MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-10

Total Repeats: 16

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017424	TAGAAA	2	12	598	609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387827799
2	NC_017424	CTGATA	2	12	2989	3000	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387827801
3	NC_017424	GATAAA	2	12	4484	4495	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387827803
4	NC_017424	GAATTT	2	12	5208	5219	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387827804
5	NC_017424	TGAACT	2	12	5246	5257	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387827804
6	NC_017424	ACAGAA	2	12	13777	13788	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387827818
7	NC_017424	TAATGA	2	12	17306	17317	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387827825
8	NC_017424	CAAAAA	2	12	17556	17567	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	387827825
9	NC_017424	ATGGGA	2	12	17707	17718	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	387827825
10	NC_017424	ATATTG	2	12	21118	21129	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387827829
11	NC_017424	TAAAAA	2	12	21457	21468	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387827829
12	NC_017424	TAGTGT	2	12	24614	24625	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387827832
13	NC_017424	ACAAGA	2	12	26704	26715	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387827835
14	NC_017424	AGAAAA	2	12	26740	26751	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387827835
15	NC_017424	AAGATA	2	12	27285	27296	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387827835
16	NC_017424	AAAGCA	2	12	28765	28776	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387827837

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.