MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-6

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017425	ATTT	3	12	573	584	25 %	75 %	0 %	0 %	387826554
2	NC_017425	ATTA	2	8	944	951	50 %	50 %	0 %	0 %	387826554
3	NC_017425	GTTC	2	8	1677	1684	0 %	50 %	25 %	25 %	387826555
4	NC_017425	ATAC	2	8	1928	1935	50 %	25 %	0 %	25 %	387826555
5	NC_017425	AAGA	2	8	2380	2387	75 %	0 %	25 %	0 %	387826556
6	NC_017425	ATTT	2	8	2516	2523	25 %	75 %	0 %	0 %	387826556
7	NC_017425	GCAA	2	8	2676	2683	50 %	0 %	25 %	25 %	387826557
8	NC_017425	ATGT	2	8	3014	3021	25 %	50 %	25 %	0 %	387826557
9	NC_017425	GTAT	2	8	3039	3046	25 %	50 %	25 %	0 %	387826557
10	NC_017425	ATAA	2	8	3121	3128	75 %	25 %	0 %	0 %	387826557
11	NC_017425	CAAT	2	8	3203	3210	50 %	25 %	0 %	25 %	387826557
12	NC_017425	TAAA	2	8	3362	3369	75 %	25 %	0 %	0 %	387826558
13	NC_017425	TTTA	2	8	3889	3896	25 %	75 %	0 %	0 %	387826558
14	NC_017425	AGTA	2	8	4782	4789	50 %	25 %	25 %	0 %	387826559
15	NC_017425	CTAC	2	8	4794	4801	25 %	25 %	0 %	50 %	387826559
16	NC_017425	TCAT	2	8	4841	4848	25 %	50 %	0 %	25 %	387826559
17	NC_017425	TACT	2	8	5150	5157	25 %	50 %	0 %	25 %	387826560
18	NC_017425	AATG	2	8	5396	5403	50 %	25 %	25 %	0 %	387826560
19	NC_017425	AAGT	2	8	6061	6068	50 %	25 %	25 %	0 %	387826562
20	NC_017425	AATT	2	8	6555	6562	50 %	50 %	0 %	0 %	387826563
21	NC_017425	TAAT	2	8	6602	6609	50 %	50 %	0 %	0 %	387826563
22	NC_017425	TTTA	2	8	6998	7005	25 %	75 %	0 %	0 %	387826564
23	NC_017425	AGAA	2	8	7219	7226	75 %	0 %	25 %	0 %	387826564
24	NC_017425	CAAG	2	8	7292	7299	50 %	0 %	25 %	25 %	387826564
25	NC_017425	TAGA	2	8	7644	7651	50 %	25 %	25 %	0 %	387826564
26	NC_017425	CAAA	2	8	8244	8251	75 %	0 %	0 %	25 %	387826565
27	NC_017425	ATTT	2	8	8494	8501	25 %	75 %	0 %	0 %	387826566
28	NC_017425	TGAG	2	8	8598	8605	25 %	25 %	50 %	0 %	387826566
29	NC_017425	CTTG	2	8	8796	8803	0 %	50 %	25 %	25 %	387826567
30	NC_017425	AATT	2	8	8942	8949	50 %	50 %	0 %	0 %	387826567
31	NC_017425	TATG	2	8	9454	9461	25 %	50 %	25 %	0 %	387826568
32	NC_017425	AAAT	2	8	9484	9491	75 %	25 %	0 %	0 %	387826568
33	NC_017425	AGGG	2	8	9672	9679	25 %	0 %	75 %	0 %	387826568
34	NC_017425	AGGG	2	8	9879	9886	25 %	0 %	75 %	0 %	387826568
35	NC_017425	TAGT	2	8	10200	10207	25 %	50 %	25 %	0 %	387826568
36	NC_017425	AGAA	2	8	10395	10402	75 %	0 %	25 %	0 %	387826569
37	NC_017425	CTTT	2	8	10706	10713	0 %	75 %	0 %	25 %	387826569
38	NC_017425	TAAT	2	8	10955	10962	50 %	50 %	0 %	0 %	387826569
39	NC_017425	ATTC	2	8	11668	11675	25 %	50 %	0 %	25 %	387826570
40	NC_017425	TCAA	2	8	12175	12182	50 %	25 %	0 %	25 %	387826571
41	NC_017425	AATT	2	8	12448	12455	50 %	50 %	0 %	0 %	387826571
42	NC_017425	TAAT	2	8	13009	13016	50 %	50 %	0 %	0 %	387826573
43	NC_017425	AAAC	2	8	14091	14098	75 %	0 %	0 %	25 %	387826574
44	NC_017425	TAAT	2	8	14628	14635	50 %	50 %	0 %	0 %	387826575
45	NC_017425	TCTA	2	8	14710	14717	25 %	50 %	0 %	25 %	387826575
46	NC_017425	AATA	2	8	15630	15637	75 %	25 %	0 %	0 %	387826577
47	NC_017425	TCAA	2	8	15665	15672	50 %	25 %	0 %	25 %	387826577
48	NC_017425	CTAT	2	8	15749	15756	25 %	50 %	0 %	25 %	387826577
49	NC_017425	AATA	2	8	15765	15772	75 %	25 %	0 %	0 %	387826577
50	NC_017425	TAAC	2	8	15819	15826	50 %	25 %	0 %	25 %	387826578
51	NC_017425	ATAG	2	8	16838	16845	50 %	25 %	25 %	0 %	387826580
52	NC_017425	ATAG	2	8	16892	16899	50 %	25 %	25 %	0 %	387826580
53	NC_017425	ATAG	2	8	16925	16932	50 %	25 %	25 %	0 %	387826580
54	NC_017425	ATAG	2	8	16958	16965	50 %	25 %	25 %	0 %	387826580
55	NC_017425	CTTG	2	8	18276	18283	0 %	50 %	25 %	25 %	387826582
56	NC_017425	TTTG	2	8	18772	18779	0 %	75 %	25 %	0 %	387826582
57	NC_017425	AAGA	3	12	19634	19645	75 %	0 %	25 %	0 %	387826583
58	NC_017425	AAAT	2	8	19788	19795	75 %	25 %	0 %	0 %	387826583
59	NC_017425	TAAA	2	8	19814	19821	75 %	25 %	0 %	0 %	387826583
60	NC_017425	AGAA	2	8	19874	19881	75 %	0 %	25 %	0 %	387826583
61	NC_017425	CAAA	2	8	19884	19891	75 %	0 %	0 %	25 %	387826583
62	NC_017425	TTTA	2	8	20748	20755	25 %	75 %	0 %	0 %	387826584
63	NC_017425	TCAA	2	8	20868	20875	50 %	25 %	0 %	25 %	387826585
64	NC_017425	TGTA	2	8	21764	21771	25 %	50 %	25 %	0 %	387826586
65	NC_017425	AAAG	2	8	22015	22022	75 %	0 %	25 %	0 %	387826586
66	NC_017425	ATAG	2	8	22492	22499	50 %	25 %	25 %	0 %	387826587
67	NC_017425	AGAT	2	8	22511	22518	50 %	25 %	25 %	0 %	387826587
68	NC_017425	ATAG	2	8	22546	22553	50 %	25 %	25 %	0 %	387826587
69	NC_017425	ATAG	2	8	22579	22586	50 %	25 %	25 %	0 %	387826587
70	NC_017425	ATAG	2	8	22633	22640	50 %	25 %	25 %	0 %	387826587
71	NC_017425	AGAT	2	8	22652	22659	50 %	25 %	25 %	0 %	387826587
72	NC_017425	ATAG	2	8	22708	22715	50 %	25 %	25 %	0 %	387826587
73	NC_017425	AAAT	2	8	22760	22767	75 %	25 %	0 %	0 %	387826587
74	NC_017425	TAAG	2	8	23493	23500	50 %	25 %	25 %	0 %	387826588
75	NC_017425	AAAC	2	8	23578	23585	75 %	0 %	0 %	25 %	387826588
76	NC_017425	AATC	2	8	24365	24372	50 %	25 %	0 %	25 %	387826588
77	NC_017425	AGAT	2	8	24589	24596	50 %	25 %	25 %	0 %	387826588
78	NC_017425	TAAA	2	8	25327	25334	75 %	25 %	0 %	0 %	387826590
79	NC_017425	ACCA	2	8	25696	25703	50 %	0 %	0 %	50 %	387826590
80	NC_017425	GAAT	2	8	26594	26601	50 %	25 %	25 %	0 %	387826591
81	NC_017425	TAAA	2	8	29259	29266	75 %	25 %	0 %	0 %	387826594
82	NC_017425	CAAG	2	8	29284	29291	50 %	0 %	25 %	25 %	387826594
83	NC_017425	AATT	2	8	29305	29312	50 %	50 %	0 %	0 %	387826594
84	NC_017425	CAAA	2	8	29464	29471	75 %	0 %	0 %	25 %	387826595
85	NC_017425	AAAT	2	8	29502	29509	75 %	25 %	0 %	0 %	387826595
86	NC_017425	AATT	2	8	29553	29560	50 %	50 %	0 %	0 %	387826595
87	NC_017425	TAGC	2	8	29660	29667	25 %	25 %	25 %	25 %	387826595
88	NC_017425	TGAT	2	8	29867	29874	25 %	50 %	25 %	0 %	387826595
89	NC_017425	AGCA	2	8	30228	30235	50 %	0 %	25 %	25 %	387826595
90	NC_017425	AAAT	2	8	30254	30261	75 %	25 %	0 %	0 %	387826595

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.