MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-6

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017425	T	6	6	135	140	0 %	100 %	0 %	0 %	387826554
2	NC_017425	T	6	6	629	634	0 %	100 %	0 %	0 %	387826554
3	NC_017425	T	6	6	749	754	0 %	100 %	0 %	0 %	387826554
4	NC_017425	A	6	6	1791	1796	100 %	0 %	0 %	0 %	387826555
5	NC_017425	T	6	6	2141	2146	0 %	100 %	0 %	0 %	387826556
6	NC_017425	T	6	6	3501	3506	0 %	100 %	0 %	0 %	387826558
7	NC_017425	A	6	6	4093	4098	100 %	0 %	0 %	0 %	387826559
8	NC_017425	A	6	6	4507	4512	100 %	0 %	0 %	0 %	387826559
9	NC_017425	A	6	6	5224	5229	100 %	0 %	0 %	0 %	387826560
10	NC_017425	G	6	6	5295	5300	0 %	0 %	100 %	0 %	387826560
11	NC_017425	T	6	6	6955	6960	0 %	100 %	0 %	0 %	387826564
12	NC_017425	A	7	7	7027	7033	100 %	0 %	0 %	0 %	387826564
13	NC_017425	T	8	8	7149	7156	0 %	100 %	0 %	0 %	387826564
14	NC_017425	A	6	6	7504	7509	100 %	0 %	0 %	0 %	387826564
15	NC_017425	A	6	6	8232	8237	100 %	0 %	0 %	0 %	387826565
16	NC_017425	A	6	6	8576	8581	100 %	0 %	0 %	0 %	387826566
17	NC_017425	A	7	7	8781	8787	100 %	0 %	0 %	0 %	387826567
18	NC_017425	A	7	7	8868	8874	100 %	0 %	0 %	0 %	387826567
19	NC_017425	A	6	6	9022	9027	100 %	0 %	0 %	0 %	387826568
20	NC_017425	A	6	6	9074	9079	100 %	0 %	0 %	0 %	387826568
21	NC_017425	A	6	6	9131	9136	100 %	0 %	0 %	0 %	387826568
22	NC_017425	A	6	6	9206	9211	100 %	0 %	0 %	0 %	387826568
23	NC_017425	A	6	6	9470	9475	100 %	0 %	0 %	0 %	387826568
24	NC_017425	A	8	8	9887	9894	100 %	0 %	0 %	0 %	387826568
25	NC_017425	A	6	6	10159	10164	100 %	0 %	0 %	0 %	387826568
26	NC_017425	A	6	6	10361	10366	100 %	0 %	0 %	0 %	387826569
27	NC_017425	A	6	6	10374	10379	100 %	0 %	0 %	0 %	387826569
28	NC_017425	T	6	6	10471	10476	0 %	100 %	0 %	0 %	387826569
29	NC_017425	T	6	6	10529	10534	0 %	100 %	0 %	0 %	387826569
30	NC_017425	A	7	7	11247	11253	100 %	0 %	0 %	0 %	387826570
31	NC_017425	A	6	6	12118	12123	100 %	0 %	0 %	0 %	387826571
32	NC_017425	A	6	6	12708	12713	100 %	0 %	0 %	0 %	387826572
33	NC_017425	T	8	8	12799	12806	0 %	100 %	0 %	0 %	387826572
34	NC_017425	T	7	7	13029	13035	0 %	100 %	0 %	0 %	387826573
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36	NC_017425	A	8	8	13632	13639	100 %	0 %	0 %	0 %	387826573
37	NC_017425	A	6	6	13717	13722	100 %	0 %	0 %	0 %	387826573
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39	NC_017425	A	6	6	14143	14148	100 %	0 %	0 %	0 %	387826574
40	NC_017425	G	6	6	14329	14334	0 %	0 %	100 %	0 %	387826574
41	NC_017425	T	6	6	14485	14490	0 %	100 %	0 %	0 %	387826575
42	NC_017425	A	6	6	14760	14765	100 %	0 %	0 %	0 %	387826575
43	NC_017425	A	7	7	15021	15027	100 %	0 %	0 %	0 %	387826575
44	NC_017425	A	6	6	15099	15104	100 %	0 %	0 %	0 %	387826575
45	NC_017425	A	7	7	15223	15229	100 %	0 %	0 %	0 %	387826576
46	NC_017425	A	7	7	15418	15424	100 %	0 %	0 %	0 %	387826576
47	NC_017425	A	6	6	15659	15664	100 %	0 %	0 %	0 %	387826577
48	NC_017425	A	7	7	15698	15704	100 %	0 %	0 %	0 %	387826577
49	NC_017425	T	6	6	15889	15894	0 %	100 %	0 %	0 %	387826578
50	NC_017425	A	7	7	16395	16401	100 %	0 %	0 %	0 %	387826579
51	NC_017425	A	7	7	17278	17284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017425	A	6	6	17371	17376	100 %	0 %	0 %	0 %	387826581
53	NC_017425	A	6	6	17496	17501	100 %	0 %	0 %	0 %	387826581
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61	NC_017425	T	6	6	18605	18610	0 %	100 %	0 %	0 %	387826582
62	NC_017425	A	6	6	18872	18877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017425	T	6	6	18940	18945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017425	T	7	7	19099	19105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017425	A	6	6	19276	19281	100 %	0 %	0 %	0 %	387826583
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71	NC_017425	A	6	6	20146	20151	100 %	0 %	0 %	0 %	387826583
72	NC_017425	A	6	6	20226	20231	100 %	0 %	0 %	0 %	387826583
73	NC_017425	A	7	7	20234	20240	100 %	0 %	0 %	0 %	387826583
74	NC_017425	A	7	7	20322	20328	100 %	0 %	0 %	0 %	387826584
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82	NC_017425	A	7	7	21176	21182	100 %	0 %	0 %	0 %	387826585
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90	NC_017425	A	6	6	22721	22726	100 %	0 %	0 %	0 %	387826587
91	NC_017425	A	6	6	22773	22778	100 %	0 %	0 %	0 %	387826587
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103	NC_017425	A	6	6	24179	24184	100 %	0 %	0 %	0 %	387826588
104	NC_017425	A	7	7	24449	24455	100 %	0 %	0 %	0 %	387826588
105	NC_017425	A	6	6	24691	24696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017425	A	7	7	24699	24705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017425	A	6	6	25064	25069	100 %	0 %	0 %	0 %	387826589
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111	NC_017425	T	7	7	25473	25479	0 %	100 %	0 %	0 %	387826590
112	NC_017425	T	7	7	25564	25570	0 %	100 %	0 %	0 %	387826590
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119	NC_017425	A	7	7	26989	26995	100 %	0 %	0 %	0 %	387826591
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122	NC_017425	A	8	8	27485	27492	100 %	0 %	0 %	0 %	387826592
123	NC_017425	A	7	7	27506	27512	100 %	0 %	0 %	0 %	387826592
124	NC_017425	A	7	7	27627	27633	100 %	0 %	0 %	0 %	387826592
125	NC_017425	A	6	6	27664	27669	100 %	0 %	0 %	0 %	387826592
126	NC_017425	A	6	6	27740	27745	100 %	0 %	0 %	0 %	387826592
127	NC_017425	A	6	6	27747	27752	100 %	0 %	0 %	0 %	387826592
128	NC_017425	A	7	7	27761	27767	100 %	0 %	0 %	0 %	387826592
129	NC_017425	A	6	6	28020	28025	100 %	0 %	0 %	0 %	387826592
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131	NC_017425	A	7	7	28280	28286	100 %	0 %	0 %	0 %	387826593
132	NC_017425	A	6	6	28380	28385	100 %	0 %	0 %	0 %	387826593
133	NC_017425	A	7	7	28495	28501	100 %	0 %	0 %	0 %	387826593
134	NC_017425	A	8	8	29276	29283	100 %	0 %	0 %	0 %	387826594
135	NC_017425	A	6	6	29387	29392	100 %	0 %	0 %	0 %	387826594

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.