45	NC_017426	A	7	7	15223	15229	100 %	0 %	0 %	0 %	387826619
46	NC_017426	A	7	7	15418	15424	100 %	0 %	0 %	0 %	387826619
47	NC_017426	A	6	6	15659	15664	100 %	0 %	0 %	0 %	387826620
48	NC_017426	A	7	7	15698	15704	100 %	0 %	0 %	0 %	387826620
49	NC_017426	T	6	6	15889	15894	0 %	100 %	0 %	0 %	387826621
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51	NC_017426	A	6	6	17425	17430	100 %	0 %	0 %	0 %	387826624
52	NC_017426	A	6	6	17544	17549	100 %	0 %	0 %	0 %	387826624
53	NC_017426	A	6	6	17694	17699	100 %	0 %	0 %	0 %	387826624
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55	NC_017426	T	6	6	17979	17984	0 %	100 %	0 %	0 %	387826625
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60	NC_017426	A	6	6	19249	19254	100 %	0 %	0 %	0 %	387826626
61	NC_017426	A	6	6	19322	19327	100 %	0 %	0 %	0 %	387826626
62	NC_017426	A	6	6	19526	19531	100 %	0 %	0 %	0 %	387826626
63	NC_017426	A	6	6	19570	19575	100 %	0 %	0 %	0 %	387826626
64	NC_017426	A	7	7	19843	19849	100 %	0 %	0 %	0 %	387826626
65	NC_017426	A	7	7	19858	19864	100 %	0 %	0 %	0 %	387826626
66	NC_017426	A	8	8	19884	19891	100 %	0 %	0 %	0 %	387826626
67	NC_017426	A	6	6	19919	19924	100 %	0 %	0 %	0 %	387826626
68	NC_017426	A	7	7	20149	20155	100 %	0 %	0 %	0 %	387826626
69	NC_017426	A	7	7	20269	20275	100 %	0 %	0 %	0 %	387826626
70	NC_017426	A	6	6	20278	20283	100 %	0 %	0 %	0 %	387826626
71	NC_017426	A	6	6	20365	20370	100 %	0 %	0 %	0 %	387826627
72	NC_017426	A	6	6	20492	20497	100 %	0 %	0 %	0 %	387826627
73	NC_017426	T	6	6	20598	20603	0 %	100 %	0 %	0 %	387826627
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87	NC_017426	A	6	6	22182	22187	100 %	0 %	0 %	0 %	387826629
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102	NC_017426	A	7	7	26813	26819	100 %	0 %	0 %	0 %	387826634
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104	NC_017426	A	7	7	27275	27281	100 %	0 %	0 %	0 %	387826635
105	NC_017426	A	6	6	27351	27356	100 %	0 %	0 %	0 %	387826635
106	NC_017426	A	7	7	27448	27454	100 %	0 %	0 %	0 %	387826635
107	NC_017426	A	8	8	27762	27769	100 %	0 %	0 %	0 %	387826635
108	NC_017426	A	6	6	28199	28204	100 %	0 %	0 %	0 %	387826635
109	NC_017426	A	6	6	28511	28516	100 %	0 %	0 %	0 %	387826636
110	NC_017426	A	7	7	28561	28567	100 %	0 %	0 %	0 %	387826636
111	NC_017426	A	6	6	28661	28666	100 %	0 %	0 %	0 %	387826636
112	NC_017426	A	8	8	29557	29564	100 %	0 %	0 %	0 %	387826637
113	NC_017426	A	6	6	29668	29673	100 %	0 %	0 %	0 %	387826637
114	NC_017426	A	7	7	29878	29884	100 %	0 %	0 %	0 %	387826638

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.